王小波、李順起義被鎮壓下去以後，統治者對蜀地的政策也做了些調整，例如減少或減輕了一些稅賦徭役，封建生產關係也多少得到了一些調整，但階級矛盾仍然很尖銳，人心未寧，等待時機，準備鬥爭。加上川蜀的地方軍政官員也並未從王小波、李順起義中吸取教訓，依然享樂腐化、剝削軍民，終於激起王鈞兵變，起義爆發時距王小波、李順起義失敗不過五年。
宋真宗鹹平三年正月元旦（1000年2月8日），駐守在益州（成都府改，今成都）的神衛軍指揮王鈞，趁官員們慶賀元旦，率眾發動兵變，士兵們奮起殺死兵馬鈐轄符昭壽，大獲全勝。起義軍於是占領了益州，王鈞被部眾推舉為王，稱帝建元，國號蜀，建元化順，任命小校（低級軍官）張鍇為宰相，成為與宋朝對立的政權。王鈞攻占益州後，益州知州牛冕等逃往漢州（今廣漢），起義軍乘勝追擊宋軍，沒過幾日，漢州隨即也被王鈞攻陷，牛冕命大，又逃往東川（鋅州，今三台）。後來王鈞率兵攻打綿州、劍門，企圖占據四川北部門戶，但均未成功，隻得退回益州。這時四川各地人民被充分發動，紛紛響應。彭州農民準備殺兵馬都監響應王鈞的起義，但是由於計劃不周，事情泄露，首領被殺害。但是已經燃燒起來的革命烈火難以撲滅，起義軍逐漸發展到數萬人。
蜀州知州楊懷忠乘王鈞攻打劍門的時候，率重兵進攻益州，一度攻入城內，但楊懷忠所調集的壯丁中有許多是原王小波、李順起義軍戰士，在關鍵時候，臨陣兵戈倒向，加入起義軍的行列，楊懷忠戰敗，隻得退到江原（今崇慶東）龜縮。王鈞北上未果返回益州後，積蓄力量。第二年二月，王鈞率領起義軍向南發展，但又遭到楊懷忠的阻擊。兩軍大戰數日。不久，楊懷忠集結嘉州、眉州等七州宋軍再攻成都，宋軍再次攻入城內。而起義軍也進攻蜀州，斷絕了宋軍的援路。這次雙方都有所獲，但誰也不能滅了對手，楊懷忠隻得再次退回雞鳴原（今雙流東），王鈞也閉門守城，沒有追擊。
鑒於以往的教訓，宋朝廷對四川地區起義相當重視。起義後派出雷有終為川陝招安使，率領宋軍禁軍，結集川陝各州的兵馬，大舉鎮壓起義。二月十九日，雷軍奔赴至成都城外。鑒於敵強我弱，王鈞采取迂回戰術，開城假作逃跑，實際上埋伏在城內。雷有終率軍進城掠民財，隊伍相當混亂。起義軍趁機殺出，打了宋軍一個措手不及，宋軍一時大亂，城門被起義軍封死，宋軍不能出，大都被殲滅。雷有終倉皇逃竄，敗回漢州。到了三月份，雷有終不甘心失敗，又卷土重來。率大軍趕到成都附近，與起義軍對峙。王鈞從升仙橋分路迎敵，但是沒有取勝，損失千餘人，隻得退守成都。宋軍害怕再次中計，也不敢追擊。
五月份，宋真宗下詔，對“益州亂軍”進行招降。起義軍沒有屈從，繼續堅持與宋軍對峙。直到九月間，宋軍仍然沒有攻下益州。這時宋軍中有人出主意，乘起義軍不備，夜間挖隧道潛入城內。這一計策果然見效，宋軍攻下了久圍的益州。王鈞沒有了立足之地，隻好率起義軍兩萬人突圍，遠走他鄉。雷有終進入益州城後，實行大肆屠殺的政策。凡是城內存留的健壯的男子，隻要參加過起義軍，或者是幫助起義軍守城，就把他們投到火中燒死。恐怖政策延續了一個多月，前後燒死數百人。
王鈞率領起義軍逃走後，到了富順，全力攻下了這座城池，希望作為與宋軍對峙的另一個據點。但是宋軍沒有給起義軍喘息的機會，雷有終派楊懷忠緊緊追襲。由於力量比對懸殊，宋軍很快攻入城內，王鈞雖大勢已去，但是堅決不屈，自殺身亡。起義軍六千多人被俘。就這樣起義被鎮壓下去了。
王鈞領導的農民起義盡管持續時間不很長，但是對羸弱的宋王朝是一個沉重的打擊。此後宋朝又有多次農民起義爆發，正如歐陽修所說：“一年多於一年，一夥強於一夥。”盡管沒有推翻宋朝統治，卻使統治者認識到需要調整統治措施，改善農民的生存狀況。從這一點來說，王鈞的起義是有一定的曆史意義的。