丙子，清騎闌入，洪承疇、盧象昇俱率師入援。事平，即命承疇總督薊保，象升總督宣大。至是，上念流賊交訌，從廷臣議，以承疇專任關外，升薊撫，吳阿衡總督薊保，象升專任剿賊，起升陳新甲總督宣大。新甲亦守製家居，武陵欲援以自解，會推時，即奉有“不拘在籍丁艱”之旨，而後推及之。少詹事黃道周連上三疏：其一言楊嗣昌不當奪情入閣。其一言寧錦巡撫方一藻撫賞事，與上年俺答不同，不得援為口實。其一言不當又奪情用陳新甲於宣大，如無人肯往，臣願任之。時七月乙巳，上召廷臣於平台，問道周曰：“朕聞無所為而為者，謂之天理；有所為而為者，謂之人欲。爾前疏適當枚卜不用之日，果無所為乎？”道周對曰：“天下止有義利，臣心為國家，不為功名，自信其無所私。”上曰：“前月推陳新甲時，何不言？”道周對曰：“時科道何楷、林蘭友皆有疏，二臣臣同鄉，恐涉嫌疑耳。”上曰：“今遂無嫌乎？”道周對曰：“天下綱常，邊疆大計，失今不言，後將無及。臣所惜者，綱常名教，非私也。”上曰：“清雖美德，不可仿，自是惟伯夷為聖之清，若小廉曲謹，是廉，非清也。”道周對曰：“伯夷忠孝兩盡，故孔子許其仁。今楊嗣昌雖有小才，然古者惟門庭之冠，不得已而以吉禮從金革，故有奪情之事。今用嗣昌於本兵，猶可藉口於金革；近用嗣昌於政府，則禮法之所不容。天下未有不父其父而可稱為子者，未有不能孝於親，而能忠於君者。”嗣昌出班奏曰：“臣非生於空桑，豈遂不知父母？臣嚐再辭，而明旨迫切。道周學行人宗，臣實企仰之。近疏謂不如鄭曼阝，臣始太息絕望。鄭曼阝杖母，行同梟獍，道周既不如曼阝，何言綱常也？”道周曰：“臣言文章不如鄭曼阝，非謂品行。”上怒曰：“此皆是矯辭飾說，顯是朋比。”道周對曰：“眾惡必察，臣何敢？”上曰：“孔子誅少正卯，當時亦稱聞人，唯行辟而堅，言偽而辨，不免孔子之誅。”道周對曰：“正印欺世盜名，臣無其心。今日不盡言，則臣負陛下；今日陛下殺臣，則陛下負臣。”上怒曰：“爾讀書多年，礻氏成佞耳。”道周對曰：“忠佞二字，臣不敢不辯。夫臣子在君父之前，獨立敢言者為佞，豈在君父之前，讒諂麵諛者為忠乎？忠佞不分，則邪正混淆，何以致治？”上怒甚，曰：“祖訓：辯言亂政者當斬！”道周曰：“臣若有當斬之罪，願就司寇，聽陛下處分！”上曰：“原不專指佞，但辯言亂政者，按祖訓當斬！”遂諭道周且退。上複麵諭諸臣，今後慎毋黨同伐異，各恪修職業。次日，複頒諭申飭。時修撰劉同升、趙士春合上疏論嗣昌奪情事，與道周俱下部議處。部覆降三級照舊。禦劄道周票輕處，同升、士春票重處。嗣昌懼上將複用道周者，急募人參之。於是張若麒應募，遂上《擁戴不效怨望紛然疏》入，同升、士春降三級，道周降六級，俱調外矣。後嗣昌借邊警調若麒於兵部，蓋酬之也。
丁醜鼎甲三人，劉、趙與陳之遴也。初上奪情疏，擬三人聯名，之遴辭不預。次年，遴父祖苞以失事自盡，遴以犯屬閑住，則何如列名之為愈也。南海辭列名，而得入綸扉，之遴辭列名，而終歸罷斥。同一畏首畏尾，而幸不幸有如此者。
刑部主事張若麒《擁戴不效怨望紛然疏》，略曰：
“頃者皇上憂軫時艱，不憚勞煩。召對之後，大布王言。諄諄然以正人心息邪說，為治天下之大本原，舉黨同伐異之隱情，招權納賄之狡術，無不見其肺肝，直為道破。而辟邪一義，尤為千古之聖帝名王所未嚐發，一時之端人正士所不能言，直如日月當天，妖狐莫遁，謂宜大家洗心，以副明旨。何意諸臣之藐旨，捏造奸言，歸過皇上，而無天無地無父無君至此極也。以臣所聞，數日以來，天諭既頒，群黨藉藉，或擲抄傳之邸報而怒視，或引不倫之遠事而詆議。通宵聚眾，信口譏排未已也。至有謂召對之日，黃道周犯顏批鱗，古今未有，而皇上為之理屈者；至有謂道周堅求一死，而皇上左顧言他，始終無如何者；至有議諭注灑，何故亦作對偶者；甚至有謂聖諭中邪說依經一段，不出聖裁者。紛紛攘攘，日改月增。要使古今未有之好語，盡出自道周之口；凡可以歸過皇上者，無所不至。蓋倡之者飭六藝以文奸言，假托道理以把持朝廷，以顯行其呼朋引類之計。於是，記誦博者附之，不博者亦附之，甚至不辨菽麥、墨汁全無者亦附之，興為怙權納賄之地。而特聞皇上下項門之針，遂大家喊叫，謂老魔之赤幟既拔，山魈之穢態難藏。嚇騙不靈，溪壑無幸，遂至潑口橫加，毫無顧忌。倘不亟示前日召對之語，宣錄刊傳，與新頒聖諭，共為日星之揭，則背公死黨，實繁有徒。或鼓煽以惑四方，私記以疑後世。致名朋串附勢之史臣，徇私載筆。皇上正人心息邪說一段治天下之大經大法，且為怨望者埋沒遮掩矣。伏乞皇上始終為世道人心計，深思遠慮，速賜施行。雖備員末秩，亦仰荷皇上生成之恩，何忍畏其凶鋒，雷同不言也。”
宋林希點製誥，凡元礻右名臣貶點之製，皆極其醜詆。一日，草製罷，擲筆於地曰：“壞名節矣！”若麒此疏，何以異是？然使此疏出而總憲塚可以力致，尚斷斷不可，況區區一兵曹耶。小人枉做小人，千古同歎。
若麒與沈迅既授刑部，不與諸司官齒。本司缺郎中，員外某署印，奉差辭朝，送印於迅，迅大怒罵之，擲還其印。員外懼，泣訴於堂委別司署焉。若麒既出疏逐道周，嗣昌已許調兵部，久不得耗，乃親詣職方郎中趙光抃促之。次日，諸臣畢集，揖嗣昌畢，光抃出班請曰：“本司現有缺員，聞得老先生要調二人來。”嗣昌佯驚曰：“那有此事？”光抃曰：“昨日其人親到本司向郎中言，老先生要調他，並他同部姓沈者。四司官俱在，所共目擊，可詢也。”嗣昌色變曰：“這等我要參他！”光抃唯唯而退。
若麒、沈迅，既營求嗣昌，量調有日矣。適禦史塗必泓疏言：“刑部所司者民命，而人往往厭薄之，是以十三司官，強半皆鄉科任之，偶有一甲科，則輒調別部，豈司民命者當專用不肖乎？請自今著為令：刑部官不許更調別部。”奉旨申飭。若麒憤無所泄，乃上《平賦役節驛遞》一疏，謂“鄉紳隱匿賦役，遺害小民，以致民窮為盜。”內有“鄉紳豺虎”等語。驛遞，謂裁削勘合，歲可得百五十萬銀兩。有旨：“本內‘鄉紳豺虎’等語，著據實回奏。”若麒回奏，指莊應會、範良彥、袁宏勳。範、袁皆地方所最切齒，而宏勳尤護持逆黨者。有旨：“俱行撫按逮問。”初，麒之出疏也，專為同鄉侍郎高宏圖而發，及回奏，即擬宏圖以入告。或語以宏圖立朝大節，忤璫去位，萬萬不可指及。麒不得已，乃指應會三人。然麒之為此，實激於必泓之疏。必泓與楊廷麟，同鄉同年。鹹謂塗疏楊實使之，後張、沈與嗣昌比加修怨廷麟者，禍亦烈矣。
武清侯李誠銘，慈聖內家也。上在信邸時，以緩急開罪，後借事繩之以法不少貸。誠銘卒，其子不準承襲，房產俱行入官內。一女字嘉定伯周奎之孫，嘉定請命於後，後諭雲：“人當患難，自無絕婚之理，可具小轎，但取此女婦，外慎毋夾帶。”諸戚畹合辭申請不允。後悼靈王臨危，親見慈聖於宮中，上大悔悟，即準其子襲爵，房產、祿米仍舊頒給焉。
上初年崇奉天主教。上海，教中人也。即入政府，力進天主之說，將宮內俱養諸銅佛像盡行毀碎。至是，悼靈王病篤，上臨視之，王指九蓮華娘娘現立空中，曆數毀壞三寶之罪及苛求武清雲雲。言訖而薨。上大驚懼，極力挽回，亦無及矣。時閣臣皆從外入，素不諳文義，上既痛悔前事，特頒諭內外，有“但願佛天祖宗知，不願人知也”等句，幾不成皇言矣。“宰相須用讀書人。”初年上曾舉以諷諸閣臣者，可勝三歎。
京師天主教，有二西人主之，南懷仁、湯若望也。凡皈依其教者，先問汝家有魔鬼否，有則取以來。魔鬼，即佛也。天主殿前有青石幢一，大石池一，其黨取佛像至，即於幢上撞碎佛頭及手足，擲棄池中，候聚集眾多，然後設齋邀諸徒黨，架爐鼓火，將諸佛像盡行熔化，率以為常。某年六月初一日，複建此會，方日正中，碧空無纖雲，適當舉火，眾共聳視，忽大雷一聲，將池中佛像及諸爐炭盡行攝去，池內若掃，不留微塵。眾皆汗流浹背，鹹合掌西跪，念阿彌陀佛。自是遂絕此會。
史{範土}疏黨類陷臣已極事，內辯周汝弼營升延綏巡撫，係太常寺卿許世藎說情。奉旨：“史{範土}方在究問，何得瀆陳？奏內說情緣由，還著許世藎、田唯嘉據實具奏，不許遊移支飾。”先是，史{範土}得提問之報，隨即赴京，潛入韓城邸中，連住三日，乃始投部上此疏。後世藎回奏，隱約其辭，但引陝西巡按王俊相對之言為證。有旨：“著王俊實奏。”及俊回奏，則事已結案久矣，遂奉“姑不究”之旨。然世藎實未嚐說情也。
史{範土}下獄後，又上《直發朋黨奸貪之狀疏》，內雲：“鹽課現經內臣楊顯名徹底清查之後，割沒清楚，足見臣之心跡。而楊士聰之誣捏陷臣，亦昭然矣。”又雲：“張焜芳，乃內閣中書張炳芳之兄也。向來旨意露泄，皆炳芳為之，即焜芳參臣及內臣楊顯名，亦恃奧援有人，布置關通，有炳芳在耳。”又言：“炳芳弟煒芳，以長史謀升同知，包攬知縣虞國鎮考選，騙銀一萬三千兩，托餘伯和送與科臣馮元飆八千兩，令其把持台省。餘銀入己三千，伯和二千”等雲。疏上，數發改票後，擬“元飆、士聰俱革任，煒芳、炳芳俱革任提問。”複發再票，禦筆批雲：“此案不欲牽累。”乃止票“炳芳俱革職候訊，伯和提問。”此疏實出黃應恩。應恩素與炳芳有嫌，而“較書”一事，又與士聰有隙，故構造此疏以相陷也。後士聰上《軍興需餉正殷疏》，有旨：“史{範土}事情，該部速審具奏，楊士聰不許再瀆”。士聰再疏，遂奉“不得更端求勝”之旨。蓋史{範土}之布置已周，聖意亦潛移矣。
時史{範土}既恃內援，複有韓城主之於外，獄中連上疏催審，且請將楊士聰、張焜芳令該部提去，與伊麵質。而淮鹽運使徐大儀與史{範土}同年相好，自奉行查之旨，已先諭吏書，竭力彌縫，不待{範土}幹仆之來也。惟交際六萬兩，則不得而掩。內監楊顯名回奏，事事出脫。至交際一項，則雲：“臣不能為諱。”以故{範土}久稽獄中不得出，竟憤恨以死。迨{範土}死而事敗，則實天為之也。
刑部上黃應恩招，奉旨：“黃應恩哆口招搖，實有事款，何得聽其支飾盡為開豁？該司官殊屬縱徇，著將回話來，仍一麵嚴訊確擬具奏”。先是，應恩下部，黨羽甚盛，部招搖諸款，概不敢入，止引泄一品語律，致奉此旨。司官再問，不得不入事款及贓。應恩突出疏參之，司官大懼，乃上疏乞敕三法司會問。夫以罪犯而參司官，與史{範土}請題楊士聰、張焜芳到部麵質，事雖不行，而兩人之虎視獄中可知矣。後再擬上，有旨：“黃應恩發附近衛所充軍終身。”
刑部上田敬宗招，奉旨：“周汝弼推撫情由，竟未訊明，但憑飾抵；傅蒙庥衛招已實，又聽改口展辯。且田敬宗等違法濫受多贓，僅擬配徒。骫縱殊甚，通著研訊確擬具奏！”及再上擬：“田敬宗附近、田登第等邊衛各充軍終身，贓追充餉。”有旨：“依擬。”
十月，清騎入犯薊，昌，總督吳阿衡與鎮守太監鄭希詔稱壽，已報清人入口矣，猶堅留與鄭公飲百杯，取百籌之慶。飲畢，醉不能師，遂死於亂軍中。北兵盡入。樞輔楊嗣昌上《四事機宜疏》：“請於卿士科道等官，不拘常格，推補臣部左右侍郎，其久推不至者，候其到日，於別衙填補。”末雲：“職方一司，紋冗已極，特設協理員外，分任其勞。而餘爵蒞任無期，請以武選主事孫嘉績升補。而武選車駕主事漆嘉祉等音訊杳然，請敕下吏部，遴選別部有才望者，速行調補。”次日，吏部題補沈迅調武選、張若麒調車駕。而所雲久推不至者，吳莘、惠世揚也。
十一月初八日，召對，初無詞林，而詞林畢集，有內奄奏之，乃俱召入。給事中範淑泰奏：“今於臨城，尚無定議，不知是要款要戰？”上曰：“那個要款？”淑泰奏：“外邊皆有此議論。”泰又奏：“凡涉邊事，邸報一概不敢抄傳，滿城人皆以邊事為諱。”上曰：“凡關係機密的不許抄傳，若行間塘報，如何一概不許抄傳？”蓋是時，武陵私謀款局，實並塘報一切禁止，自是長安始敢言邊事矣。是日召對，意在憂餉。大理寺丞戈允禮倡言借貸，欲括城中富人金錢。淑泰奏：“兵事要在行法，今法不行而憂餉，即天雨粟、地湧金，何益於事？”上曰：“朝廷何嚐不欲行。”而微窺聖意，若有所躊躇而不能決者。先是，楊廷麟疏論武陵及高起潛，武陵特題改兵部，前往盧象昇軍前讚畫。是自己謝恩辭朝，故不預。而款市之議，武陵力請於上，上許之矣。武陵特遣使入□營，竟得嫚書，乃止。
時各道勤王兵至，宣大總督盧象昇至都城下，與武陵昌言朝端邪正不分，寇虜何時得靖。且雲：“權臣在內，邊臣豈能成功？”武陵雲：“若如此說，老先生尚方劍，當先從學生用起。”不樂而罷。時清兵越都城西掠，破高陽，舊樞輔孫承宗合門死難。破吳橋縣，知縣劉業嶸迎降，遂南掠至山東，象升南下，逐之。坐營副總兵李某請盧劄營於李家口，戒慎毋動，動必敗，清兵非流賊比也。而李自帥師逆清兵，已奏捷矣。盧聞捷，遽勒兵而前，遇清兵於賈村，全軍陷沒。事聞，上以督臣陳亡，坐營不行策應，逮問論斬。邊將祖寬，素以憨直得罪當事，與李俱逮問大辟，人鹹冤之。武陵題楊廷麟之讚畫也，實欲假手於清兵殺盧。未出師之前，遣廷麟至真定，與陝撫孫傳庭議事，不及於難。及敗衄報至，武陵首先問曰：“楊翰林死未？”報者止知讚畫，不知翰林為誰，武陵乃再問曰：“楊讚畫死未？”報者答以“已先奉差，不在營中。”武陵為不豫者久之。嗚呼！此即曹瞞殺禰衡之故智，究竟廷麟不死於陳，而武陵竟死於賊，孰謂無天道乎？
時畿內州縣，清兵所至輒陷，兵部主事沈迅上疏條陳邊務，一雲：“州縣無重臣彈壓，故清兵所至不能堵禦，請與定州、蠡縣、廣平、河間，各添設兵備一員。”一雲：“以天下僧人，配天下尼姑，編入裏甲，三丁抽一，朝夕訓練，可得精兵數十萬。”其餘條陳，別事甚多。武陵具覆，盛稱迅言之可用非止一端。而畿南添設兵備，尤為救時碩畫，且請改迅科員用。有旨：“沈迅作改兵科給事中，作速到任管事。”蓋迅時結大璫卞希孔為奧援，故武陵應之於外如桴鼓，遂取特旨如寄。
沈迅授科後，即疏薦張縉彥等為兵科都給事中。奉旨：“張縉彥著改任。”先是，姚思孝既斥，屢推未用，部議耀，複不果。至是，迅薦五人，首縉彥，次任濬、黃奇遇、塗必泓、張若麒，而所重者，若麒也。其薦語有雲：“廉則真廉，敏則真敏。”又雲：“其所上平賦役、節驛遞二疏，皆能言人所不能言”雲雲。而不意上竟點用縉彥也。縉彥到任，既疏恭武陵，又因召對及之。武陵語人曰：“沈宙泉到底還不老成，如此看來，不若從部議用徐蓼莪，或能相為，也不見得。”夫朝廷用一人，一手握定，惟意所欲與，既與而又悔之，武陵之橫至此哉！
是年正月，張獻忠假官軍旗號，暗襲南陽，屯於南關，左良玉適至北關，疑之，使人召之，獻忠窘，逸去。良玉追及之，兩馬相望，一箭中其肩，一箭中其指於弓靶，獻忠倉惶，良玉舉刀劈其麵，血流被甲。部下孫可望直前大鬥，獻忠乃得脫逃至麻城。良玉進剿，獻兩日夜馳七百裏，至穀城，營於王家河，夜襲穀城，破之。出示安民雲：“本營誌在匡亂，已逐闖兵遠遁。本營今釋甲歸朝，爾百姓無恐！”遂拘耆老具揭。遣孫可望重賄熊文燦，內有西碧玉二方，長尺餘，又徑寸珠二枚。文燦遂一力擔當撫之。獻忠所部，不滿萬人，乞餉十萬人，又乞襄陽府屯軍，文燦遷延不能應，獻忠遂據守穀城，分屯群盜於四郊。二月，左良玉至襄陽，與巡按林鳴琳、巡道王瑞梅欲誘獻忠來見，殺之，文燦曰：“殺降不祥。”力持不可。獻忠恃文燦為援，益無忌。穀城諸生徐以顯，一見如故，教以孫吳兵法，私練士卒，鑄造兵器。雖婦皆知其必反。
二月，李自成陷蒼溪。時川中諸道兵嚴守險要，賊坐困乏食，賀人龍以弱卒誘，而設伏於梓潼。自成逐弱卒，卒走，伏發，殺賊數千級，幾殲之。自成率殘賊走溪南，擬入湖廣依張獻忠，不許。至竹溪，獻忠謀殺之，自成獨乘騾馳百裏，走商雒，至淅川老犭回犭回營，臥疾半年餘，老犭回犭回授以數百人，仍然入陝西剽掠。
六月，逮湖廣巡撫俞應桂，以方孔炤代之，以戴東撫治鄖陽。
八月，賊曹操會群賊過天星、托天王、整齊王、小秦王、混世五、整十萬、革裏眼於陝州，遂南走內鄉、淅川、犯襄陽。九月，熊文燦遣副總兵龍在田等邀擊革裏眼、射塌天於雙溝，大敗之。老犭回犭回等俱東走棗陽，官軍追逐數十裏，斬首六千餘級，群賊披靡四竄，獨曹操仍留內、淅山中。十月，陝西巡撫孫傳庭帥師入衛，諸將先後出潼關。曹操謂為剿己也，走均州，叩太和山提督太監李維政乞撫。維政為言於文燦，文燦乃檄止諸軍，曹操九營皆就撫。文燦為具疏請貸其罪，令諸將宴之於迎恩寺，授官遊擊將軍，供億甚備。曹操者，羅汝才也。汝才既受撫，分屯群賊於房、竹諸縣，文燦令散脅從諸眾，簡選驍壯，從征立功。汝才不聽，自言不願受署為官，並不願食餉，願為百姓耕種。文燦一切羈縻之，與張獻忠遙為聲援，奪民禾而食，不奉縣官治。
十二年己卯正月，清兵陷濟州，德王遇害。巡按宋學朱，布按道府張秉文、翁鴻業、荀好善，推官陸燦等，或死或逃。報至，舉朝震恐。先是，沈迅條陳，有“東撫不許離德州一步”之語，張若麒力持職方司，為之案呈，武陵即據具覆。東撫顏繼祖認定信地，僉謂清兵無越德而南之理。至是，清兵由東昌而東南渡河，破恩縣、夏津，直趨濟南。濟南精兵既盡在德州，城中無備，當事又無方略，民潰，遂陷。德州聞省城陷，兵心忄匡擾，鼓噪挾餉，幾至大變。繼祖懼，即以數千金塞其望，而兵遂不可用。繼祖具疏待罪，申言原派“不許離德”之語。武陵特出疏力排其說。清兵退，繼祖與順天巡撫陳祖苞、保定巡撫張其平、總兵祖寬、太監鄧希詔，俱逮下獄；大學士劉宇亮罷。時清兵縱橫燕、齊間，宇亮自請督師，與陳新甲並轡而南，各鎮勤王兵皆屬焉。時將卒皆視清兵所向以為趨避，惟蹂踐居民以為事。綿竹至安平，偵者報清兵大至，上下相顧無人色，相擬即趨晉州以避之。知州陳宏緒堅閉城門不聽入，而城中士民，亦歃血而誓，不得延入一兵。綿竹大怒，傳令箭：“急開門以納師，否者以軍法從事！”宏緒複語：“督師之來，欲剿清兵也，今清兵且至，正督師建功之會，奈何急欲人城？若芻糧不繼，州官罪也；若欲入城，不敢聽命！”綿竹遂疏劾之，有旨：“逮問。”晉州士民，詣闕訟冤，願以身代州官，死者千餘人，宏緒乃得輕降四級調用。上始疑綿竹不能禦眾，徒擾民矣。
時行間大帥，俱尾清兵之後，不敢擊亦不能擊，綿竹具疏言之，其末帶參劉光祚。韓城與武陵謀，欲因此事去綿竹，乃票光祚：“軍前正法。”旨到之日，諸大帥俱分道前去，並光祚亦不在軍前。況綿竹之參光祚者，原不至死，適會有武清之捷，綿竹乃置光祚於武清縣獄而複請之，並上武清捷音，於是奉旨：“倏奏倏敘，殊屬乖藐，著九卿科道看議。”綿竹具疏引罪，言：“乖則乖矣，藐則萬萬不敢。”蓋兩人明知聖旨往還之間，必致參差，必不能正法，而逐綿竹，知計行矣。部覆：“綿竹冠帶閑住。”陳啟新言：“看重議輕。”沈迅言：“明旨森嚴，考功之發未盡。”於是部議“革職為民。”韓城票旨，仍候事平另議。嗟乎，此案韓城與武陵主謀，排擠構陷甚巧，故明旨止言“看議”。而加以議處，附之者猶以為未足也。啟新不足道，彼沈迅者，由武陵薦用，而顯然出力為武陵排斥異己，誠不識世間廉恥為何物矣。究之五案定而綿竹奉旨免議，上亦知其無大罪也。彼韓城者，獨何心哉？
上傳任丘、清苑、淶水、遷安、大城、定興縣知縣白慧元等“貪酷縱肆，俱著革職提問。撫按官不行糾劾，溺職殊甚，近畿如此，遠地可知，著部院申飭。”
慧元令任丘，璫某，任丘人也，邀慧元飲酒半，盡陳諸寶玩以供鑒賞。慧元曰：“我有至寶，大異於是！”璫問何寶，慧元笑不應，璫固問之，慧元曰：“我腰下有至寶耳。”璫默然，遂羅織其事款入告。又慮人議其修私怨也，並羅及清苑等縣。慧元罷，而新知縣李仲熊即蒞任。清兵攻任丘，慧元善騎射，協同仲熊固守，城陷，俱死之。
山東巡撫缺，東省諸人，公討泰州兵備鄭二陽。蓋二陽於流賊南犯時，城守蓋勞者也。往例：本省撫道缺，本省鄉紳向部公討。此相沿舊習，間亦有為私者。至是，沈迅獨糾太仆寺少卿王萬象私討巡撫，以修舊怨，遂奉把持亂政之旨。萬象大懼，回話之辭甚遜，然實無私討情弊。乃得旨：“冠帶閑住。”而沈勢益張。後迅與若麒共言於吏部，用永平兵備劉景曜巡撫山東。自是山東諸事，皆由二人握定矣。若麒又引其兄若獬為吏部，而以假谘離任。事敗，則又謀事在人，成事在天也。
文武官品服色，祖製既定，奉行已久，惟是武弁概服獅子。上至是重行申飭：“武弁三四品，俱照製服虎豹。”至內奄從無定式，蓋直擯之灑掃服役之末，祖製良有深意。雖太監極品，止於正四品，間有賜蟒玉者，亦後來之濫觴，非祖製也。至是，上命取《山海經》以進，采取各種獸名，另定服色，以天錄為極品。說者謂天子左右，環列異獸，蓋不祥也。
上又將內庫曆朝諸銅器，盡發寶源局鑄錢。內有三代及宣德年間物，製造精巧絕倫，商人不忍舊器毀棄，每稱千斤願納銅二千斤。監督主事某不可，謂：“古器雖毀棄可惜，我何敢私為輕重？”商人謂：“宣銅下爐，尚存其質，至三代間物，則質清輕之極，下爐後，惟有青煙一縷爾，此則誰讓其咎？”監督謂：“聖性猜疑甚重，若如公言，必增聖疑，如三代物不便下爐，則有監督內官，公同驗視，罪不在我。”於是古器毀棄殆盡。
凡遇新天子嗣位，另造琴百張，每張價五百金，此相沿舊例，其事則禦用監司之。真金徽玉軫也，然有音無文。至今，上以無文為嫌，欲更製琴曲，而莫有能應者。從父適以謁選入都，中書楊崇善係長洲籍，稱同鄉，即邀至其家，為製譜以進。韻義鹹備，上閱之稱善，從父已就選州二矣。奉旨：“文震亨著改授中書舍人，武英殿供事。”
上禦極後，周皇後正位中宮，複選東宮田妃、西宮袁妃，而田最有寵，其父田宏遇亦最橫，後父周奎次之，袁父則兢兢自守，不預外事。上每戒諭外戚，必三人同召。一日，複召，袁語二人：“學生不敏，奉陪多次矣。今後還求兩先生包容，免賜提挈。”周、田不能應，皆有慚色。
璫某與小襄城及秀水諸人善，璫有母稱壽，秀水拉諸同人往賀。甫登其堂，則璫母已巍然端坐，璫侍其旁，曰：“太太年老，不能行禮，小弟代為答拜。”即先下拜。秀水輩相顧錯鍔，不得已，頓首再拜而起。嗚呼！比之匪人，不亦傷乎？守孰為大？守身為大！雖一舉足間，可不慎乎？特書之以為戒。
七月，戮失事諸臣於市：保定巡撫張其平、山東巡撫顏繼祖、總兵祖寬。太監鄧希詔，臨刑肆口訕上，極其無狀，聞者鹹為發指。而順天巡撫陳祖苞，預服毒自盡獄中。恩縣知縣王應元等，亦以失守被刑，劉業嶸以迎降故，詔“謀叛律，決不待時。”妻子入官為奴，家產籍沒，父母兄弟流二千裏安置。而祖苞子編修之遴、繼祖弟監事光祖，俱以犯屬罷斥。先是，顏抵東撫任後，連疏參劾前撫李懋芳，至於逮問，眾論鹹不直之。至是，以失事服法，所謂還中以機者乎？
清兵既退，升陝西巡撫孫傳庭為薊保總督。傳庭佯稱耳聾，不能任事。有旨，責其托病規卸，逮係下獄。順天巡撫楊一雋，以撫同欺隱，亦被逮。
時綿竹、進賢相繼罷去，複當枚卜，上點用黃岡姚明恭、費縣張四知、滑縣魏炤乘三人，俱入閣辦事。
八月，庶吉士鄭曼阝淩遲處死。先是，鄭曼阝下獄，衛帥吳孟明謂：“按律，忤逆惟父母告乃坐。今曼阝父母皆亡，其事又遠在數十年之前，不可究竟。”烏程乃以特授科道為餌，如陳啟新例。於是同裏中書許景應募上疏，證其杖母，並及奸妹、奸媳等事。有嚴旨切責：“吳孟明不能治獄，著革任回衛。”至是獄具，遂磔於市。科道各官，以不行糾發，一概議處，俱降級有差。孟明奉譴後，上疏言：“鄭曼阝世遠人亡，皇上必欲立置重典以風示天下。近常州有錢霖父子戕殺之事，遠近駭聞，許景既仗義發憤，何舍目前之錢霖，而追已往之鄭曼阝？”有旨：“逮錢霖同其子尚賓，赴京驗審。”蓋尚賓以祖尚書春蔭官應天通判，霖係庚子舉人，相爭一侍女，遂揮刀刺其父，中腋，業已輸重賄求和矣。而刀痕儼然，無計可掩。逮至中途，止德州宿，假寓草庵，夜半，縱火焚其庵，預藏一屍於灰燼中，遂以尚賓失火被焚，朦朧入告。旨下：“地方官查明。”武進知縣馬嘉植以入覲行，知府陳申結，稱“尚賓委係焚死”複奏。而尚賓竟逃入太湖中，馬嘉植物色得之。因尚賓家奴，歸取盤費，遂執其奴為導引，掩而取之，申解撫按，轉詳法司：“尚賓決不待時，錢霖遣戍，陳1為民。 ”然馬之為此，亦非能仗義也。向以刻薄殘忍，見譏於陳，故為此舉以傾陳而泄私恨也。陳為壬戌進士，筮仕合肥知縣，崔呈秀巡按淮揚時，首薦。呈秀敗，陳投誠至戚蔡弈琛，得以考察薄罰，曆升今官，與馬不相能。馬在任，唯趨事要津，視監司部郎蔑如也。曾以事處鄉紳鄒忠允過當，朱大典，鄒門人也，適來督撫鳳陽，鄒持往控訴，朱為具疏參馬。馬知之，急挽許鼎臣求解。許曾巡撫山西，朱其屬吏也。許竭力調停，事得中寢。未幾，許棄世，遺孤幼弱，馬視之如陌路。陳以此薄其為人，每以刻薄殘忍目之。馬故恨之刺骨雲。
中書朱紳，相國國楨子也。昆山朱大受，為湖州知府，與紳相惡，紳特疏參之。眾議以鄉紳參地方官，不可為訓。且紳又任子，鹹不直之。紳又不達，連章疊上第四疏，奉旨：“廷杖。”遂斃杖下。
上之初即位也，編修江鼎鎮疏參順慶知府楊呈秀，有旨：“革職提問。”鼎鎮，四川南袞人，為楊部民，眾論亦不與之。己巳內計，鼎鎮例轉福建右參議。
歲底，上於宮中符召天將。宮中每年或召仙，或召將，叩以來歲事，無弗應者。以前一召即至，至是，召久之不至。良久，帝下臨，乩批雲：“天將皆已降生人間，無可應召者。”上再拜叩問：“天將降生，意欲何為？尚有未降生者否？”乩批雲：“惟漢壽亭侯受明深恩，不肯下降，餘無在者。”批畢，寂然，再叩不應矣。
各省俱有督糧道，江南則以兵備兼理。崇禎元年冬，崇明營兵缺糧，知府王時和勒措不發，遂鼓噪，巡撫曹文衡查“為首者處死。”時和劾罷。因請於朝，欲特設一道臣，專理四府錢糧，如布政事例。吏部不達其意，題：“準設四府督糧道專理漕糧，既非具疏本意，而增一官，即增種種費，徒勒民耳。”
時流賊充斥蘄、黃間，應撫當移鎮安慶，以防侵軼。四府縉紳又謂：“江南重地，不可無大臣彈壓。”於是部題：“添設安慶巡撫，以安慶兵備史可法為之。複設偏沅巡撫，以河南布政陳睿謨為之。”是年二月，左良玉大敗河南賊飛山虎、劉國能於許州，國能降。老犭回犭回既東奔，複糾革裏眼、射塌天等合於混十萬，分掠信陽、光山間。河南巡撫常道立削籍，以李仙風代之，逮總兵張任學。辛卯，左良玉擊射塌天、老犭回犭回、混十萬於河南之鎮平城，大破之，射塌天乞撫，仍連營百裏，奪民二麥以自給。良玉遣人諭止之，不聽。戊申，良玉率副將陳永福、金聲桓等壓賊壘而軍，賊倉卒接戰。官兵奮擊，斬首二千七百，賊退保山、陝，良玉遣降將劉國能招之。庚戌，射塌天率其眾四千詣內鄉，降於良玉。塌天，即李萬慶也。良玉為言於熊文燦，文燦署國能、萬慶皆為遊擊將軍。革裏眼等走商城。
六月，張獻忠住劄穀城，知縣阮之鈿竭力調護，士民賴之。至今春，叛形顯著，左良玉請乘其未備討之，文燦不可。至是，果叛。之鈿瀝血書絕命詞於襟，仰藥死。良玉發兵進討，熊文燦故張露其事，且強留左良玉飲餞，稽延旬日，俾獻忠得預為備，獻忠乃得從容運器甲資糧入房山，布署已定，文燦始令進兵。良玉怒曰：“督台縱虎負，使我攖之，不去，必以逗逼罪我。”令旗至，即冒暑進討，獻忠設伏於羅猴山，良玉兵度險入伏中，賊四合圍之，良玉全軍盡沒，並失其符印，僅收殘兵百人逃歸。遂列文燦事於朝，樞輔楊嗣昌具疏劾之。有旨：“文燦逮問，良玉革職，殺賊自贖。”後文燦逮至，戮屍西市。嗣昌方以議款不就，無以仰副聖眷，而文燦又嗣昌所舉也，乃請剿自效。上為賜宴賜坐，複賦詩以寵其行。禦詩曰：“鹽梅今日作幹城，上將新開細柳營。一掃寇氛從此靖，還期教養遂民生。”所以寵之者至矣。嗣昌謝恩畢，馳至武昌，申明軍令。見良玉部下多降將，可倚以辦賊，特疏請於朝，拜良玉為平賊將軍，升永州推官萬元吉為監軍僉事。
十月，老犭回々、革裏眼、左金王等合二萬人，分屯英、霍、潛、太諸山，犯安慶、桐城等處，遼將黃得功、川將杜先春屢戰卻之。
十三年庚辰正月，大計群吏。湖州知府朱大受，屢為朱紳所劾，特行賄於吏科都給事中阮震亨以祈免，為廠役所獲，並緝臨江知府胡永清等營賄事款。於是震亨等俱下鎮撫司究問。
二月，會試天下士，命大學士薛國觀、蔡國用為考試官，取中教諭楊瓊芳等三百名。
韓城、金溪，皆以外僚入閣，從無文采。楊瓊芳係揭陽教諭，而以壓榜，此三百年所無者。楊卷在某房中，同考編修韓四維見之，曰：“會元在是矣。”徐簡討取文閱之，曰：“此必苜蓿先生也，不然，必是老貢生。”及拆號填榜，果係教諭，合堂愕然。韓城俯首無言。吏停筆候命，韓城躊躇良久，仍舊用楊。
三月，廷試策士，賜魏藻德、葛世振、高爾儼等進士及第出身有差。又廷授顏渾等吏科給事中、禦史等官。
是日，上召對策進呈者四十八人於文華殿。上問：“邊隅多警，何以報仇雪恥？”魏藻德對曰：“以臣所見，使大小諸臣皆知所恥，則功業自建。孔子論政則曰‘知恥近乎勇。’論士則曰‘行已有恥。’孟子亦曰‘一人橫行於天下，武王恥之。’故勾踐豢馬以沼吳，燕昭式蛙而滅齊，皆知恥之明效也。”因自列戊寅通州城守功狀。上心識之，拔為第一。而周正儒、宣國柱五人特授給事中，吳邦臣、魏景琦等五人特授禦史，顏渾特授吏部主事，田有年、盧若騰、錢誌騶、陳糸熏等特授兵部主事。時韓城拔無錫鄒式金為第一，上抑置二甲，楊瓊芳抑置三甲。韓城始失聖眷矣。
六月，大學士薛國觀免。韓城剛愎性成，敢作敢為，既與武陵比而擠去綿竹，遂正首揆，益無忌憚。凡閣中有所票擬，中書每於外庭傳示消息，已成定例矣。至是，韓城信任私人王陛彥，而怒老中書周國興、楊餘洪不為用，特捏泄旨事參之，兩人皆廷杖，斃杖下。兩中書家，皆密緝韓城納賄事件，以報東廠。又上召對時，曾語及朝臣貪婪，韓城曰：“使廠衛得人，朝臣何敢至是？”東廠太監王化民在側，汗流浹背，於是專偵其陰事，而史範所輦多金為布置地者，皆入韓城之寓。適史範死，周、楊二家力慫範家人詣廠出首，東廠即以上聞。有旨：“下錦衣衛嚴究。”於是錦衣衛提韓城楊、馬二長班鞫問，供吐過付之贓甚詳，而韓城一疏再疏，則雲：“楊士聰之參史{範土}，別有緣故。”又雲：“史{範土}曾參黨人袁崇煥等，為黨人所忌，故乘其丁艱而參之”雲。夫身在事中，又恐聖怒方赫，不辨己之受賄，而亟辨史{範土}受參之故，則真悍真愚矣。有旨：“著五府九卿議處。”已而，議處本上，有旨：“薛國觀著冠帶閑住。中書王陛彥著革了職，刑部提問。”
韓城等既去，複當枚卜，上點用德州謝■6A、井陳演。先是，田唯嘉罷斥，升南京右都禦史莊欽鄰為吏部尚書，欽鄰遷延半年不至，奉旨詰責，欽鄰調用，而特召謝■6A為吏部尚書。至是，■6A以原官、演以禮部侍郎俱入閣辦事。滑縣曾出德州之門，具疏讓位，於是德州位列滑縣之前。
十月，行刑禦勾決囚十二人，原任徐淮中河郎中胡璉預焉。胡璉，雲南人，戊辰進士。前年，以黃河衝犯泗陵，與河道總督劉榮嗣同逮。運河者，專以運漕艘，而黃河則兼護陵寢，設有通惠、張湫、徐淮、儀真四河道，複南旺、夏鎮二泉閘，皆以工部郎主之。三年一小挑，五年一大挑，費有編額，慮最悉也。而徐淮尤稱險要，時設打洪之役。神廟中葉，改浚落馬湖，漕艘盡由宿遷收口，不複走洪，而徐淮始專護陵寢矣。承平日久，惟俟春夏水澇漲發，足以際漕事，凡大挑小挑之費，俱入上下私橐。至是，黃河連年衝決，直犯泗陵，總督朱光祚、周鼎與榮嗣皆被逮。朱、劉皆斃於獄，周後以宜興力庇，免死遣戍。
逮薛國觀至京，賜死。先是，韓城出都，資重累累，用車至數百輛，東廠隨具事件密奏，聖心益怒。而史{範土}寄頓之贓，衛招甚明，給事中袁愷複疏劾其納賄諸事，與通賄刑部右侍郎蔡弈琛、左副都禦史葉有聲，並及吏部尚書傅永淳、侍郎林棟隆。有旨：“弈琛有聲，革職提問，永淳、棟隆閑住。”而私人王陛彥，雖已下獄，尚未成招。至是，特旨：“王陛彥著即會官斬決。”凡招具，或斬或絞，招內已定，奉旨止雲“即會官處決。”今陛彥招未具，裁自聖斷，故雲“斬決。”此旨從來所未有也。陛彥決而韓城複逮，逮至，候命私寓，而，“令自盡”之命下。時韓城已臥，家人報錦衣齎詔至，韓城蹶然曰：“我死必矣！”倉卒覓小帽不得，取蒼頭帽覆之。宣詔畢，頓首不能出聲。自盡後，衛帥驗視回奏。次日，始奉旨：“準取殮。”蓋懸梁者兩晝夜，真從來未有之慘矣。
東閣五間，夾為前後十間，前中一間，供先聖位，為諸輔分本公敘之所。閣輔第五員以下，則俱居後房，雖白晝亦秉燭票擬。韓城當國，特鑿一牖，複開門構數椽，以通日色。說者謂破壞風水，故首膺此禍。雖然，韓城即不破壞風水，能免此禍哉？
是年二月，左良玉遂剿張獻忠，獻忠出戰，墮馬幾被擒，複逸去，逃入瑪瑙山中，良玉令降將劉國能圍之。獻忠食盡，分賊四出抄掠，不得者歸，盡殺之。其未歸者懼殺，詣軍門降。良玉因令國能將之前行，偽稱糧至，獻忠開營延入，國能乘不意，縱火大戰，盡掃其營壘，斬首萬餘級，擒其妻孥及賊黨徐以顯、潘應鼇等，獻忠批藤從岩澗逃去。捷聞，賜楊嗣昌鬥牛服。是役也，獻忠精銳俱盡，止存千餘騎，走入興安、平利山中。良玉進圍之，連營百裏，憚險，圍而不攻。獻忠因得以收散亡，養痍傷，群盜往往歸之，勢複振。而羅汝才、過天星等賊，複盡入川。嗣昌駐襄陽，會師合剿，以興安一路失期，斬其監軍副使殷太白，複疏參四川巡撫邵捷春不行堵禦。捷春逮問。
五月，賊羅汝才等陷四川大昌，犯夔州。石柱女帥秦良玉統兵來援，監軍萬元吉率舟師由巫山上三峽。賊十三哨過夔門魚貫而進，羅汝才為殿。官兵遙望不敢擊，賊循河南而行，欲渡川西。元吉、左良玉、賀人龍等，皆會於夔州。羅過諸賊，自夔州山後抄掠，官兵分扼諸隘，賊掠無所得。副將羅於萃擊過天星於鄭山寨敗之，過天星以百騎走。群賊既困，謀奪尖山西奔。賀人龍會四川總兵鄭嘉棟，湖廣副總兵張應元、汪雲鳳，陝西副總兵李國奇之師赴之。賊以奇兵攻尖山寨，人龍等率諸軍奮呼，直入賊陣，斷賊為二，賊騎陷泥淖不得馳，而川兵奔跳澗穀如猿猱，賊潰自相騰踐，斬首千七百餘，生擒自來虎等七十一人。賊退屯羊橋，四出抄掠，石柱土司邀之於馬家寨，斬首六百，又追敗之於留馬埡，斬賊首東山虎。庚子，賊屯譚家坪南北兩山，山頭張幕，魚鱗相掩疊，官兵分道並進，南山賊拔寨先走，北山賊馳下，直擊官軍，官軍力戰，賊退守山巔，官軍分兵繞山後而上，前後齊登，賊披靡竄走澗穀，諸將皆下馬緣山逐賊，追奔四十裏，斬首千二百級，賊奔迎仙寺嶺。癸卯，三省官兵，合擊賊於嶺上，賊營大亂，斬首千餘級。秦良玉奪羅汝才大纛，擒其老營隊副，塌天賊突圍遁走七箐坎，入於乾溪。丙午，羅過諸賊，犯夔州下關城，謀歸湖廣，以瞿塘水漲不得渡。總兵嘉棟、副總兵應元、雲鳳，自雲陽出邀其前，監軍元吉、副將人龍等，間道疾走尖山以截之。夔城山溪險隘，炎暑毒人，賊人馬俱病，汝才、小秦王、上天王、混世王、一連鷹五營，走雲陽尖山壩，過天星、關索二營走雲陽水碓口，期同會於開寧。戊申，人龍等追賊至七箐坎，賊簡其銳為殿，以挑官軍，潛以老營先走，人龍擊殿後賊，破之，長驅搗其中堅，賊大敗。追至馬溺溪，壓賊壘而東。六月辛亥昧爽，人龍等前薄賊營，三路並進，大呼騰躍而上。賊驚潰，官軍逐之，斬首千二百人，俘六百人，赦其俘一杆槍、自來虎、伍林三人，靈為前鋒。壬子，官兵躡賊而前，慮賊必設伏以相邀，參軍李仲興、高光榮，勒輕騎先往，人龍、國奇潛以大兵繼之。二將入隘，賊伏起兩山間，圍之數重，二將戰方酣，人龍、國奇麾兵並進，聲動山穀，圍中亦奮呼以應之。賊圍開四潰，斬首五百餘級，生擒賊渠掠山虎等十六人，汝才東走大寧之小嶺，官兵控之於夔東。己卯，過天星、關索走開縣，屯南壩，知汝才東竄，而官兵漸迫，因北走。丁巳，鄭嘉棟率諸將追擊賊於觀音山，逐北二十裏，至於臨江，斬首二百餘級。張應元窮追至竇山，遇賊百餘騎，擊賊二十餘騎，餘皆大呼釋甲，賊首托天王請降。托天王，即常國安也。應元止兵，裂帛作書，令國安所部抓地虎往諭過天星，過天星曰：“必托天王身至為信，乃降。”庚申，賊首高守達率麾下二百騎來奔，過天星逐之，邀去百餘騎，來歸者七十五騎，皆關西健兒。辛酉，過天星西走，官兵拔營逐之，至新寧西關外，賊騎三千，不戰而走，高守達率其健兒當先陷陣，賊大亂，馬竄禾黍中，驚■相騰踐，官兵蹙而射之，斬首千七百餘級，擒賊首流金錘、金狗兒。過、關二賊東奔達州，張應元等追逼之。丁卯，常國安前驅遇賊，官兵並進，斬首三百餘級，奪其營，賊奔袁壩驛，設伏溝澗中。戊辰，應元等前驅搏戰，令高守達、常國安繞穀中，出搗其脅。賊伏發，方接戰，國安、守達突出，大呼擊賊，賊驚，墮山澗中者無算，斬首九百餘級，生擒滾地狼等十七人，降其管隊柯天虎等四十人。庚午，賊自袁壩驛東走開縣，諸將分營出戰，鄭嘉棟將中軍，羅於莘將左軍，降將楊旭將右軍，戰於城下，賊大敗，走大昌。
張獻忠自興、房走白羊山，入巫山間，川兵躡之，蓋西入深穀中，掩旗息鼓若無人。參將曹進功率兵入山偵賊，不見一人而歸。初，楊嗣昌以左良玉跋扈難製，而賀人龍所將關兵驍勇善戰，屢殺賊有功，請以人龍代良玉，佩將軍印。既而良玉奏瑪瑙山之捷，度未可動，複奏留左良玉佩印如故，別加人龍總兵銜，須待後命。人龍驟聞大將之信，踴躍動三軍，既而報寢，殊怏怏；良玉知其故，意亦懷恨。當獻忠之竄伏興、房山中也，所存千餘騎耳，剿之可立盡，乃良玉以奪懷慚，人龍複以歸印觖望，遂互相推諉，不複深入，以致獻忠複熾，皆嗣昌失二帥之心所致也。
過天星素與張獻忠有郤，聞羅、張既合，遂詣嗣昌乞降。嗣昌令良玉撫其眾七千人，簡其精銳，隸良玉軍中，安其老弱於鄖西，以降將掃地王李靖隸監軍萬元吉標下。過天星，既惠登相也。七月，羅汝才、小秦王、上天王、混世王、一連鷹距大寧，元吉遣遊擊劉正國、降將伍林招之。先是，汝才與金翅鵬不相能，金翅鵬嚐懼為所並。至是，小秦王、金翅鵬相率降於嗣昌，汝才遂殺劉正國、伍林，東走巫山。良玉分兵屯房、竹間，汝才屢敗，黨羽多降，勢益孤。獻忠時在巫山，汝才往會之，謀渡川西走。諸將賀人龍、李國奇、張應元、汪雲鳳、張奏凱等合兵擊之。應元、雲鳳屯於夔之土地嶺待人龍兵，三檄不至。癸亥，人龍兵噪而西歸，獻忠知官無後繼，悉銳來攻，而應元、雲鳳所將湖廣兵三千皆新募，未經行陣，賊驟至，二將簡銳卒千人搏戰，晨至日中未決，賊分兵繞後山而下，突衝營中，守營新兵皆訁華，賊乘之，前後皆圍，二將殊死鬥，應元中流矢，奮擊突圍出。賊方渡河，應元赴河上，燃炮擊殺一賊帥衣緋者，賊不得渡。雲鳳苦戰久得脫，渴甚，飲水鬥餘臥，血凝臆而卒。時張、羅新合，嗣昌命金翅鵬部下飛上天入羅汝才營招之。汝才逡巡不決，獻忠懼汝才之再降也，日說汝才曰：“楊閣部已俘過天星獻闕下矣，爾慎自為謀。”元吉請檄左良玉攜惠登相至陳前招汝才必來，嗣昌不聽，汝才遂不果降。己醜，嗣昌屯巫山，遣人至關索營中招之。先是，關索屢敗，伏深山中，過天星降，益懼，遂與其黨王光恩，楊光甫等，詣嗣昌軍前，頓首涕泣請死罪。嗣昌撫慰之，給以金幣，所部三千人，嗣昌簡其精銳赴軍前殺賊。羅汝才之人川也，凡九股，整十萬、掃地王、小秦王、金翅鵬、托天王、過天星、關索，惟羅、張相抗，其七相繼俱降矣。嗣昌飛章上聞，敘齎文武將吏有差。
九月，官兵大敗李自成於函穀。自成奔漢南，李國奇等蹙之於北，左良玉扼武關以南。初，諸將圍自成崤、函山中，分守要害，合圍甚密，將坐斃之。嗣昌曰：“圍師必缺，不若空武關一路，待其走而擊之，可立盡也。”自成令軍中盡殺所掠婦女，同養子李雙喜，乘隙率五百騎突圍而出，諸將不能禦，遂自武關逃入鄖陽。時河南大饑，饑民所在為盜，自成乃至鄖陽走伊、雒，饑民從者數萬，圍永寧，陷之，殺萬安王朱钅輕，再陷宜陽，勢複大振。
是日，張、羅二賊陷大昌，進屯夔州山北。時賊行營輜重婦女甚重，眾官兵多觀望不前，但尾賊後，所至關隘，守將多遠遁，遂長驅趨達州。十月壬戍，賊渡河，入巴西，陷劍州。甲子，過劍閣，由廣元走陽平關，從間道出百丈山，將入漢中。總兵趙光遠守陽平甚嚴，賀人龍、李國奇複整旗而東，賊乃逾昭化，走西川。丙寅，川兵迎賊於劍州，敗績，賊縛四將去。降將掃地王、張一川擊賊於梓潼被擒，賊招之。元吉請恤其妻子於夷陵。
十一月庚辰，嗣昌、元吉，大饗將士於保寧，以諸軍進止不一，立大帥以統之，以總兵猛如虎為正，張應元為副。癸未，發保寧，趨綿州。癸卯，賊知大兵至，走江內。乙已，猛如虎選驍騎逐賊，元吉、應元屯兵安嶽城下，以遏賊歸路。十二月辛亥，賊南陷瀘州。瀘州三麵皆陡絕臨江，止石立站一路可北走，賊既走絕地，元吉謀以大兵自南搗其老營，伏兵旁塞險要，蹙賊北走永州，逆而擊之，可盡殲也。乙卯，元吉等至石立站，賊先移渡南溪，官兵隔水追之，不及。癸亥，賊抵成都，副將某統千餘騎夜搗賊營，賊預取土像數百置帳中，四麵懸燈，而潛伏暗處，千騎望燈而趨，大呼直入，則所劫者，諸土像也，急退，而賊眾四合，殲戮無孑遺。自是成都專意固守，不複言搗營矣。賊趨新都，知縣黃岡固守，賊複至綿州。
是年，山、陝、河南大旱，蝗起。冬，大饑，人相食，草木俱盡，土寇並起：開州人袁時中聚眾數萬，破開州。時壽州有袁老一營，時中自號“小袁營”以別之。後官兵複開州，時中走河南。
江北賊革裏眼、左金玉複犯霍、英，上命太監劉元斌率營兵六千馳赴北江，擊賊於霍山，敗之，賊走湖廣，陷麻城、黃梅。
河南郟縣盜李際遇、申靖邦、張鼎聚眾至五萬，總兵王紹禹遣遊擊高謙擊之，一日三捷，斬首二千餘級，追擊菜園，斬首千級。