第一章必修之外，此後便可以按照自己的體質，繼續修煉最適合自己的一章心法。到最後究竟能修成幾章，則各人均有不同。
九陽神功，依陰陽，化五行，將真氣分儲九處大穴竅，分為九道真氣使用，牽引陽火真氣，依次貫通心坎穴、丹田穴、足陽明胃經、足太陽**經、手太陽小腸經、手少陽三焦經、脊梁穴、至陽穴，以至頭頂天靈蓋的百會穴。
從第一陽至第九陽，修煉者的功力由低至高，循序漸進。至九陽全部修煉圓滿之後，就統合九陽之氣，融合歸一。稱為“九陽歸一”境界，可堪比擬易筋經黑級三間戰紋修為。
一生二、二生三、三而更生九陽。陽火真氣，循環不休，生陽不止。故此，九陽歸一之後，修為者功力若再有精進，便能到達“九陽啟泰”境界，相當於易筋經黑級兩間戰紋水準。
佛家神功易筋經，功成黑級浮屠，全身上下也變成容氣之所，可以吸取宇宙之氣，化為己用，修為越高，所吸力量越強， 生生不息，無窮無盡。
九陽神功也不遑多讓。但並非吸取宇宙之氣化為己用，卻是抽取太陽真火的能量。力量同樣堪稱無限。 當吸取太陽真火到達一個極限的時候，修煉者便能再度精進，突破九陽啟泰極限，稱之為“九陽究極”，和易筋經黑級一間戰紋難分上下。
至於九陰真經，同樣也是引動天地之力增強自身，卻並非抽取太陽真火或者宇宙之氣，而是吸取星力。
道家所謂九星，分別是：一白水星、二黑土星、三碧木星、四綠木星、五黃土星、六白金星、七赤金星、八白土星、九紫火星。
九陰真經上卷，分為九章心訣的不同修煉方法，按照人體八脈，再加上天靈一竅，各依九宮分布，凝成九星氣穴。合共就有九章心法。此乃九陰歸元之數，取天地之道，化有限為無限。
九陰真經博大精深，威力可說是無限。但在實際修煉過程中，由於修煉者本身的資質和智慧各有不同，故此並不必循序漸進。
修煉者除去入門階段的第一章必修之外，此後便可以按照自己的體質，繼續修煉最適合自己的一章心法。到最後究竟能修成幾章，則各人均有不同。
九陰真經第一章，天靈竅。天靈乃人體主竅，屬九宮星之中宮黃土星。
修煉天靈一竅，選九宮方陣中位，練時五心朝天，依功訣運氣。待體內生聚清純元氣，直衝天靈，便引之循環，以九大周天為一課。持之以恒，可達養生長壽之效，內力與日俱增，已非一般氣功可比。
九陰真經第二章，頭竅陰。頭竅陰位於耳背乳突的後上方，屬九宮星之乾宮白金星。
修煉者開通天靈之後，雖然內力增長。但假如用不得其法，便隻會白白浪費真氣。修練此章，能夠控製氣量大小，經脈伸縮，竅孔收放，提升內力吞吐的準確度。故此，這一章又名“禦氣章”。
九陰真經第三章，足竅陰。位於足下接近湧泉穴的部位，與頭竅陰相連，天地貫通一氣。屬九宮星之坎宮白水星。
修練此章，能幫助血氣通暢，化寒毒、驅風邪，有傷療傷，有病去病，勝服靈丹妙藥。修為高深者，更可續骨生肌，修補筋脈，療效如神。故此，這一章又名“療傷章”。
九陰真經第四章，手太陰肺經。就是由胸前第一肋骨間隙的中府穴，連接通往拇指指端的少商穴。屬於九宮星之艮宮白土星。
修練此章，能固本培元，益精強氣，令內力渾厚綿長。長久修煉，能令內力如海量汪涵，一納千鬥，一吐千鈞。故此，這一章又名“培氣章”。
九陰真經第五章，足太陰脾經。起於足大趾末端的隱白穴，上通至胸前第六跳肋骨間隙的大包穴。屬於九宮星之震宮碧木星。
修練此章，具強健體魄之效，練之有道，抗擊力大增，足可媲美一般外家硬氣功。修為高深者，髒腑硬如磐石，筋肌堅如金鐵，體格壯如不壞。故此，這一章又名“健體章”。
九陰真經第六章，手少陰心經。從腋窩極泉穴，下通小指末端的少衝穴。屬於九宮星之巽宮綠木星。
修練此章，由於經脈上行繁於目係，氣清形諸於雙瞳。故而修為高深者，目光藏神，視力鋒銳，精華內斂。可大幅度增強視力。也因此，這一章又名“明目章”。
九陰真經第七章，足少陰腎經。自足心湧泉穴，連至鎖骨下方的俞府穴，屬於九宮星之離宮紫火星。
修練此章，真氣貫通左右耳鼓，聽力數以倍增。百步之外，落針可聞，方圓十裏，別人鼻息儼如雷響。修為高深者，暴雨中可分辨每串水滴，風沙中能細聆每粒沙磨。故此，這一章又名“聰耳章”。
九陰真經第八章，手厥陰心包經。起於腋下三寸處的天池穴，止於中指末端的中衝穴。屬於九宮星之坤宮黑土星。
修練此章，能刺激靈覺澄明，增強悟性，沉空定慧，神思敏捷。修練此章時，極易出現百象從生、神遊物外的虛幻之感。故需抱元守一，切忌妄加雜念。長久修持，能令意誌堅定，再進一步凝聚成神念。修練到極高深時，更能以元神出遊。故此，這一章又名“通靈章”。
九陰真經第九章，足厥陰肝經。由足大趾的大敦穴，通往乳下第六肋間的期門穴。屬於九宮星之兌宮赤金星。
修練此章者，氣穴催行，能有助全身筋腱柔韌，身手倍為靈活。修煉高深者，能登萍踏水，行雲馭風，一葦渡江，亦作等閑。故此，這一章又名“活絡章”。
九陰真經九章圓滿之後，還有一個最高境界，稱之為“九陰歸元”。這就相當於易筋經黑級浮屠。不過，黑級浮屠還分為三個小境界。而九陰歸元則並無如此詳細劃分。
故此，修煉九陰歸元的難度之大，可想而知。事實上，九陰歸元境界的修煉難度，甚至更超過了修煉者從第一章修練至第九章的難度。古往今來，除黃裳本人以外，還從來未曾有人，可以練得成九陰歸元。
傳說當中，黃裳就是修練至九陰歸元的巔峰，才終於得道成仙，羽化飛升的。雖然飛升之事，虛無縹緲，令人難以入信。但毫無疑問，九陰真經是一套決不下於易筋經、九陽神功、或者九霄真經的絕頂武學。
九陰真經下卷，共有九大奇招。其中有一些，是當年黃裳的對頭所使用，被他兼容並蓄地記錄下來。另外一些，則是黃裳自己所創。不過自從黃裳飛升之後，九陰真經下卷流散四方，始終不曾完整出世。
所以世人所知的真經武功，就隻有兩門。一是九陰白骨爪，又稱為摧堅神爪。攻人首腦，催摧腐土。二是降魔大手印，掌勁擊在敵人身上，外無傷痕，內裏五髒俱碎。
百餘年前，九陰真經上卷出世，引發江湖中人無窮無盡的爭奪仇殺。腥風血雨，無日無之。後來王重陽終於看不過去，出手奪取了九陰真經。
當時這位全真教創教真人，還未創出九陽神功。但他憑著早年所修煉的“先天神罡”，也已經取得了武功天下第一的美名。故此九陰真經落入全真教手裏，便再沒有其他人膽敢前來爭奪囉嗦。江湖風波，總算因此告一段落。
王重陽得到九陰真經之後，自己並沒有修煉。但好奇心所致，依然忍不住翻閱一遍。過目之後再稍加思量，即已全盤豁然領悟。
作為道家大宗師，除去武功修為絕頂之外，，王重陽也精通占星卜相。他夜觀天象，發現蒼狼星降世，將要主宰大地，成皇稱帝。於是再進行了連串推算，認定草原上的蒙古人鐵木真，就是狼星轉世之人。
當時南宋勢力弱小，金國則實力強大，拙拙逼人。王重陽於是就想要扶持狼星轉世者，讓蒙古強大起來，在北方威脅金國，讓南宋能夠得以喘息。
於是，王重陽便遠赴漠北，找到了幼年時候的鐵木真，並且把九陰真經第一章天靈竅的修練心法，以及全真教“北鬥七星劍”以及“星鬥影步”等絕技，分別傳授給鐵木真。
鐵木真雖然出身於蒙古的黃金家族，但從小經曆坎坷。長大之後，也遭遇過多次致命危機，這也是為皇之人，命中必經的劫數。
全靠王重陽所傳授的武功，鐵木真才得以履險如夷，逢凶化吉。不但如此，鐵木真更屢有奇遇。不但得到了神兵蒼狼刀，又有王重陽的師弟周伯通，傳授九陰真經下卷的武學“降魔大手印”。最後甚至把九陰真經九章的心法，逐一修練圓滿。
由於天生體質和命格的關係，鐵木真並沒有把九陰真經修練到九陰歸元，白日飛升的境界。但配合自己血脈中的力量，他卻激發出了令後世為之聞名膽顫的“黃禍”。並且以此橫掃中外，戰無不勝，終於成為“成吉思汗”，威震天下。