戰後，由於戰功顯赫和自身性格的缺點，朱可夫遭到斯大林的猜忌。1946年索科洛夫斯基接替他任駐德蘇軍司令，朱可夫就任蘇聯陸軍總司令。1947年遭到斯大林指責，被派到遠離莫斯科的敖德薩軍區任司令員，後來又貶到戰略位置更加次要的烏拉爾二級軍區任司令員。1953年朱可夫被召回莫斯科，但斯大林隨即去世，所以無從證實朱可夫被召回的原因。1953年朱可夫參與逮捕貝利亞的行動，因此成為國防部第一副部長。1955年任蘇聯國防部部長。1956年朱可夫負責製定了入侵匈牙利的計劃。1957年赫魯曉夫與莫洛托夫、布爾加寧等人發生矛盾，後者在主席團會議上要求赫魯曉夫辭職，赫魯曉夫要求召開黨中央全體會議。朱可夫支持赫魯曉夫，派軍用飛機將所有中央委員接到莫斯科，並做了有力的發言指責莫洛托夫等人參與斯大林的清洗運動，從而鞏固了赫魯曉夫的位置。但朱可夫在幫助赫魯曉夫的過程中，因驕傲的表示："沒有我的命令，一輛坦克也別想從原地移動。"赫魯曉夫隨之感覺朱可夫的威脅，趁朱可夫出訪之機將他架空，在他回國後以"波拿巴主義者"的莫須有罪名--即圖哈切夫斯基冤案同一名稱的罪名--解除了朱可夫的國防部長職務。
赫魯曉夫下台後，朱可夫才又重新被提起。閑居的朱可夫著有《回憶與思考》、《在保衛首都的戰鬥中》、《庫爾斯克突出部》、《在柏林方向上》、《大戰略縱深國防》等軍事著作，記述了第二次世界大戰蘇德戰場的許多著名戰役，並闡述他的軍事思想。1974年朱可夫去世，葬於紅場克裏姆林宮牆下。