王占川死後，兒女們為他修建了祠堂。
祠堂成為一個完整的院落，北房三間，西房三間。北房內設有香案。香案後就是他的墳墓。香案上供著專門從景德鎮定做的王占川瓷像，形象逼真，栩栩如生。瓷像前供一甬神主。上書文曰：清償戴花翎即補都司農商部水利顧問顯考占川府君之神主。落款署名：孝男月、青、印、吉敬立。香案一側又供一甬神牌，文日：供奉綏西河渠總河神王君占川之神位。
祠堂有幾個人專門照管，清晨、黃昏三叩頭，早晨和晚上各點一爐香。
河套人民為了紀念王占川，在“四大股渠”東建起了一座龍王廟，裏麵供奉著他的神位。
開發河套的“獨眼龍王”離開了人間，但他引黃墾殖的豐功偉績卻永遠刻在河套人民的心目中。河套人民將他奉為河神，認為他雖然死了卻還在掌管著河套的河水漲落，因而每當遇到河渠水落，田苗幹旱，或者河水暴漲，決口成災時，人們就到王占川的祠堂來祭奠。白天在祠堂擺上整豬整羊，以及一些美味食品供獻在香案前；晚上人們就到義和渠和沙河渠等八道大渠裏放河燈，祈禱他的神位顯靈，祈求降福消災。
每年農曆六月二十八日，河套人民自發地到龍王廟祭奠王占川，並在大渠中放河燈。河燈有兩種：一種是用紙做成的燈籠，為了防止水把麻紙泡濕後淹滅燈火，製作燈籠時將麻紙用蠟油浸過，然後再將油燈放入燈籠中，水就不會輕易泡爛麻紙，燈籠可以長時間地亮著飄浮在水麵上。另一種是窮人想出的土辦法，他們沒有錢來置辦燈籠，就因地製宜，在西瓜皮中放一盞燈，點著後放入渠水中。夜晚，無數盞燈籠飄浮在大渠的水麵上，猶如萬家燈火，十分美麗而壯觀……這就是河套著名的“放河燈”，也叫“祭河神”。
有一年，河套大旱，黃河水位低，各條大渠進不來水，莊稼要旱死了，百姓人心惶惶。五原人民自發地在王家大院前邊搭起了戲台，供奉起王占川的神牌，唱了七天的祈雨求神戲。第八天戲剛散，大雨傾盆，河水大漲，莊稼得以灌溉，人們歡呼雀躍……
河套人民至今仍然使用著王占川開挖的八道大渠，而且會永遠使用下去，造福千秋萬代。王占川的名字，以及他的傳奇人生將永遠在河套人民中間廣泛傳誦。