等到大借款的所有合約、簽字等手續完全告竣後，袁總統才提交參、眾兩議院，請他們備案。兩院議員對此很驚異。參議院中國民黨聲勢最盛，專防袁政府違法擅行，見到此案，不等開會商議，他們便複谘政府：“大借款合同未經臨時參議院議決，違法簽字，當然無效。”眾議院於五月五日開會質問政府，請求解釋。當時，國務總理趙秉鈞因宋案被列為嫌疑，大借款又簽字，自然在國會備受攻擊，便於五月一日辭職，前往天津。袁總統也知道他的意思，便給他假期，暫令段祺瑞代理國務總理一職。
段祺瑞任陸軍總長，本與外交、財政互不幹涉，不過既已代任國務總理，就得出席答複。眾議員當麵責問，段說：“財政拮據，無計可施，不得已變通辦理，還請諸君原諒！”各議員嘩然道：“我等並非反對借款，實反對政府違法簽約，政府如果可以擅行，何需議院！何需我等！”段不便強辯，隻好淡淡地答道：“交議手續確實不夠完備，財政的情形也實在困難，在借款問題上，鄙人以前不知道，諸君不要怪我。如可通融辦理，也是諸君的美意，鄙人無話可說。”說完便走了。眾議員聚議紛紜，有的說應退還谘文，有的說應彈劾政府。那一小半擁護政府的，則不發一言。當下由眾議院議長湯化龍提出投票表決是否承認此借款合同，結果是二百一十九張不承認票，五十三張承認票，因此決議不承認這大借款，準備將谘文退還。
然而，由於統一黨為政府私黨，便在此時暗替政府操作，與共和、民主兩黨密商數次，並用金錢買通兩黨。果然，有錢可使鬼推磨。兩黨得了若幹好處後，便閉口無言，沒有異議。並且與統一黨合並為一，統稱為進步黨。而國民黨議員始終不受籠絡，再三爭執。進步黨人索性遊玩都市，流連花酒，將國事撇諸腦後。國會中出席人數屢不過半，隻好關門閉會，大借款案也暫且擱置。
國民黨忍無可忍，便通電各省都督、民政長，請他們主持公論，不要承認政府借款。進步黨卻電致各省：“政府借款萬不得已，議院中反抗政府，不過一部分私見，不足生效。”就連財政總長周學熙也電告全國，聲明大借款理由，說：“政府借款實履行前參議院議決的案件，未嚐違背約法。”雙方互相攻擊，爭論不休。
各省都督、民政長有袒護政府的，也有抵斥政府的。其中，江西都督李烈鈞、安徽都督柏文蔚和廣東都督胡漢民都屬國民黨籍，聽說政府違法借款，三人極力指責。國民黨議員仗著這三省都督的聲威，不但斥責政府違法，而且摘列合同中苛刻的條款，稱之為“亡國厲階”，決不承認。無奈政府聯絡進步黨，與國民黨抗衡，眾議院連日閉會，那些擁護政府的都督也電告眾議院，斥責眾議院失職。最後，國民黨自覺乏味，便與進步黨協商，稱政府這次交議表麵上沒有侵害國會職權，但絕不能委曲求全，否則全院議員俱蒙恥辱等。進步黨員則稱，借款簽字已成事實，即使交議，也萬難變更，不如先予以承認，另行彈劾政府，才為正當。國民黨也無可奈何，隻好模棱過去，承認了此案。但參議院強硬到底，始終不肯承認借款，袁政府竟不去管他，仍獨斷專行，隨取隨支付，樂得眼前受用。
當時，有一個名叫裘平治的湖北商人，他從宋案和大借款案中看出袁總統的心思，無非是帝王思想。他想，若乘此機會拍馬吹牛，進言一番，得蒙袁總統的垂青，便是個定策功臣，從此做官發財，一輩子榮華富貴享受不盡。於是，裘治平找到自己的好友冬烘先生。冬烘其人平時常說，隻有真命天子出現，才可太平。裘認為既然冬烘抱定這種思想，一定能寫出絕好的呈文。當下裘平治就去拜訪冬烘，果然一說就成。那冬烘先生頗知通變達權，決口不提“皇帝”兩字，隻將“暫改帝國立憲，緩圖共和政體”兩句放在呈文上麵。最後署名除裘平治外，又捏造幾個假名、假姓列在後麵，稱為民意。
裘得了呈文，忙跑到郵政局，費了雙掛號的信資，寄達北京。從此日夕探望，眼巴巴地盼著回音，就是做夢也是夢見總統府請他做顧問員。
一天早晨，裘平治正睡得迷迷糊糊，忽然有一人叫道：“裘君！裘先生！不好了，袁總統要來拿你了。”裘平治被他喚醒，才答道：“袁總統來請我嗎？”那人道：“放屁！是要拿你，哪個來請你？”裘平治道：“我又沒犯什麽罪，為何要來拿我？難道是你聽錯不成？”那人道：“你有無呈文到京？”裘平治道：“有的。”那人便從袋中取出新聞紙，擲向**道：“你瞧！”裘乃披衣起床，擦著兩眼，邊看邊讀道：
共和為最良之政體，治平之極軌。本大總統受國民付托之重，就職宣誓。深願竭其能力，發揚共和之精神，滌**專製之瑕穢，永不使帝製再見於中國。皇天後土，實聞此言。乃竟有湖北商民裘平治等，呈稱：“總統尊嚴，不若君主，長官命令，等於弁髦。國會成立在即，正式選舉，關係匪輕，萬一不慎，全國糜爛，共和幸福，不如亡國奴隸。曷若暫改帝國立憲，緩圖共和。”謬妄至此，閱之駭然。不意光天化日之下，竟有此等鬼蜮行為，若非喪心病狂，意存嚐試，即是受人指令，誌在煽惑。如務為寬大，置不深究，恐邪說流傳，混淆觀聽，極其流毒，足以破壞共和，謀叛民國，何以對起義之諸人，死事之先烈？何以告退位之清室，讚成之友邦？興言及此，憂憤填膺，所有裘呈內列名之裘平治等，著湖北民政長嚴行查拿，按律懲治，以為猖狂恣肆，幹冒不韙者戒。此令！
裘平治一口氣讀下來，多半似懂非懂。當讀到“嚴行查拿”一語時，不由得心驚膽戰，連身子都戰栗起來，便道：“這，這……怎麽好？怎麽好？”還是來人從旁勸道：“三十六計，走為上策。袁總統既要拿你，你不如先到親友家躲匿數天。看本省民政長是否嚴拿，再作打算。”裘平治聽後，忙收拾了一些衣服，一溜煙地逃走了。後來，湖北省民政長派人查拿，到了裘家數次，都找不到裘平治，此事也就不了了之。
大借款案遲遲不見政府的答複，宋教仁暗殺案也一拖再拖，並且要犯趙秉鈞、洪述祖還逍遙法外。京城內外的國民黨員一個個怒不可遏，躍躍欲試，恨不得將袁政府立即推倒。無奈袁政府堅固得很，任國民黨如何作梗，全然不睬，並布下天羅地網，專等國民黨投入，好一網打盡。據說，趙秉鈞為了宋案，到總統府中麵辭總理，袁總統溫言勸慰道：“梁山渠魁全仗君除去，實是第一等大功。還有天罡地煞等類，若他們一定要為宋教仁報仇，管叫他們吃不了兜著走。你盡管安心辦事，怕他們什麽？”趙秉鈞經此慰藉，也就放了心，但未免有些內疚，所以托病去了天津。從此，國民黨與老袁之間的關係越來越緊張，仇恨也越來越深。就在此時，京中來了個女學生，竟向政府聲明，自己叫周予儆，受黃興指使，聯絡黨人，潛進北京，打算施放炸彈，炸死政府各要人。後轉念一想，同族互相殘殺，過於殘忍，所以到京之後，特來自首。同時，她還報告了炸彈的藏匿處。政府得知後，立即派軍警前去搜查，果然搜出若幹軍火，並抓獲亂黨數名。於是，北京地方檢察廳轉命上海法官，傳黃興來京對質，命令非常嚴厲，沒留一點兒餘地。黃興自然不肯赴京。
接著上海製造局發出警電說，五月二十九日夜間，忽有百名匪徒闖入局中，意圖搶劫軍械。幸虧局中防備森嚴，立即召警衛奮力抵敵，當場擊敗匪徒，擒住一名匪官，自供名叫徐企文，是國民黨人。試想，要搶劫軍火，為何隻有寥寥百人？而且百餘個匪徒都逃走了，單單首領徐企文被擒住？政府聽到警情後，便派遣千名北軍乘船去上海，並由海軍部特撥兵艦。其總執事官叫鄭汝成，是袁總統的得力幹員，曾授海軍中將。
過了幾天，袁總統下令，將江西都督李烈鈞、安徽都督柏文蔚和廣東都督胡漢民，全部免職。當時，海內人士暗自猜疑，都說三都督是國民黨重要人物，未必肯服從命令。假如聯合一氣，反抗政府，豈不是一場大變局？偏偏三都督寂然不動，遵令解職，江西、安徽和廣東三省，也是平靜如常。
此時，政府屢次在湖北境內查出私藏軍械等事件，討賊團、誅奸團、鐵血團、血光團等名冊及其團旗，也陸續被搜出。在武昌城內發現血光團的總部，政府派兵前去抓捕，該團成員奮起抵抗，一起開槍、丟炸彈。官兵猝不及防，二人當場被炸死，一人受傷。最後，官兵們還是殺入密室，活捉三名黨犯，並搜出許多密件和儲備的槍支彈藥。黨犯被押回督署後，黎元洪親自訊問，決定將犯人立即斬首。檢閱箱內文件，多半是和武漢國民黨交通部勾連，箱內還有與眾議員劉英和省議員趙鵬飛等的文書。於是，黎副總統派兵監守武昌、武漢兩國民黨交通部，凡出入人員與往來信件，均需盤詰檢查。但這兩部辦事的人早已逃去一空，幾乎門可羅雀。接著襄河一帶又連續生變。一日，黎督署中出現一年輕女子，要求見黎都督，口稱報告機密。稽查人員見她頭梳高髻，體著時裝，手攜皮夾，像女學生一樣。因當時是戒嚴期，稽查人員格外注意，於是先行盤問一番。沒想到該女子在回答某些問題時，支支吾吾。稽查員暗地生疑，於是叫來府中仆婦，當場搜檢，那女子大驚失色，但卻無可奈何。當搜及褲襠時，摸到兩個沉甸甸的東西。女子越發慌張，仆婦越要檢驗，一番扭扯後，忽然從褲腳中漏出兩鐵丸，形狀橢圓，原來是炸彈。稽查員當即逮捕了該女子並交軍法科訊問。女子直供不諱：“姓蘇名舜華，年二十二。曾為暗殺鐵血團副頭目，此次來署欲擊殺老黎。”當下女子被押往法場，立即處決。
一時間，湖北暗殺團林立。湖北各軍界日夜明察暗訪，黎副總統也深居簡出，除非知交到來，否則概不接見。黎府中也是防衛森嚴，暗殺黨這才無從施技。隻是民政長夏壽康和軍法處長程漢卿兩署，輪番遭遇炸彈襲擊，所幸沒有人員受傷。高等密探張耀青被暗殺黨痛恨，在他出門時幾乎被炸成粉末。密探周九璋奉差赴京，家中老母、妻兒都被殺死，隻剩一妹逃出報警。當軍警到周家查捕時，已無一人，隻有滿地的屍骸和血跡。從此，各處防備更加嚴密，暗殺團無法立足，於是紛紛竄入江西。
江西都督職位暫缺，當時由黎元洪兼任。但黎不便離鄂，特舉薦歐陽武為護軍使，賀國昌為民政長，駐往江西。除照例辦事外，遇有要事均電鄂商辦。隨著暗殺團越來越多，謠言四起。江西省議會和總商會擔心有不測，屢次致電黎元洪，請他蒞任。這時候的黎元洪，怎麽可能離開武昌一步呢？此時，九江要塞司令陳廷訓連續發電給黎副元洪：“九江為長江要害，匪黨往來如織。近日，聽說匪黨持巨金來此活動，伺機起事，懇請黎元洪就近速派軍隊及兵輪支援，藉資鎮懾。”黎元洪立即派遣第六師師長李純率師東下，接著密報中央，請再增兵江西，以備不時之需。袁總統立即任命李純為九江鎮守使，並陸續調遣北軍，分批南下。誰知護軍使歐陽武卻電達武昌，說：“贛地各處都很平靜，為何用重兵鎮懾？現在，北軍分據賽湖、青山、瓜子湖一帶，嚴密布置，斷絕交通，以致商民異常恐慌。請即日撤回防兵，且乞轉達中央，務期休兵息民。”黎得此電，不禁疑慮交並。隻好回複歐陽武說，陳司令告急，所以派李司令到九江，既然說贛省無事，我將調李司令回防。但船隻未到，軍隊未回以前，仍希望你轉告九江各軍和地方商民，切勿輕信謠言，致生誤會。這電文剛一發出，陳廷訓又來急電，說前江西都督李烈鈞正分兵進逼金雞炮台，並有後援，請黎副總統火速增兵。
看這數語，與歐陽武所報情形迥然不同，弄得黎副總統莫名其妙。又電詰歐陽武，誰知一連兩天也不見歐陽複電。獨鎮守使李純卻有急電請示：“李烈鈞已占領湖口炮台，宣告獨立。”這時黎副總統才瞧破形勢，飛電令李純留駐九江，並致電政府，詳報護軍使歐陽武、鎮守使李純的情況。政府立即嚴詰歐陽武，歐陽武答複道：“李烈鈞的確已到湖口，九、十兩團雖為他所用，但各處軍隊尚未完全兵變。”黎兼督對此仍是很懷疑。就在此時，忽然截獲討袁檄文，為首署名就是總司令李烈鈞，接著列名的還有都督歐陽武、民政長賀國昌、兵站總監俞應鴻。
黎副總統看了後，暗暗歎道：“老袁的確專製，應該被譏評，但李烈鈞他們也太性急了。前年革命弄得生靈塗炭，南北統一僅僅一年，今又結怨弄兵。袁政府根基牢固，一時也不會被推倒；就是推倒了，也未必會有後來人能夠安邦定國，隻會徒令百姓遭殃。我還是不要卷入漩渦，免得自討苦吃。”正盤算間，李烈鈞又有私函到來，接著黃興、柏文蔚等人也有電文達鄂。黎置之不理，很快又有九江鎮守副使劉世鈞來電，催促李純速攻湖口，隨後又接到歐陽武通電，說“武由省議會公舉，權任都督。北軍無故到贛，三道進兵，有何陰謀？贛人憤激得很，武為維持大局，不得不暫從所請”等等。接著，李純又來急電，說已與李烈鈞的後援林虎軍開戰了。