一、檔案文獻
上海市檔案藏聖約翰大學檔案Q，全宗號243。
北京師範大學檔案館藏：《私立北平輔仁大學檔案》，案宗第21號。
北京師範大學藏：《私立北平輔仁大學檔案》，案宗第760、761、762、764、765、767、768、769、770、771、772、774、775、776、777、778、780、782號。
中國第二曆史檔案館藏檔案，全宗號1001，卷號5369。
中國第二曆史檔案館藏檔案，全宗號2010，卷號3236。
中國第二曆史檔案館藏檔案，全宗號十二（6），卷號18295。
中國第二曆史檔案館藏檔案，全宗號十二（6），卷號18300。
中國第二曆史檔案館藏檔案，全宗號十二（6），卷號19933。
中國第二曆史檔案館藏檔案，全宗號十二（6），卷號19967。
（台灣）“國史館”內政部檔案，統一編號128，案卷編號1785。
《中國近代史資料匯編·教務教案檔》，第七輯（二），台灣“中央研究院”近代史研究所1981年版。
《中華民國史檔案資料匯編》,第3輯《文化》,江蘇古籍出版社1991年版。
《中華民國史檔案資料匯編》，第5輯第1編，文化（一），江蘇古籍出版社1994年版。
《中華民國史檔案資料匯編》，第5輯第1編，文化（二）（複印本），中國第二曆史檔案館編，江蘇古籍出版社1994年版。
《中華民國史檔案資料匯編》，第5輯第2編，文化（二），中國第二曆史檔案館編，江蘇古籍出版社1998年版。
《中華民國史檔案資料匯編》，第5輯，文化，中國第二曆史檔案館編，江蘇古籍出版社1999年版。
二、1949年前中文報刊
（一）基督宗教報刊
《教會新報》《萬國公報》《興華》
《道南》《聖經報》《真光》
《神學誌》《生命月刊》
《真理周刊》《文社月刊》
《真理與生命》《天風周刊》
《唯愛》《青年進步》
《中西教會報》《教育雜誌》
（二）佛教報刊
《佛學叢報》《新佛教》《南瀛佛教》《正信》《現代僧伽》
《海潮音》《威音》《四川佛教月刊》《現代佛教》《楞嚴特刊》
《獅子吼月刊》《佛教公論》《覺音》《佛化新青年》
《同願》《人海燈》《蘇州覺社年刊》《覺有情》《正覺》
《佛學半月刊》《世界佛教居士林林刊》《東方文化》
《覺群周報》《大佛學報》《人間覺》《佛化月刊》
《覺社叢書》《北平佛教會月刊》《圓音月刊》《蘇州覺社年刊》
《中國佛教季刊》《頻伽音》《佛教月刊》《佛音》
（三）其他報刊
《浙江潮》《江蘇》《申報》《製言》
《民報》《民立報》《青年雜誌》《新青年》
《大公報》《晨報副鐫》《東方雜誌》《安徽俗話報》
三、中文書籍及資料
（一）文史資料
《文史資料》《文史資料選輯》
《長春文史資料》《當陽文史資料》
《江蘇文史資料》《張家口文史資料》
《湘潭縣文史》《蒲圻文史》
《廈門文史資料》
（二）中文書籍
《中華基督教會年鑒》（1—13），（上海）廣學會、中華續行委辦會、全國基督教協進會1914—1936年版；（台北）橄欖文化事業基金會1983年再版。
李提摩太：《李提摩太致釋家書》，上海廣學會1916年版。
謝洪賚：《基督教與科學》，青年協會1921年版。
張亦鏡編：《大光破暗集》，（廣州）美華浸會印書局1923年版。
《科學與人生觀》，上海亞東圖書館1923年版。
賈玉銘編著：《新辨惑》，南京靈光報社1923年版。
王治心：《基督徒之佛學研究》，上海廣學會1924年版。
中國青年社非基督教同盟編：《反對基督教運動》，（北京）國光書店1925年版。
張亦鏡編：《最近反基督教運動的紀評》，（廣州）美華浸會印書局1925年版。
謝受靈：《基督教五大證據》，漢口中華信義會書報部1925年版。
趙紫宸：《基督教哲學》，中華基督教文社1926年版。
唐大圓主編：《東方文化》，第二集，上海泰東圖書局1926年版。
《太虛法師文鈔初集》，中華書局1927年版。
張亦鏡編：《批評非基督教言論匯刊全編》，（上海）美華浸信會印書局1927年版。
張欽士選輯：《國內近十年來之宗教思潮》，燕京華文學校1927年版。
王治心：《中國文化與基督教》，青年協會書局1927年版。
張振之：《革命與宗教》，（上海）民智書局1929年版。
範皕海：《我的新耶穌觀》，青年協會書局1929年版。
《海潮音文庫》，上海佛學書局1930年版。
王治心：《孫文主義與耶穌主義》，青年協會書報部1930年版。
張亦鏡編：《孫中山自曆明證》，上海美華浸會印書局1931年版。
賈玉銘:《神道學》，南京靈光報社1931年版。
胡超伍:《科學與佛法》，上海新聲書局1932年版。
王小徐:《佛法與科學之比較研究》，上海開明書店1932年版。
張純一：《佛化基督教》，上海佛學書局1933年版。
吳雷川：《耶穌的社會理想》，青年協會書局1934年版。
林洪兵：《道就是十字架》，施高路福音堂1934年版。
徐寶謙:《基督教與中國文化》，青年協會書局1934年版。
徐寶謙編：《宗教經驗譚》，青年協會書局1934年版。
德禮賢：《中國天主教傳教史》，商務印書館1934年版。
謝扶雅：《基督教對今日中國的使命》，青年協會書局1935年版。
馬芳若：《中國文化建設討論集》，經緯書局1936年版。
袁樂裕編著：《民族主義原論》，正中書局1936年京版，1946年滬版。
吳雷川：《基督教與中國文化》，青年協會書局1936年版。
徐宗澤編：《中國天主教傳教史概論》，上海聖教雜誌社1938年版。
明道等：《廟產興學促進會宣言駁議》，湖北省圖書館特藏部藏，無出版時間。
吳雷川：《墨翟與耶穌》，青年協會書局1940年版。
謝扶雅：《基督教與現代思想》，青年協會書局1941年版。
樂 觀：《奮迅集》（僧侶抗戰工作史）廣西佛教居士林1943年版。
王治心：《中國基督教史綱》，青年協會書局1940年版。
徐鬆石：《基督眼裏的中華民族》，上海廣學會1948年初版。
江文漢：《基督教與馬列主義》，北京青年協會書局1950年版。
新華時事叢刊社輯：《基督教人士的愛國運動》，北京新華書店1950年版。
張仕章編譯：《宗教批判集》，青年協會書局1950年版。
陳際雲編：《中國基督教的新生》，北京中華基督教華北衛理公會宗教教育部1951年版。
中國社會科學院近代史研究所資料編譯組：《外國資產階級是怎樣看待中國曆史的》第二卷，商務印書館1962年版。
王明道：《耶穌是誰》，香港弘道出版社1962年再版。
［美］賴德烈：《現代中國史》，呂浦、孫瑞芹譯，商務印書館1963年版。
李劍農：《戊戌以後三十年中國政治史》，中華書局1965年版。
謝扶雅：《基督教與中國》，香港中華基督徒送書會1965年版。
章力生：《孫文主義與神學基礎》，香港聖道出版社1970年版。
張曼濤主編：《現代佛教學術叢刊》（1—100），（台北）大乘文化出版社1971年版。
方豪編：《馬相伯（良）先生文集》，台灣文海出版社1972年版。
方豪編：《馬相伯先生文集續編》，台灣文海出版社1972年版。
柳田聖山主編：《胡適禪學案》，（台灣）正中書局1975年版。
梁元生：《林樂知在華事業與萬國公報》，香港中文大學出版社1978年版。
《李大釗選集》，人民出版社1978年版。
李璜：《學鈍室回憶錄》，傳記文學出版社1978年版。
《佛法與三民主義》，大乘文化出版社1980年版。
邵玉銘編：《二十世紀中國基督教問題》，（台北）正中書局1980年版。
中華福音神學院中國教會史研究中心編纂：《中國基督教史研究書目——中、日文專著與論文目錄》，（台北）中華福音神學院出版社1981年版。
《浙江辛亥革命回憶錄》，浙江人民出版社1981年版。
鍾離蒙、楊鳳麟主編：《無神論和宗教問題的論戰》，上冊，《中國現代哲學史資料匯編》第一集第十冊，1981年10月沈陽（非公開出版）。
鍾離蒙、楊鳳麟主編：《無神論和宗教問題的論戰》，下冊，《中國現代哲學史資料匯編》第一集第十一冊，1981年10月沈陽（非公開出版）。
馮玉祥：《我的生活》，黑龍江人民出版社1981年版。
馮自由:《革命逸史》，中華書局1981年版。
陳樂素、陳智超編校：《陳垣史學論著選》，上海人民出版社1981年版。
吳利明：《基督教與中國社會變遷》，香港基督教文藝出版社1981年版。
《孫中山全集》，第2卷，中華書局1981年版。
葛懋春、李興芝編輯：《胡適哲學思想資料選》（上），華東師範大學出版社1981年版。
《中國哲學》第8輯，生活·讀書·新知三聯書店1982年版。
《私立輔仁大學》，（台北）南京出版有限公司1982年版。
《勵耘書屋問學記》，生活·讀書·新知三聯書店1982年版。
《北京師範大學校史》，北京師範大學出版社1982年版。
柴德賡：《史學叢考》，中華書局1982年版。
司徒雷登：《在華五十年：司徒雷登回憶錄》，程宗家譯、劉雪芬校，北京出版社1982年版。
《顧維鈞回憶錄》，中華書局1983年版。
湯用彤：《漢魏兩晉南北朝佛教史》，中華書局1983年版。
汪原放：《回憶亞東圖書館》，學林出版社1983年版。
孫寶瑄：《忘山廬日記》，上冊，上海古籍出版社1983年版。
中國社會科學院近代史研究室翻譯室編：《近代來華外國人名辭典》，（北京）中國社會科學出版社1984年版。
《太虛文集》，台灣文殊出版社1984年版。
《惲代英文集》，人民出版社1984年版。
《朱執信集》，中華書局1984年版。
釋東初：《中國佛教近代史》，東初出版社1984年版。
薑義華編：《社會主義學說在中國的初期傳播》，複旦大學出版社1984年版。
葛懋春等編：《梁啟超哲學思想文選》，北京大學出版社1984年版。
印順：《太虛法師年譜》，台灣正聞出版社1984年版。
《八指頭陀詩文集》，梅季點輯，嶽麓書社1984年版。
藍吉富主編：《現代佛學大係》（60冊），（台北）彌勒出版社1984年版。
吳相湘主編：《中國史學叢書》之十四《勸世良言》，台北學生書局1985年版。
蘇曼殊：《蘇曼殊全集》，北京中國書店1985年版。
《梁啟超論清學史二種》，複旦大學出版社1985年版。
《章太炎全集》（四），上海人民出版社1985年版。
章開沅：《辛亥革命與近代社會》，天津人民出版社1985年版。
陳崧編：《五四前後東西文化問題論戰文選》，中國社會科學出版社1985年版。
周叔迦：《法苑談叢》，中國佛教協會出版1985年版。
馮友蘭：《中國哲學簡史》，塗又光譯，北京大學出版社1985年版。
陳垣等：《民元以來天主教史論集》，（台北）輔仁大學出版社1985年版。
林榮洪：《近代華人神學文獻》，香港中國神學研究院1986年版。
唐文權、羅福惠：《章太炎思想研究》，華中師範大學出版社1986年版。
《餘家菊景陶先生論著專輯》第二輯人文，財團法人紀念餘家菊先生文教獎學基金會1986年版。
杜石然等：《中國科學技術史稿》，下冊，科學出版社1986年版。
王栻主編：《嚴複集》，中華書局1986年版。
釋東初：《中國佛教近現代史》，（台北）東初出版社1987、1991年版。
《胡適書評序跋集》，嶽麓書社1987年版。
《中國傳統文化的再估計——首屆國際中國文化學術討論會（1986年）文集》，上海人民出版社1987年版。
［美］傑西·格·盧茨：《中國教會大學史（1850—1950）》，曾钜生譯，浙江教育出版社1987年版。
張力、劉鑒唐：《中國教案史》，四川省社會科學院出版社1987年版。
梁漱溟：《中國文化要義》，上海學林出版社1987年版。
蔣廷黻：《中國近代史》，嶽麓書社1987年版。
汪澍白：《毛澤東思想與中國文化傳統》，廈門大學出版社1987年版。
洪啟嵩、黃啟霖主編：《當代中國佛教大師文集》，（台北）文殊出版社1987年版。
［美］陳榮捷：《現代中國的宗教趨勢》，廖世德譯，（台北）文殊出版社1987年版。
李楚材編著：《帝國主義侵華教育史資料》，教育科學出版社1987年版。
《獨秀文存》，安徽人民出版社1987年版。
《胡適書評序跋集》，嶽麓書社1987年版。
李澤厚：《中國現代思想史論》，東方出版社1987年版。
彭樹智：《現代民族主義運動史》，西北大學出版社1987年版。
中華續行委辦會調查特委會編：《1901—1920年中國基督教調查資料》，蔡詠春、文庸、段琦、楊周懷譯，中國社會科學出版社1987年版。
《科學與社會》，科學出版社1988年版。
全國政協文史資料委員會宗教組編：《名僧錄》，中國文史出版社1988年版。
釋聖嚴：《明末中國佛教之研究》，台灣學生書局1988年版。
《圓瑛法師講演錄》，上海圓明講堂1988年版。
葉仁昌：《近代中國的宗教批判——非基運動再思》，台灣鴉歌出版社1988年版。
藍吉富主編：《世界佛學名著譯叢》（100冊），（台北）華宇出版社1988年版。
龔書鐸主編：《近代中國與近代文化》，湖南人民出版社1988年版。
唐寶林、林茂生：《陳獨秀年譜》，上海人民出版社1988年版。
龔書鐸：《中國近代文化探索》，北京師範大學出版社1988年版。
《章太炎生平與學術》，生活·讀書·新知三聯書店1988年版。
王治心：《中國宗教思想史大綱》，上海三聯書店1988年重印版。
顧裕祿：《中國天主教的過去和現在》，上海社會科學院出版社1989年版。
郭朋、廖自力、張新鷹：《中國近代佛學思想史稿》，巴蜀書社1989年版。
［日］友鬆芳郎主編：《綜合科學史》，求實出版社1989年版。
林治平主編：《基督教與中國本色化》，宇宙光出版社1989年版。
《梁漱溟全集》，第1卷，山東人民出版社1989年版。
明暘等編：《圓瑛大師年譜》，上海圓明講堂1989年版。
［法］謝和耐：《中國文化與基督教的衝撞》，遼寧人民出版社1989年版。
羅章龍編：《非教宗論》，巴蜀書社1989重刊。
［英］艾略特（Eliot,T.S.）：《基督教與文化》，四川人民出版社1989年版。
［英］懷特海：《科學與近代世界》，何欽譯，商務印書館1989年版。
［美］郭穎頤：《中國現代思想史中的唯科學主義》，江蘇人民出版社1989年版。
［美］道森（Dawson,C.）：《宗教與西方文化的興起》，四川人民出版社1989年版。
［奧］弗洛伊德（Sigmund Freud）：《摩西與一神教》，生活·讀書·新知三聯書店1989年版。
《陳旭麓學術文存》，上海人民出版社1990年版。
《禪定指南》，中國人民大學出版社1990年版。
章開沅：《辛亥前後史事論叢》，華中師範大學出版社1990年版。
李約瑟：《中國科學技術史》，第二卷《科學思想史》，科學出版社、上海古籍出版社1990年版。
陳智超編注：《陳垣往來書信集》，上海古籍出版社1990年版。
郭齊勇：《文化學概論》，湖北人民出版社1990年版。
［日］末木剛博：《東方合理思想》，江西人民出版社1990年版。
李侃：《近代傳統與思想文化》，文化藝術出版社1990年版。
王治心編：《中國宗教思想史大綱》，上海書店1990版。
陳智超編：《陳垣來往書信集》，上海古籍出版社1990年版。
《紀念陳垣校長誕生110周年學術論文集》，北京師範大學出版社1990年版。
秦家懿、孔漢思：《中國宗教與基督教》，生活·讀書·新知三聯書店1990年版。
印順：《佛法概論》，中國佛教文化研究所1990年版。
羅榮渠主編：《從“西化”到現代化——五四以來有關中國的文化趨向與發展道路論爭文選》，北京大學出版社1990年版。
陳旭麓、郝盛潮主編：《孫中山集外集》，上海人民出版社1990年版。
［日］村上重良：《宗教與日本現代化》，今日中國出版社1990年版。
石峻、樓宇烈、方立天等編：《中國佛教思想資料選編》，第3卷第3冊，中華書局1990年版。
石峻、樓宇烈、方立天等編：《中國佛教思想資料選編》，第3卷第4冊，中華書局1990年版。
史靜寰：《狄考文與司徒雷登在華的教育活動》，（台北）文津出版社1991年版。
郭金彬：《中國科學百年風雲——中國近現代科學思想史論》，福建教育出版社1991年版。
［美］費正清主編：《劍橋中華民國史》第一部，上海人民出版社1991年版。
《呂澂佛學論著選集》，齊魯書社1991年版。
張仲禮：《紳士——關於其在19世紀中國社會中作用的研究》，李榮昌譯，上海社會科學院出版社1991年版。
林語堂：《京華煙雲》，鬱飛譯，湖南文藝出版社1991年版。
《柳詒徵史學論文續集》，上海古籍出版社1991年版。
章開沅、林蔚主編：《中西文化與教會大學》，湖北教育出版社1991年版。
胡偉希編：《辛亥革命與中國近代思想文化》，中國人民大學出版社1991年版。
R.霍伊卡：《宗教與現代科學的興起》，四川人民出版社1991年版。
肖萬源：《中國近代思想家的宗教和鬼神觀》，安徽人民出版社1991年版。
［美］F.J.斯特倫：《人與神》，四川人民出版社1991年版。
《道教仙學養生秘庫》，大連出版社1991年版。
劉仁航：《東方大同學案》，上海書店1991年版。
《陳寅恪史學論文選集》，上海古籍出版社1992年版。
《胡適口述自傳》，唐德剛譯，華文出版社1992年版。
［英］R.鮑柯克等編：《宗教與意識形態》，四川人民出版社1992年版。
［日］近代日本思想史研究會：《近代日本思想史》，第一卷，商務印書館1992年版。
陳旭麓：《近代中國的新陳代謝》，上海人民出版社1992年版。
劉乃和：《勵耘承學錄》，北京師範大學出版社1992年版。
印順：《妙雲集》，正聞出版社1992年版。
王晴佳、陳兼主編：《中西曆史論辯集》，學林出版社1992年版。
［美］威利斯頓·沃爾克：《基督教會史》，中國社會科學出版社1992年版。
牙含章、王友三主編：《中國無神論史》（上、下），中國社會科學出版社1992年版。
高振農：《佛教文化與近代中國》，上海社會科學院出版社1992年版。
阮仁澤、高振農主編：《上海宗教史》，上海人民出版社1992年版。
李雙璧：《從經世到啟蒙》，中國展望出版社1992年版。
麻天祥：《晚清佛學與近代社會思潮》，（台北）文津出版社1992年版。
查時傑：《民國基督教史論文集》，財團法人基督教宇宙光傳播中心出版社1993年版。
印順：《華雨集》，1—5冊，台灣正聞出版社1993年版。
麻天祥：《佛學與人生——近代思想家的佛學思想》，中州古籍出版社1993年版。
王成勉：《文社的興衰——20年代基督教本色化之個案研究》，財團法人基督教宇宙光傳播中心出版社1993年版。
［美］費正清、劉廣京編：《劍橋中國晚清史》下卷，中國社會科學院曆史研究所編譯室譯，中國社會科學出版社1993年版。
江燦騰：《太虛法師前傳》,台灣新文豐出版公司1993年版。
郭齊勇：《熊十力思想研究》，天津人民出版社1993年版。
鄭師渠：《晚清國粹派》，北京師範大學出版社1993年版。
《弘一大師李叔同講演集》，中國廣播電視出版社1993年版。
楊鵬程、左雙文主編：《20世紀中國史》，河北人民出版社1993年版。
《文廷式集》，中華書局1993年版。
朱有、高時良主編：《中國近代學製史料》，華東師範大學出版社1993年版。
《胡適說禪》，東方出版社1993年版。
巴伯：《科學與社會秩序》，生活·讀書·新知三聯書店1991年版。
王治心：《中國基督教史綱》，香港基督教文藝出版社1993年版。
《蔡元培選集》（上、下），浙江教育出版社1993年版。
《宋恕集》，中華書局1993年版。
任建樹、張統模、吳信忠編：《陳獨秀著作選》（1—3卷），上海人民出版社1993年版。
李向平：《救世與救心——中國近代佛教複興思潮研究》，上海人民出版社1993年版。
唐文權：《覺醒與迷誤——中國近代民族主義思潮研究》，上海人民出版社1993年版。
倓虛：《影塵回憶錄》，上海佛學書局1993年版。
楊曾文主編：《當代佛教》，東方出版社1993年版。
朱謙之：《中國景教：中國古代基督教研究》，東方出版社1993年版。
唐逸主編：《基督教史》，中國社會科學出版社1993年版。
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張誌剛：《貓頭鷹與上帝的對話》，東方出版社1993年版。
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王雷泉選編：《歐陽漸文選》，上海遠東出版社1996年版。
《林語堂文集》，作家出版社1996年版。
［美］蘭姆博士（Bernard Ramm）：《基督教釋經學》，詹正義譯，美國活泉出版社1996年版。
吳汝鈞：《佛學研究方法論》，（台北）學生書局1996年版。
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江燦騰：《明清民國佛教思想史論》，中國社會科學出版社1996年版。
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薑玢編選：《革故鼎新的哲理——章太炎文選》，上海遠東出版社1996年版。
林金水：《利瑪竇與中國》，中國社會科學出版社1996年版。
顧衛民：《基督教與近代中國社會》，上海人民出版社1996年版。
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