當時，拉思伯恩少校和林肯在同一個包廂，布斯射殺林肯的瞬間，拉思伯恩少校一躍而起抓住了刺客。但他沒能製服布斯，因為布斯拚命用刀砍他，在他胳膊上留下了幾道又深又長的傷口。布斯奮力掙脫拉斯伯恩少校的束縛，翻過包廂欄杆，從十二英尺高的地方向舞台上跳去。可是他跳的時候，靴子上的馬刺不巧掛住了總統包廂下麵的旗子，結果整個人笨拙地跌下去，把左腿小骨摔斷了。
一陣疼痛襲遍全身，但他沒有絲毫的畏懼或遲疑，他正扮演著生命中最重要的角色：這將是讓他名垂千古的一幕。
他很快便恢複了意識，揮動匕首，高聲喊著弗吉尼亞州的箴言“永遠打倒專製”，衝過舞台，刺傷一個擋路的樂師，擊倒一個女演員，然後衝出後門，跳上備好的馬匹。他舉起手中的左輪手槍，用槍柄把牽馬的夥計“花生約翰”擊倒在地，然後快馬加鞭，發瘋似的逃跑了，夜色裏，小馬的蹄鐵敲擊著鵝卵石，火花清晰可見。
他馬不停蹄地疾馳兩英裏，穿過了國會區域。等月亮升上樹梢時，他到了阿納卡斯蒂亞橋。這時，聯邦軍隊的哨兵科布中士拿著步槍和刺刀衝出來，喝道：
“你是誰？怎麽這麽晚了還在外麵？你不知道按規定九點之後任何人都不能過橋嗎？”
說來也怪，布斯竟然說出了自己的真名實姓，聲稱自己住在查爾斯縣，這次是來城裏辦事，他一直在等月亮出來好照他回家。
這聽起來沒什麽問題，況且，戰爭已經結束，何必無事自擾呢？於是，科布中士收起步槍，放他過橋。
幾分鍾後，布斯的一個同夥戴維·赫羅爾德，也用類似的借口急匆匆地通過了阿納卡斯蒂亞橋，在約定的地點與布斯會合。接著，兩人在馬裏蘭州南部的夜色裏一起前行，幻想著一到南部，肯定到處都是對他們瘋狂的讚譽和歡呼。
午夜時分，他們在薩拉特維爾一個旅店前停了下來，主人很和善。他們給氣喘籲籲的馬匹喂足水，要來望遠鏡、槍支和彈藥，這些都是薩拉特太太當天下午留下的。他們還喝了足足一美元的威士忌，然後，一邊大談他們刺殺了林肯，一邊消失在夜色中。
他們本打算從這裏直接趕往波托馬克河，這樣，第二天一大早就能抵達，然後再立刻劃船進入弗吉尼亞州。這聽來很容易，如果按計劃來，他們就不會被抓住了。可事與願違，他們也沒預料到布斯的腿會受傷。
那晚，布斯憑借頑強的毅力忍著劇痛在馬上疾馳，每顛簸一下，摔斷的小腿就如他在日記裏所描述的那樣“撕心裂肺地疼”。最後，他再也承受不住這種折磨，便跟赫羅爾德調轉馬頭向東而去。第二天是周六，黎明前，他們在一個鄉村醫生家門口停了下來。這位醫生名叫塞繆爾·A.瑪德，家住華盛頓東南二十英裏的地方。
布斯非常虛弱，疼痛難忍，他甚至無法自己下馬，隻能呻吟著被人從馬鞍上攙下，抬到樓上的臥室。在這個與世隔絕的地方，既沒有電報，也沒有鐵路，因此當地人還沒有聽說總統遇害的消息，醫生也沒有起疑心。布斯的腿是如何受傷的呢？他說是騎馬摔的。瑪德醫生像治療其他骨折病人一樣，對布斯的傷口進行了處理，他先把左腿上的靴子割掉，固定住斷裂的骨頭，然後用帽盒的硬紙板將其綁住。他給布斯做了一個簡單的拐杖，還給了他一隻鞋。
布斯在瑪德醫生家睡了一整天，天色向晚時分，他忍著疼痛挪下床。他什麽也沒吃，刮掉帥氣的胡子後，在肩上圍了一條灰色長圍巾，好讓邊沿遮住右手上名字的首字母文身，以免暴露身份。接著又弄了一副假胡子以作偽裝。他付給醫生25美元，之後，跟赫羅爾德騎上馬，朝著他們的希望之河疾馳而去。
然而，路對麵就是西底加大沼澤，裏麵長滿了濃密的灌木和山茱萸，到處都是泥漿和汙濁的水塘——這裏是蜥蜴和蛇的樂園。黑暗中，兩人走錯了路，他們在原地繞了幾個小時，之後徹底迷路了。
直到深夜，他們被一個叫奧斯瓦德·斯旺的黑人發現，這才獲救。此時，布斯的腿疼得難以忍受，已經騎不了馬，於是，他給了斯旺七美元，坐上他的貨車。第二天是禮拜天，正值複活節，拂曉時分，斯旺趕著幾頭白騾子停在了裏奇希爾門前——大名鼎鼎的有錢人、考克斯上尉家門口。
至此，布斯的逃亡之路暫告一段落。
布斯告訴了考克斯上尉自己是誰，以及他的所作所為。為了證明自己的身份，他還露出用印度墨水刺在手上的姓名首字母。
他以母親的名義懇請考克斯上尉不要泄露自己的行蹤，他哀求說自己現在很虛弱，腳也殘了，疼痛難忍，並信誓旦旦地說自己的所作所為全是為了南部邦聯。
現在，布斯哪兒都去不了，不管是騎馬還是坐車。於是考克斯上尉將兩名逃犯藏到附近的鬆樹林裏。這裏不隻是個樹林，簡直可以說是叢林了，裏麵還長滿了密密麻麻的月桂和冬青。在接下來的六天五夜裏，兩人在裏麵等著布斯的腿傷好轉，然後繼續趕路。
考克斯上尉有個養兄弟，叫托馬斯·A.瓊斯。瓊斯是個奴隸主，多年來也一直是活躍的邦聯政府代理人，在波托馬克河偷渡逃犯、走私信件。考克斯上尉叮囑瓊斯照顧好赫羅爾德和布斯，所以，他每天早上都給他們送來一籃子食物。由於樹林裏每條路上都有人搜尋，間諜無孔不入，所以他挎著籃子時會呼喚他養的豬，假裝在喂食。
雖然布斯迫切需要食物，但他更迫切地想得到消息。他不停地請求瓊斯告訴他外麵的消息，好知道民眾是如何稱頌他的壯舉的。
終於，瓊斯給他帶來報紙，他迫不及待地打開，尋找夢寐以求的鋪天蓋地的讚譽，然而卻一無所獲，他得到的隻是幻滅和傷心。
他強忍傷痛，花了三十多個小時，快馬加鞭趕往弗吉尼亞。然而，比起精神上的痛苦，這些還是可以忍受的。若說北方陷入狂怒，他是可以理解的，也在他的預料之中。可是，當他從弗吉尼亞的報紙上看到，南部——他的南部——背棄了他，譴責他並與他撇清關係的時候，他幾乎瘋了，隻感到灰心和絕望。他滿心幻想自己會被尊為第二個布魯特斯[1]，被奉為當代的威廉·泰爾，可現在卻隻落得懦夫、白癡、狗腿子和殺手的罵名。
這些抨擊像毒蛇一般咬傷了他，又像死神一般凶猛而無情。
他自責嗎？不，恰恰相反，除了自己和上帝，他譴責所有人。他辯解道，自己不過是上帝手裏的一顆棋子罷了，他是受了上帝的指示，才刺殺亞伯拉罕·林肯的，而自己唯一的錯誤就在於，不該為一個“墮落腐化”而不懂感恩的民族賣命。“墮落腐化”，這是他在日記裏的表述。
“若世人理解我的良苦用心，”他寫道，“那一槍便已成就我的偉大，雖然我並不想成為偉人……以我靈魂的偉大，絕不該如罪人一般死去。”
布斯躺在西底加沼澤地附近潮濕的地麵上，身上隻蓋著鞍褥，全身都在瑟瑟發抖，他用悲情而浮誇的言辭表達了內心的痛楚：
潮濕、冰冷、饑腸轆轆，全世界皆與我對抗，如此絕望，原因何在？隻因我弑殺殘暴君王，像布魯斯特一般尊貴，如泰爾一般偉大，且成就更高，動機也更為純粹，卻被視為尋常殺手……我本無所求……自覺無可指摘，我心無悔。
布斯躺在那裏寫東西的時候，三千名偵探和一萬名騎兵正在到處搜捕他，他們搜索馬裏蘭州南部的每一個角落，搜遍了所有的房屋、洞穴和建築物，甚至把西底加沼澤地每個泥濘的水塘都找了個遍，抱定決心要找到布斯——不管是死是活——來領取獎金。為了捉拿布斯，政府懸賞近十萬美元。有時，他能聽到正在追捕他的騎兵從距他兩百碼的道路上飛馳而過。
有時候，他能聽到馬的嘶鳴聲和相互間的呼喚聲。要是他和赫羅爾德的馬有所回應，他們就可能被捕。於是，當天夜裏，赫羅爾德將馬牽至西底加沼澤槍殺了。
兩天後，天空中竟出現了禿鷹！起先隻是星星點點，然後越來越近，最後，在馬屍上方的空中不停地盤旋。布斯害怕了，他擔心禿鷹會引起追兵的注意，因為他們肯定認識他那匹棕色母馬。
除此之外，他決定再找個醫生。
第二天，也就是四月二十一日，星期五，距暗殺行動已過去一周。晚上，布斯被人抬著騎上了托馬斯·A.瓊斯的馬，他和赫羅爾德再次啟程，前往波托馬克河。
那天晚上的天氣再合適不過了：周圍到處彌漫著濃霧，漆黑的夜裏伸手不見五指。
瓊斯像狗一樣忠誠，把他們從躲藏的地方帶往河邊。他們悄悄地走過田野，跨過公路，穿過農場。瓊斯知道周圍到處都是士兵和特工，所以每次都偷偷地走上五十碼，停下來，聽一下周圍的動靜，然後低聲吹響口哨，布斯和赫羅爾德這才跟上他。
一路上，他們走得很慢，稍有聲響都為之一驚，這樣走了幾個鍾頭，終於到了一條陡峭又曲折的小路上，從這裏可以直接到達下麵的波托馬克河。大風已經刮了一整天，黑暗裏，能聽到河水拍打沙灘的聲音。
近一周來，聯邦士兵沿著波托馬克河來回巡視，把馬裏蘭州一側河岸上的所有船隻都毀壞了。但是瓊斯棋高一著：他早已安排了黑人亨利·羅蘭，白天劃船在河裏捕鯡魚，晚上就把船藏到登特家的草地裏。
所以，當這兩個逃犯晚上來到河邊時，一切都已安排妥當。布斯跟瓊斯小聲道了謝，為小船和一瓶威士忌，給了瓊斯十七美元。然後，他們爬上船，向五英裏外位於弗吉尼亞州的河岸駛去。
大霧彌漫的漆黑夜裏，赫羅爾德劃著槳，布斯坐在船尾，靠指南針和蠟燭導航。
可他們還沒走多遠，就遇到了漲潮，他們處在一個狹窄的通道裏，水流很急，潮水把他們往上遊推了好幾英裏，讓他們在大霧裏迷失了方向。兩個人一整夜都在躲避波托馬克河上巡邏的聯邦炮艇，黎明時分，他們發現自己到了上遊十英裏的地方，可並不比頭天晚上更靠近弗吉尼亞州那側的河岸一步。
於是，他們在納傑莫利灣的沼澤地裏躲了一天。到第二天晚上，他們費盡千辛萬苦終於過了河，兩人饑腸轆轆，渾身都濕透了。布斯激動地喊道：“感謝上帝！我終於脫險了，來到了輝煌的老弗吉尼亞！”
布斯急匆匆趕到理查德·斯圖爾特醫生家。理查德·斯圖爾特醫生是南部邦聯的代理人，也是弗吉尼亞州喬治王郡首富。布斯滿懷期待，以為自己會被當做南部的救星一樣來歡迎。可是，醫生已經因為幫助邦聯政府數次被捕，現在戰爭結束了，他可不想再冒著掉腦袋的危險去幫這個殺害林肯的罪犯。這家夥精明得很，他甚至沒讓布斯進家門，隻是很不情願地給了兩人一點兒吃的，但也是讓他們去倉庫吃，接著就打發他們去一戶黑人家裏借宿。
連黑人也不願接待布斯。他隻能恐嚇他們放他進去睡覺。
這可是在弗吉尼亞！
他曾信心滿滿，到了弗吉尼亞，隻要提及他的名字，連山穀裏都會回**著熱烈的歡呼聲。
三天之後，末日來臨了。布斯沒有走遠，他在三個從戰場歸來的邦聯騎兵的掩護下，從羅亞爾港坐船渡過拉帕漢諾克河，然後騎著其中一個人的馬向南走了三英裏，來到一個農場，又在他們的幫助下，欺騙農場主說自己叫博伊德，是李將軍的部下，在裏士滿附近打仗時受了傷。
在接下來的兩天裏，布斯都住在加勒特家，他忍著疼痛，邊躺在草坪上曬著太陽，邊研究一張舊地圖，並記錄著去格蘭德河以及墨西哥的路線。
住進加勒特家的第一天晚上，晚飯期間，加勒特的小女兒坐在桌前喋喋不休地談論著總統遇害的消息，她是剛從鄰居那裏聽來的。她說著說著就開始好奇這到底是誰幹的，這個刺客收了多少好處。
“依我看，”布斯突然說道，“他一分錢的好處也沒撈到，倒落了一身罵名。”
第二天下午，也就是4月25日，布斯和赫羅爾德正躺在加勒特院子裏的槐樹下。突然，幫他們過拉帕漢諾克河的拉格爾斯少校跑過來喊道：“當心，北方佬正在過河！”
他們急忙跑進了樹林，夜幕降臨後，又偷偷回到農場上。
這讓加勒特起了疑心，他想立刻把這兩位神秘的“訪客”打發走。是因為懷疑他們射殺了林肯嗎？不，他根本沒往那方麵想。他隻是懷疑他們是盜馬賊。晚飯期間，當他們說想買兩匹馬時，他的疑心更重了。睡覺時，兩個逃犯考慮到安全問題，直接沒有上樓，堅持要睡在門廊下或倉庫裏——這下什麽都一目了然了。
現在，加勒特萬分確信他們就是盜馬賊。於是，他讓他們住進一個存放著幹草和家具的破舊煙草倉庫裏，然後迅速把門鎖死。最後，為保險起見，這個老農民還讓他的兩個兒子威廉和亨利趁夜深人靜的時候，偷偷抱著毛毯睡到了隔壁的玉米倉裏，這樣就能緊緊盯著，以防夜裏馬匹被盜。
在那個難忘的夜晚，加勒特一家上床睡覺時，心中存著幾分期待，希望發生點激動人心的事情。
結果天還沒亮，他們就得償所願了。
兩天兩夜以來，一隊聯邦士兵夜以繼日地追尋布斯和赫羅爾德的行蹤，找到的線索一個接一個。他們找到了一個看到他們過了波托馬克河的老黑人，還找到了黑人船夫羅林斯，是他用一個平底大駁船把他們送到了拉帕漢諾克河對岸。據船夫交代，他們過河之後，那個用自己的馬馱布斯的邦聯士兵是威利·傑特上校，還說上校在十二英裏外的鮑靈格林有個情人，他可能去了那裏。
這聽起來希望很大，於是士兵們立刻跨上馬，借著月光快速前往鮑靈格林。到的時候已是午夜，他們“轟隆”一聲破門而入，將傑特上校一把從**拉下來，用左輪手槍抵著他的肋骨喝道：
“布斯在哪兒？你個畜生，把他藏哪兒了？快說，否則把你的心髒崩出來！”
傑特騎上他那匹小馬，帶這些北方士兵回到了加勒特農場。
周圍漆黑一片，月亮下山了，星星也寥寥無幾。在九英裏的行程中，馬匹飛馳而過，**起陣陣煙塵。傑特左右兩邊各一名騎兵，馬的韁繩被係在騎兵的馬鞍上，以防他在黑夜中逃跑。
淩晨三點半，士兵們來到了加勒特家被粉刷成白色的破舊老房子前麵。
他們迅速而悄無聲息地包圍了房子，把槍對準所有窗戶和出口。指揮官用手槍槍柄重擊了一下門廊，命令打開房門。
不久，理查德·加勒特手裏拿著蠟燭，打開了門。農場的狗狂吠不止，晚風吹著睡衣後擺不停地抽打在他顫抖的雙腿上。
貝克中尉一把掐住他喉嚨，用手槍抵住他的頭，命他交出布斯。
老頭兒嚇得舌頭都打結了，他發誓那兩個陌生人不在他家，說他們早就跑進了樹林。
他撒了謊——聽起來也不像實話。於是士兵們把他拖到門外，拿出一根繩子在他麵前晃了晃，威脅要立馬把他吊死在院子裏的槐樹上。
正在此時，加勒特的一個在玉米倉睡覺的兒子跑出來講了實話。聽完，士兵們立即包圍了煙草倉庫。
槍聲響起之前還進行了多次談話。為了讓布斯投降，北方軍官們和他談了十五到二十分鍾。可他竟然喊話回來說自己是個殘廢，問他們敢不敢“給跛子一個表演的機會”，並提議大家後退一百碼，讓他出來跟所有人一一過招。
赫羅爾德完全泄了氣，他想投降。這讓布斯十分反感。
“你這個該死的懦夫，”他狂怒著喊道，“滾出去，我一點兒也不想看到你。”
於是，赫羅爾德走了出來，雙手放在前麵，等著被戴上手銬。同時，他還苦苦祈求憐憫，不停地說自己喜歡林肯講的笑話，發誓說自己並沒有參與暗殺行動。
康格上校把他綁到一棵樹上，命令他停止那愚蠢的啜泣，否則就堵住他的嘴。
然而布斯不願投降，他認為自己是在幹一番功蓋千秋的偉業。他朝追捕他的士兵喊道，他的字典裏沒有“投降”兩個字，並提醒他們“在光輝的旗幟上又添一個汙點”時，為他準備一副擔架。
康格上校決定用煙把他熏出來，他命令加勒特的兒子在倉庫後麵堆滿幹的灌木。布斯看到後開始詛咒他，並要求他住手，否則就朝他開槍。於是他停了下來。但康格上校悄悄溜到倉庫後方的一個角落，從裂縫處拽出一束幹草，用火柴點燃了。
這個倉庫起先是用來存放煙草的，留著四英寸寬的通風口。透過通風口，士兵們看到火勢越來越大，布斯搬起桌子，與聚攏的火焰做著鬥爭——一個演員最後一次站在聚光燈下，一個悲劇演員告別演出的最後一幕。
上麵有嚴格的命令，要活捉布斯。政府不想直接殺了他，而是要重判並絞死他。
如果不是因為一個反應遲鈍的中士，他可能真被活捉了。那個中士叫“波士頓”科比特，是個宗教狂。
所有人都接到好幾次警告，沒有命令不得開槍。後來，科比特聲稱他接到了命令——上帝給他的命令。
透過燃燒的倉庫的縫隙，“波士頓”看到布斯扔掉拐杖，丟下卡賓槍，舉起左輪手槍，跳到了門口。
“波士頓”確信布斯會用子彈給自己開路，為自由做最後一搏。
為防止傷及無辜，科比特往前一步，用手臂托住槍，從裂縫處找到目標。在為布斯的靈魂禱告後，他扣動了扳機。
隨著“砰”的一聲，布斯大喊著，一條腿高高抬起，踉蹌了一下，就臉朝下跌在了幹草上。這是致命的一槍。
熊熊大火很快吞噬了整個倉庫的幹草。貝克中尉迫切想把他救出來，以防這個奄奄一息的家夥被大火烤糊。於是，他衝進燃燒的倉庫，跳到布斯身上，將他手裏緊握的左輪手槍摳了出來。緊接著他把布斯的兩條胳膊捆到一側，以防他是裝死。
布斯很快被帶到農舍的門廊上，與此同時，一個士兵騎上馬，沿塵土飛揚的小路，到三英裏外的羅亞爾港去給他找醫生。
加勒特太太有個妹妹，姓哈羅威。哈羅威小姐是個教師，寄宿在加勒特家。當她認出，門口這個躺在忍冬花枝蔓下奄奄一息的人，就是浪漫派演員和大情聖約翰·威爾克斯·布斯時，便說一定要好好照顧他。她讓人拖出一個床墊給他躺著，還拿出自己的枕頭，親自墊在他頭下，甚至把他的頭放到腿上喂他喝酒。但是他的喉嚨好像已經失去了知覺，不能吞咽。哈羅威小姐便把手帕浸了水，不停地濕潤他的嘴唇和舌頭，還給他按摩太陽穴和額頭。
這個垂死之人痛苦地掙紮了兩個半小時。他苦苦哀求給他翻翻身，一會兒臉朝下，一會兒側身，一會兒平躺。他邊咳嗽邊要求康格上校用力掐他的脖子，並痛苦地喊道：“殺了我吧，殺了我吧！”
他用微弱的聲音一字一頓地說著，並要求把這句告別的話轉達他的母親：
“告訴她……我認為……我所做的……是對的，我是為……我的國家而死。”
咽氣之前，他要求抬起他的雙手，讓他看看它們，但兩隻手已經完全不聽使喚了，他低聲咕噥道：
“廢物！廢物！”
這是他說的最後一句話。
當太陽從加勒特院子裏古老的洋槐樹頂端升起時，布斯死了。他的“下巴突然拉長，向下方歪去，眼珠轉向雙腳，並開始鼓脹起來……伴著‘咯’的一聲，他雙腳一蹬，頭仰到了後麵。”這就是最後的結局。
當時是早上七點鍾，比林肯去世的時間晚了二十二分鍾。“波士頓”科比特的子彈擊中了布斯的後腦勺，與布斯擊中林肯頭部的位置相比，傷口要向下一英寸。
醫生剪掉布斯的一縷頭發，交給了哈羅威小姐。她一直保留著這縷頭發和他枕過的沾滿血跡的枕套——一直保留著、珍藏著，直到多年以後，她貧困潦倒，才不得不拿出帶有血漬的枕套的一半，換了一桶麵粉。
[1]古羅馬政治家，圖謀刺殺愷撒。