此次巫妖大戰前後蔓延十幾年之久，終於在鴻鈞地強勢幹預下，勉強落下帷幕了。巫妖兩族損失慘重，千萬大軍，僥幸逃過滅頂之災的，不過區區幾十萬人，好一個兩敗俱傷！
巫妖兩族經過這次大戰，均傷了元氣，也真正了解了對方的實力，對對方首次出現的大陣，也吃驚不已，均覺得對方了得，難以取勝，也隻好停戰，但明眼人都看出來，這巫妖之間已經是不死不休的因果，如今隻是暫時調停，一旦他們實力恢複了，早晚又有一戰。
十二祖巫凝聚盤古真身，法力消耗太多，深受重傷，大巫更是損失不計其數。妖族也不好過，大妖損失尚且不計，就連兩大高手都受到慘重打擊。大陣被強行攻破，帝俊被反噬，河圖洛書作為陣眼，受損極大，也是實力大損。東皇太一受那盤古真身的全力一擊，雖然僥幸靠東皇鍾的威力，終於擋住，但有苦自知，東皇鍾受損頗大，短時間無法使用了，自身修為亦是大損。
在鴻鈞的威勢下，兩族也就不再爭鬥，老老實實地各歸天地，一邊休養生息，一邊享受那付出巨大代價換來的權利與地位去了。巫族先是在各地大修山神土地廟，派巫人出任，監管洪荒。妖族則是大封各路妖神為那周天大神，各自執掌有司。妖族得了那天庭重地尚且不足，眼看既然洪荒大地不能下手了，那就搶占水道。於是在各處河川大澤，大封河神河伯。同時點齊高手威*那四海龍族，四海龍族自從洪荒三族大戰後，實力大損，安於享樂久矣，不擅長與人爭鬥，被*無奈隻好俯首稱臣，倒也弄得天庭一正神之位，從此行龍神之道，監管四海有名。
洪荒世界經過此次巫妖大戰，除卻生靈塗炭，環境卻是受損不大，畢竟此時兩族爭鬥，是為爭那洪荒大地。任誰也不願破壞那洪荒，畢竟如果搶到手的是一片廢墟，任誰也不願意，是以多以肉搏，毀天滅地的手段倒是極少使用。少了這些巫妖滿天下的廝殺掠奪，洪荒生靈卻是得到了一個良好的發展環境。
在天宮和巫族分管天地而治後，洪荒大地終於恢複了難得的平靜……
此後多有那靈物得道或者來曆不明者開始出現在洪荒大陸，行走遊曆，卻是為了拜師之事。原來巫妖大戰，普通人雖沒有親見，卻也有所耳聞，那等慘烈場麵，倒是嚇壞了不少人心肝。
於是開始有人四處尋訪名師，一是為那玄奧的修行法門。洪荒世界不同以後，眾多修行法門還沒出現，而那些大神的道法也沒有以後外傳的那麽泛濫。很多人倒是靠本能修行，朝吞暮吐，采集天地靈氣，洪荒靈氣雖比不上開天初，但也充盈，法力增長倒也迅速，隻是那道行卻是不見長進，修大道，卻不入道之門者，不知凡幾。
二來倒是欲尋得一處好的庇護，免得大難來時遭了無妄之災，若得高人庇佑，倒是可以安心參那天機大道，長誦黃庭。
巫妖大戰對眾神的影響卻是更為深遠，兩族的強大破壞力，卻是真個讓大神都汗顏，眾大神膽戰心驚之下，倒都有了一番考慮。
五莊觀率先向整個洪荒宣布，此後閉觀不出，謝客千年。鎮元子和紅雲這兩個老好人倒是遁世更深了，從此打定主意，除去紫霄宮聽講外，堅決不出，好好參悟大道，不結因果，免得身殞化無。
其他幾人倒是恰恰相反。先是老子下凡，路過那首陽山，見一人麵山而跪，好奇之下一詢問，卻是一苦行拜師之人。此人倒也是靈物得道，一直苦尋明師，專往那名山大川跑，每至一處，也不管山中是否有明師，必定跪拜三月，三月無功後，再去下一處。老子修行之法，倒也講究些無為，須得大恒心，大毅力者方能習得。乍遇此人，掐指一算，卻是正與自己有那師徒之緣，而且其心智彌堅，倒是一璞玉。
老子隨即收下他為徒，賜名玄都，也不再遊曆，徑直回轉昆侖山去了。
原始的做法倒與老子不同，他直接傳話洪荒，凡是有緣之人，除去巫妖二族，皆可去昆侖山拜師。一時間群情激奮，不知其數的人衝往昆侖山。眾人到了那昆侖山，卻是不能悠然而入，與早前想象的所差甚遠，原來那昆侖山卻是布了一大幻陣，能過者，皆可為原始徒。最後一共十三人過了幻陣。原始倒也爽性立刻收了其中十二人為徒，盡皆賜了名，正是那日後闡教十二位金仙。最後單單留下其中之一人，卻是一個麵貌似慈善者。
此人名為燃燈，也在紫宵宮聽過道。實力已至大羅金仙頂峰，快要突破至準聖，此時原始尚未成聖，心有顧忌，自是不會收一個與自己同輩之人為徒。
“敢問大仙為何不收小人為徒。”燃燈有些忿忿不平，自己也算中規中矩地過了那考驗，怎的卻不能拜師？
“你與我有師徒緣，卻無師徒分，不過你終歸過了那考驗，不與你個交代，終是不好。”原始想了想，“你也就暫且為我門下記名弟子，也不用敬愛師門，隨時亦可離去。”原始不想卻因此埋下了禍根。
通天先去了一趟昆侖山，拜見一下老子原始，看到他們忙於收徒，他也不收門徒，老子原始看到通天沒收徒，就勸說他也收些徒弟，通天就推辭說自己已有幾個徒弟，且自己修為低下，尚要努力修煉，就不收徒了。其實通天看到老子原始收的徒弟都快笑掉大牙了，他們的資質連他的三代弟子都比不上，他根本就看不上，還虧得後來老子原始那麽護短。通天敢肯定，鴻鈞不出手的話，就憑自己的九個弟子，就能橫掃洪荒了。同時也因為通天明麵上的徒弟極少，導致後來三清沒鬧矛盾，也沒有分家，並引發了一係列變化。
三人又談論了一些自己領悟的大道，相互交流後，通天便告辭。
通天回蓬萊島後，如往昔一般，除開壇講道，便是閉關淬煉得來的巫族精血，將之提煉成盤古精血，完善自己的盤古真身。他現在不用修煉，他的體內混沌世界就可不斷提升他的法力，完善他的盤古真身。他或到金鼇島去管理一下島上事務，閑暇時也在島上講道，旁聽生越來越多，通天看島上生靈太少，就布下一煉心大陣，整個大陣共有十八層，每經過一層都要通過一番考驗，隻有意誌堅毅的人才會通過，而通過大陣的人就會受到金鼇島大陣的保護，且有機會聽他講道，修那蓬萊大道。自此金鼇島上的生靈也越來越多。
通天在指導完蓬萊島內眾人的修行後，忽然心中一動，默查之下，頓時大喜，隨即瞬移消失在碧遊宮之中。
下一刻通天已經來到了混沌珠的一個空間之中。隻見一隻巨大的筆傲然挺立在灰蒙蒙的混沌空間內，通體散發出蒼涼、古樸的氣息。一著青色長袍的青年獨立在輪回筆前，孤傲的身影與身後的輪回筆交相輝映，長發飄然間目視遠方。
“徒兒大功告成，可喜可賀！”通天的聲音響起，那青年轉身恭敬地道：“徒兒墨玄見過師父！”聲音中充滿了無盡的感傷，好似看盡一切的垂幕老者，與年輕的身形實在是相差的離譜。
“哈哈，徒兒終於看破世事，隻曆二世就成功出得春秋輪回筆，大出為師的意料！”通天高興地說道。墨玄等人入春秋輪回筆至今已有二十年，外麵十年，輪回筆中一世，墨玄曆兩世就從輪回筆中出來，卻是難得的很。其實這也與之前墨玄跟隨他入洪荒曆練有關，在洪荒曆練之時，墨玄從不諳世事到成熟，看盡了人生百態，世事無常，心境已經提高到很高的一個地步了，這才得以這麽快就從輪回筆中出來。
“你的師弟師妹們怕是還有很長的一段時間才能出來，你剛突破到亞聖後期，且混沌靈氣對你好處極多，你就先在這混沌珠內修煉，鞏固境界。我先離開這裏。”通天又瞬移回到碧遊宮。
歲月匆匆，很快又是一萬年過去了，此刻的蓬萊島中，八弟子終於從輪回筆中出來，經曆了無數世的輪回，眾弟子的心境皆已提高，且修為大進。