古拉．伯努利為伍的希望鼓舞下，他又繼續自己的學習。伯努利兄弟熱心地提議為他在聖彼得堡科學院找個職位，並讓他及時了解那裏的情況。

這個階段，歐拉看起來對做什麽都無所謂，隻要是科學就行。當伯努利兄弟寫信告訴他聖彼得堡科學院的醫學部將有個空缺時，歐拉在巴塞爾便全力投入生理學的研究，並出席醫學報告會。但是，即便在這個領域，他也未能脫離數學：聽覺生理學提出了以波動方式依次傳播聲音等數學研究問題，這項早期的工作像惡夢中瘋長的樹那樣分枝擴展而貫穿到歐拉整個一生的事業之中。

伯努利兄弟是辦事迅速的人。1727年歐拉收到了去聖彼得堡任科學院醫學部成員的邀請。按照一項聰明的規定，每個外來的成員都要帶領兩個學員－－實際是接受訓練的徒弟。可憐的歐拉，歡樂很快就變得無影無蹤。就在他踏上俄國土地的那一天，開明的葉卡捷琳娜一世女皇去世了。

葉卡捷琳娜在成為彼得大帝的妻子以前是他的情婦，從不止一個方麵看，就已經是一個胸懷寬廣的人。就是她，在位僅兩年，便實現了彼得創建科學院的願望。葉卡捷琳娜死後，在小沙皇未成年的情況下，權力落入非常暴虐的集團手裏(小沙皇在能夠執政以前死去也許是幸運呢)。俄國的新統治者把科學院看作不必要的奢侈品，有幾個月甚至打算把它砍掉，並把所有外籍院士遣送回國。這就是歐拉到達聖彼得堡時的情形。混亂中，關於邀請他擔任的醫學部職務杳無音訊，他在絕望中幾乎接受了海軍上尉的職銜，後來得便溜進了數學部。

在這之後，條件好了一點，歐拉便專心工作。整整6年，他一直埋頭在書堆裏。這倒不完全是因為他被數學吸引住了，部分地也是因為到處都有密探，使他不敢進行正常的交際活動。