[6]　為什麽生物化學總讓人望而卻步？NADPH的全名是個好例子，它叫作還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸，是非常強的還原劑，也就是強力的推電子者。

[7]　嚴格來說，它們在細菌體內並不叫作光係統，而叫作光合單位。然而，細菌的反應單位不管在構造上或功能上，都和植物所有的係統幾無二致，所以我在這裏還是沿用一樣的稱呼。

[8]　紫質症其實是由於紫質在皮膚與器官堆積引起的疾病總稱。大部分的病症都是良性的，但是有時候堆積過多的紫質被光活化後，會造成令人痛苦的灼傷。最惡性的紫質症，比如紅細胞生成性血卟啉症（紫質也稱為卟啉，卟啉是紫質的英文音譯），破壞性極強，會讓耳朵和鼻子都被侵蝕，牙床也被侵蝕，從而讓牙齒突出在外如同獠牙，還會造成皮膚結痂，麵部生長毛發。有些生化學家認為，這些症狀是造成某些民俗傳說的原因，比如吸血鬼與狼人等。他們認為他們是有一些症狀較輕的紫質症患者，因為疾病的痛苦而充滿憤怒，但卻又沒有完全與世隔絕。而現在，惡性紫質症在社會中十分罕見，因為我們會采取預防措施與較佳的治療來避免並發症。除此之外，紫質對光敏感的特性也已經被用在癌症治療上麵，也就是所謂的光動力療法，利用被光活化的紫質去攻擊癌細胞。

[9]　根據艾倫的看法，兩個光係統是在一株藍細菌的祖先體內，應不同的環境需求而分異的。其他人則認為兩個光係統應該是在兩株不同的細菌體內獨自發展，最後才通過某種基因融合作用合並在一起，形成基因嵌合體，也就是現在藍細菌的祖先。最近的研究結果比較支持艾倫的論點（研究結果顯示，光係統是從藍細菌傳給其他細菌，而不是反方向傳回來）。不過現階段遺傳學的證據其實很模糊。不論誰對，兩個光係統都要先獨立運作才能結合。

[10]　根據吉姆·巴伯的看法，現在的放氧複合體就是這樣形成的。如果把複合體從光係統Ⅱ中移走，再把這個“空的”光係統放入帶有錳和鈣離子的溶液中，隻要一些閃光就可以重建這個複合體。每一道閃光都會氧化一個錳離子，一旦氧化之後離子就會就位。經過五六道閃光之後，所有的錳離子和鈣離子就都定位了，整個複合體重建完成。換言之，隻要有適合的蛋白質環境，這個複合體是可以自動組裝的。