新中國成立後，在精簡陸軍的基礎上，組建了炮兵、裝甲兵、工程兵、鐵道兵、防化兵、通信兵、防空兵七個兵種，人民解放軍由單一兵種向多兵種合成邁進，王諍被任命為通信兵司令員。
建國後的朝鮮戰場、越南戰場，針對美軍對我通信雷達等裝備的電子幹擾，王諍親自率領技術人員赴第一線考察，研究對策，並在通信部設立了電子對抗部門。王諍親自決斷生產靠近美航空電台頻率的“71”型電台，成為誌願軍的主要通信裝備。
60年代初期，美製U-2飛機屢屢侵犯我領空，進行空中偵察活動，王諍親自研究解決我軍導彈製導的相關技術難題。1963年11月，王諍得悉我軍第二次擊落U-2飛機，立即帶領技術人員前往現場，查看飛機上的通信電台，並研製對口設備。此後幾次擊落U-2偵察機，就是王諍組織科研、生產和使用部門研製相應設備的成功戰例。
“**”中，王諍受到衝擊和迫害。1970年11月14日，毛主席批示：“王諍是有功的，對他的處理要慎重。”在周總理的直接過問和親自安排下，王諍從河南葉縣幹校回到北京，1972年6月毛澤東在政治局會議上提出“盡快安排王諍工作”。
1972年7月，在周恩來、朱德、葉劍英等的關懷下，中央重新任命王諍為四機部部長、黨組書記。就在還沒有全麵恢複工作的時候，王諍受葉劍英元帥委托再次出征，他帶領科研人員赴廣西、海南島和南海艦隊考察我軍雷達抗幹擾情況，隨後主持召開電子對抗工作座談會，向中央軍委提出發展電子對抗事業的對策建議。毛澤東收到報告後非常重視，立即批示國務院、中央軍委成立電子對抗和雷達管理領導小組，在軍隊建立負責電子對抗的專責部門，王諍兼任部長，由此，我軍的電子對抗事業進入新的發展階段。
由於多年積勞成疾，在1977年初的時候，王諍已是癌症晚期，他自知來日不多，更是把有限的精力全身心投入到電子對抗事業中去，直到生命的最後時刻，他還關心著我軍電子對抗事業的發展。王諍在病重期間，總結了“關於電子工業28年重要經驗教訓”報軍委秘書長羅瑞卿轉呈中央。病**說話已很困難的王諍，向前來探望的王震同誌表達的仍然是對電子對抗事業的高度關心。
近些年來，在海灣戰爭、伊拉克戰爭和阿富汗戰爭中，美軍電子戰顯示的威力震驚世界，一些長期從事雷達工作的技術人員感歎說：“真正頗具遠見地看到電子對抗在今後戰爭中的重要作用，並嘔心瀝血、兢兢業業、克服各種阻力為之奮鬥的是王諍同誌，更確切地說，他是這一事業的奠基人。”
在我國自行研製的宇宙飛船遨遊天空之際，人們不由想起王諍為開創我國航天事業建立的功勳。1956年4月13日，中央成立航空工業委員會（國防科委前身），聶榮臻任主任，王諍擔任委員，導彈研究院（即國防部五院）成立後，王諍任副院長兼黨委書記，中國航天事業能有今天的成就，王諍有不可磨滅的貢獻。在慶祝我國航天事業創建35周年之際，當年國防部五院首席顧問、92歲高齡的蘇聯將軍什那金來京參加活動，聽到王諍已去世多年的消息，什那金專門去八寶山獻上一束鮮花表示敬意。