與慢性鼻炎鑒別
慢性鼻炎流鼻涕不呈綠膿性，亦無臭味，故觀察鼻涕的性質是鑒別關鍵;拍攝X光片檢查鑒別可準確無誤，慢性鼻炎病變局限於鼻腔，而慢性鼻竇炎則鼻竇內可見有炎性病變。
與神經性頭痛鑒別
有些患神經性頭痛的病人可長年頭痛，反複發作，往往誤認為有鼻竇炎，但這種病人基本沒有鼻部症狀，故從表現及拍X光片即可加以鑒別。