克瑞克等人（Craik et al.1999）首次對自我的神經基礎進行了研究。他們認為，情景記憶的加工在左半球，但情景記憶的提取在右半球，因此，自我定位在右半球，因為正是自我提取情景記憶。他們使用自我參照效應（self-reference effect）的實驗範式對8個被試進行腦成像實驗，設置了四種實驗條件。（1）自我參照：“勇敢的”適合描寫你嗎？（2）他人參照：“可愛的”適合描寫牟咯尼（加拿大前總理）嗎？（3）語義加工：“守時的”是社會讚許的嗎？（4）語音加工：這個人格形容詞有多少個音節？要求被試對每個問題回答是或否。從呈現人格形容詞到被試回答問題，對被試大腦進行掃描。被試回答畢問題以後進行記憶測驗。將被試正確認出來的人格形容詞歸類，看認出的形容詞是屬於自我參照、他人參照、語義加工還是語音加工。克瑞克等人發現，自我參照實驗條件的記憶成績最好；自我與大腦雙側內側前額葉的激活關聯。
後來，奇利等人（Kelley et al.2002）對自我的神經基礎進行了深入研究。他們使用自我參照效應的實驗範式對24個被試進行腦成像實驗。實驗條件有三種：自我參照；他人參照 和字形判斷（要求被試回答呈現的人格形容詞是大寫或小寫）。行為結果表眀，自我參照的記憶測驗成績顯著高於他人參照和字形判斷。腦成像數據顯示，右側內側前額葉以及右側後扣帶回都與自我關聯。
後來許多腦成像實驗也都表明，自我定位在內側前額葉和扣帶回（Northoff，et al.2006）。