張勳複辟太過倉促，所有手續沒有一個完備，就連草詔中的各項事情也都是憑空捏造的。其實，張勳並未與馮國璋、陸榮廷接洽，草詔全由文武兩聖人背地裏完成。
當時，京城裏麵，按照張勳的命令，凡辦公局和大小商場全部懸掛龍旗，仿佛仍是大清王朝。隻有總統府沒有懸掛龍旗，張勳還算顧全黎總統的麵子，沒有動用武力，但派清室舊臣梁鼎芬前往總統府做說客。梁鼎芬見了黎總統，將複辟情形略述一番，並把一等公的封章從包裏拿出來。黎總統皺眉道：“我召張勳入都，難道是叫他來複辟嗎？”梁鼎芬道：“天意如此，人心如此，張大帥也不過應天順人才有這番舉動。況且公曾受過清職，食過清祿，辛亥政變，非公本意，天下共知。前次威脅公登台，今番又逼公下場，公也可以說是受盡折磨了。今日何不就此卸下重任，安享天祿，既不負清室，也不負民國，豈不是一舉兩得嗎？”黎總統道：“我並非戀權不去，不過總統的職位出於國民委托，不敢不勉任所難。若複辟一事由張勳一人主張，恐怕中外未必承認，我怎麽敢私自允諾呢？”梁鼎芬出言威脅道：“先朝舊物，理當歸還；公若不肯讚成，定會後悔！”黎總統沉默不語。梁鼎芬知道多說也無用，悻悻走了。黎總統急忙命秘書，將張勳複辟的情形以及自己的立場擬成電稿，特派親吏潛出北京城，趕到上海發布。
黎總統派人南下後，又與府中心腹商量救急的方法，大家齊聲道：“現在，京中權勢全在張勳一人手中，總統如果不答應他的要求，他必用激烈手段對付總統。總統不如急圖自救，暫避凶威，等外援到來再作打算。”黎總統問道：“叫我到何處去？”大家道：“事已危急萬分，隻好求助外國人了。”黎總統遲疑半晌道：“我若一走，便不是總統了，這事如何處置？”大家聽了，還以為黎總統留戀職位，當下出言勸慰道：“這有什麽好考慮的？外援一到，總統自然複位了。”黎總統慨然道：“我已決定辭職，不願再擔當此重任，隻是一時無從交卸，將來維持危局，靠何人主張？罷！罷！我記得約法中，總統有意外時，副總統代行職權，看來隻好交給馮副總統了。”大家道：“馮副總統遠在江南，如何交去？”黎總統也覺得有些為難。為這交卸問題，黎總統寢不安席，幾乎一夜沒有合眼。第二天，天剛蒙蒙亮，黎總統便起床了。還好沒有什麽急警，隻是有人傳報，清宮內有任官的聖旨，馮國璋、陸榮廷被封為參與政務大臣，此外還任命了許多尚書、侍郎、左右丞及都統、提督、府尹、廳丞。黎總統無心細聽，仍發愁交卸的手續無人承擔。
到了中午，風聲更緊了。午後，定武軍竟然持械前來，聲勢洶洶地強令總統府衛隊全部撤出，並立即交出印信，不得遲延。陸軍中將唐仲寅為總統府衛隊統領，無法抗拒，隻好報告黎總統，請他立即解決。黎總統一直疑心李經羲與張勳同謀，而不願跟李商議，但此時也顧不了太多，命秘書劉鍾秀前去邀請李經羲。劉鍾秀正要出去，碰巧外麵遞入李經羲的辭職信，並報稱李已赴天津。黎總統長歎道：“我也顧不得許多了，看來隻有麻煩老段了。”當下，命劉鍾秀草擬兩令，一是準李經羲辭職，仍任段祺瑞為國務總理；一是請馮國璋代理大總統職權，所有大總統印信，暫交國務總理段祺瑞攝護，設法轉呈。兩命令蓋過印，印信便被封固起來，送往天津，交給段祺瑞。黎總統隨身裝了些銀幣，帶著唐仲寅、劉鍾秀二人和一名仆從潛出總統府，前往東交民巷的一家法國醫院，打算暫時躲避。
黎元洪等人到達法國醫院時，天已經黑了。院門雖然開著，裏麵卻隻有幾個仆從住守，問及院長，答稱外出未歸。黎元洪一行人隻好怏怏退出，折入日本使館界內。幸虧唐仲寅記起一人，說是與日本公使武隨員齋藤少將經常往來，不妨向他求援。當下派人前往齋藤少將官舍，遞入名帖。齋藤少將立即出來迎接。齋藤少將本來就認識黎元洪，又與唐仲寅交好，當然坦懷相待。仲寅將避難情形約略告知，並請他轉達日本公使，懇請保護。齋藤少將一口答應，叫黎等人先坐著休息，當即親自前往日使館報告。過了一會兒，少將回來說道：“敝公使已如所請。還請你們屈居營房數日，我定將予以保護，你們盡可無憂。”黎、唐二人當即稱謝。齋藤少將隨即令衛兵騰出一間營房，供二人休息。第二天，日本公使通告駐京各國公使以及清室道：
黎大總統帶侍衛武官陸軍中將唐仲寅、秘書劉鍾秀及仆從一名，於七月二日午後九時半，不預先通知，突然到日本使館域內之使領武隨員齋藤少將官舍，懇請保護身命。日本公使館認為此為不得已之事情，並顧及國際通義，決定給予相當之保護，即以使館域內之營房，暫充黎總統居所，特此告知。
民國垂危，總統黎元洪在租界避難，副總統馮國璋遠在江南，鞭長莫及。隻有天津的段祺瑞，聽說京中政變，惹動雄心，打算立即出兵討伐張勳。正巧前司法總長梁啟超也在天津，兩人商量，祺瑞表明自己的態度，啟超一力慫恿，力主興兵。當時，陳光遠在天津駐紮，手下有數千名士兵，於是段、梁一起到陳光遠軍營，商議討張，陳光遠表示讚同。又值李經羲到津，致書祺瑞，請他挽回大局；而且黎元洪派遣的親吏也送印信到津，交給祺瑞。祺瑞讀完來信，更是覺得名正言順，當即囑托梁啟超草擬數道通電，陸續拍發。梁本來就是當代文豪，先前已出頭反對複辟，洋洋灑灑地撰成數千字，通電全國，不過手無寸鐵，電文沒有起到多大作用。此次，段祺瑞出兵興師，梁更是理直氣壯，樂得借那筆尖兒橫掃千人軍。梁啟超先是致電馮國璋、陸榮廷等人問明真假，隨後另寫了一篇專門討逆的電文，通電各省。
電報拍出去後，馮國璋的討逆電，陸榮廷的正名電文，陸續到達天津梁啟超的手裏。岑春煊也來湊熱鬧，加入討逆行列，並致電清太保世續及陳寶琛、梁鼎芬等人，奉勸清室不要中了他人的奸計。此外，浙江、江西、湖南、湖北等省一致反對複辟，聲討張勳。段祺瑞見眾心憤激，更是信心十足，於是自稱共和軍總司令，親臨馬廠，慷慨誓師，將梁啟超草擬的第二道討逆檄文電告天下。
就在共和軍總司令段祺瑞日夜部署，準備出師時，副總統馮國璋拍電到天津，要與段祺瑞聯合討逆。於是，二人聯名發一通電，曆數張勳八大罪狀。
馮、段相聯，聲威益振。浙江督軍楊善德、直隸督軍曹錕、第十六混成旅司令馮玉祥均電告出師，公舉段祺瑞為討逆軍總司令。於是，段祺瑞將共和軍改為討逆軍，並在天津造幣總廠設立總司令部，委派段芝貴為東路司令，曹錕為西路司令，分道進攻。同時就任國務總理一職，設立國務院辦公處。副總統馮國璋從段祺瑞處拿到黎元洪派人送來的印信，特發布告：“黎大總統不能執行職務，國璋依大總統選舉法第五條第二項謹行代理，即於七月六日就職。”外交總長伍廷芳也攜帶印信到上海，暫時在上海交涉公署辦公，除了電告副總統及各省公署外，還命駐上海特派交涉員朱兆莘致電駐洋各埠領事，聲明北京偽外務部的電文全部無效。
除北京城外，沒有一個地方服從張勳的命令。張勳已經孤立，還要亂頒聖旨，命各督撫每省推舉三人來京籌議國會，又授任徐世昌為太傅，張人駿、周馥為協辦大學士，岑春煊、趙爾巽等十三人為弼德院顧問大臣。一幫陳年角色全被搜羅出來，幫助清室。清太保世續憂多喜少，屢次讓太監到東安門外買報紙，以便掌握輿情向背。剛巧徐世昌電告世續，說是變生不測，前途難料，宜自守鎮靜態度，千萬不可妄動。於是，宣統帝複辟那幾天，世續等人噤若寒蟬，不出一聲，隻聽張辮帥規劃一切。
張勳正在憂悶，突然接到軍報，曹錕、段芝貴兩軍分東西兩路殺入。西路的曹錕軍占據盧溝橋，東路的段芝貴軍占據黃村，當下惹怒了張辮帥，立即下令全軍出擊。無奈張軍隻有五千名，顧東不能及西，顧西不能及東，此外又無兵可派，隻好全部派去衝鋒。張軍自知不敵，隻好硬著頭皮前去一試。行至廊坊，正好碰到段芝貴的兵馬殺來，兩下交鋒，段軍的槍彈非常厲害，張軍勉強抵擋，死傷極多。正在這時，西路又來急報，稱曹錕及陳光遠統兵殺到。張軍前後受敵，還如何支撐得下去？霎時間，紛紛潰退，段芝貴等人占領了豐台。第二天，由馮國璋代總統發令，撤掉長江巡閱使安徽督軍張勳的官職；特命安徽省長倪嗣衝兼署安徽督軍，所有張勳未帶走的部兵統歸倪嗣衝節製；並命各省軍隊靜駐原防，不得自亂秩序。同時，段祺瑞催促東西兩司令迅速入京，掃除餘逆。張勳悶坐京城，連接各路警報，又驚又憤，幾根黃須和一條曲辮子幾乎也要豎起來了。最後，形勢所逼，張勳不得以假托清帝諭旨，命徐世昌火速進京，以太傅大學士的名義輔政，自己則辭去內閣議政大臣及直隸總督兼北洋大臣的職位。此時，張勳暗自回憶起從前徐州會議的情形，那些到會軍閥多半讚成，就連那數一數二的重要人物也沒有異議，現在卻群起而攻之，自己成為眾矢之的。越往深處想，張勳越是憤恨，不得不自鳴不平，通電全國，曆述複辟的前後情形，大有恨人反複，不平則鳴的意思。
張勳雖然敗兵，但雄心不死，又收集兵馬，屯聚天壇，並在天安門、景山、東西華門及南河沿等處設炮位，嚴行扼守，要與討逆軍背城一戰，一決雌雄。駐京各國公使團目睹京城危急，擔心殃及池魚，於是相率照會清室，勸令張勳解除武裝，取消複辟。清宮上下，全無政柄，隻得將各使公牒交給張勳。張辮帥怎麽肯答應？定要決一死戰。京城簡直要成為大戰場了。