阿耳戈斯國王阿克裏西俄斯的命運，已經成了他的難以承受的負擔。在那不幸的一天，神諭告誡，他將被他的孫子殺掉。於是他便背起了思想的重擔。在那之前，國王一直疼愛他的獨生女達那厄，一想到會有許多出身高貴的求婚者向她遞上愛情的花朵，國王就感到無比驕傲。
可是現在，他改變了計劃，他希望的是不讓她戀愛。辦到這一點有一定難度，因為姑娘長得實在是太引人注目了。阿克裏西俄斯知道，狡猾的愛神會竭盡全力找出一些辦法，突破他的防範，使他的計劃無法實現。經過反複思考，阿克裏西俄斯決定，將達那厄囚禁在青銅製的塔樓裏。並且在四周布滿警衛，不讓任何人靠近被囚禁的公主一步。
雖然這樣做成功地避開了男人們的眼睛，天神卻把達那厄看得明明白白。朱庇特站在奧林匹斯山朝下望，看清楚了她的俊俏和嬌媚，還有她的孤獨。她獨自坐在銅塔的上端，眼睛裏露出一種機智，眺望遠方的城市。在那裏，與她同齡的女兒們享受著自由，隻要她們高興，家長就允許她們同相愛的男子結婚。
朱庇特鍾情於她的美麗，也憐憫她的孤獨寂寞，於是隻身前往，想能和她說說話。為了避免被發現，朱庇特變成了一陣金雨，輕輕地落在塔樓上，濺在她的身邊。他的神奇出現，以及他和她精神相通的話語，使他很快獲得了姑娘的歡心。人們說，塔樓裏的達那厄，愛不著男子，愛上了細雨。
在以後的日子裏，朱庇特經常這樣成功的拜訪塔樓裏這個曾經孤獨的女孩兒。達那厄不再感到落寞和被人遺忘，因為有朱庇特與她拉家常，消磨時光，彬彬有禮地吐露他的心聲。最後她動了心，願意同他秘密結合。沒人會懷疑塔樓有不速之客造訪，他的來去暢通無阻。
一天早晨，守衛塔樓的警衛，誠惶誠恐地奔向阿克裏西俄斯的宮廷，報告國王，達那厄已經生下一個兒子，取名珀耳修斯。國王一聽這令人驚愕的消息怒發衝冠，發誓要讓這個母親和孩子一齊死，他吩咐衛兵，將她們帶上來。
阿克裏西俄斯還沒有殘忍到那種地步，並沒因為一時的憤怒而失去理性，更不忍目睹她被執刑。於是，他命令仆人，將她和她的兒子放在一隻空箱裏，拋棄在洶湧的河流中，命令立即被執行。達那厄恐懼極了，她感覺到箱子在跟波浪激烈的搏鬥，而且已經離陸地很遠，援救也是鞭長莫及。她將孩子緊緊地抱在胸前，祈禱天神對她母子多加關照，引導他們安全抵達一個仁愛的港灣。
天神聽見了她虔誠的祈禱，於是在經過了一陣狂暴的顛簸後，箱子靠近色瑞法斯島的海岸。在這裏，國王波呂得克忒斯慈祥地接待了母子倆。在這個島國，金發的珀耳修斯長大成人，並且第一次在運動會上出現就引起了人們的注意。
同時，波呂得克忒斯愛上了達那厄，並表示願意娶她為妻。但是，達那厄沒有回複他的情感，而且明確的拒絕他了的求婚。對此，波呂得克忒斯很是生氣，於是想強迫叫她就範。這一招，惹惱了年輕的珀耳修斯，他怒吼，有他在，有他的保衛，沒人膽敢逼迫他的母親。這些大話沒有能壓抑住獨裁者的火氣，反而讓國王一心想幹掉這個說大話的年輕人。於是，國王吩咐他去殺死墨杜薩，理由是希望珀耳修斯證明他的敢說敢為是真實的。
墨杜薩這個蛇發女妖有兩個姐妹，分別是歐律阿勒和斯特羅，她的兩個姐妹雖然位列神仙陣營，但是沒有神和人為她們的美麗喝彩。墨杜薩是唯一被認為確實長得非常好看的姑娘。她的家住在終日不見天日的地方，這使她心裏很不快樂，所以，她懇求彌涅瓦，讓她去訪問陽光燦爛的南方。
當彌涅瓦拒絕她的要求的時候，她破口大罵女神居然這麽快就否定了自己。並且揚言，對她的拒絕，必然會遭致不良後果，那就是：任何凡人看到她墨杜薩，就再也不會恭維彌涅瓦的美麗，這樣放肆的話刺激了彌涅瓦。彌涅瓦決定要給予她懲治，懲治她的虛榮，於是將她美麗的鬈發變成噝噝發音扭纏在一起的蛇，並對她施了魔法，誰要是對她的臉蛋兒瞧上一眼，誰就會變成一塊石頭。
那些細心關照過珀耳修斯成長的天神們，此刻決定再次給他以幫助，讓他能夠順利完成殺死墨杜薩的任務。普魯托借給他魔術頭盔，戴在頭上，可以隨意的隱身；墨丘利將自己的飛鞋套在年輕人的腳上，使他行走如飛；彌涅瓦用她自己的光潔如鏡的、朱庇特用過的帝盾裝備他。詩人寫道：“彌涅瓦用盾牌武裝珀耳修斯，以保證在戰場上殺死墨杜薩。英雄執行的是王後的命令，就這樣，他名聲遠播，家喻戶曉了。”
裝備好的珀耳修斯，朝著北方奔去，來到格賴埃的家，一處永遠漆黑的地方。格賴埃是恐怖三姐妹，她們沒有皮膚，倒是長滿了龍的鱗甲，她們沒有頭發，頭上卻滿是像頭發的小蛇。她們的手指是銅鑄的，背上長了一對金翅膀。但是，她們共同擁有著一隻眼睛和一顆牙齒，這些東西，在她們手裏傳來傳去，大家輪流使用。珀耳修斯早已聽說，隻有她們知道墨杜薩住在哪裏。
憑借魔術頭盔的魔力，隱身的珀耳修斯慢慢靠近山洞，一點兒不擔心被發現。趁她們在傳遞眼睛時，他插手其間，順勢接住。一當眼睛在手，他對她們說，隻要她們願意告訴他墨杜薩的準確位置，他就將眼睛還給她們。三姐妹急於想得到寶貝眼睛，立即說出了他想要的答案。珀耳修斯兌現了自己的諾言，把眼睛還給了她們，又出發尋找墨杜薩。
珀耳修斯最後在模糊不清的遠方，看到了蛇發女妖的家。在靠近時他特別小心。盾牌放在他的前麵，保持一個角度，讓周圍的物體，清楚地映現在它平整的、像鏡子一樣光亮的表麵。
他發現墨杜薩睡著了。他不看別的，隻按鏡麵反射角度，手起刀落，就叫她身首分了家。他提起頭，扛在背上，三步並作兩步，飛快逃走。他害怕還活著的蛇發女妖趕上來，替她們死去的姐妹報仇。事實上，她的姐妹們發現她被殺死了，翻身下床，騰起飛上天空，環顧四周，搜尋凶手。結果一無所獲，因為珀耳修斯隱身已經逃遠了。
珀耳修斯的飛毛腿行健步如飛，跨越大地，掠過海洋。他小心翼翼地背負著令人恐懼的戰利品。當他飛速前進時，墨杜薩的血滴落在荒蕪的非洲沙漠上，變成了許多毒蛇猛獸，騷擾一方，使冒險者死於非命。毒血滴在一望無際的大海上，涅普頓用來造出著名的海上怪獸珀枷索斯。
返程路遙遙無期，使人疲乏。一路上，英雄有許多冒險經曆。一次，英雄在飛越高山時，一眼瞥見阿特拉斯仰望著天空的蒼白的臉，這蒼天，阿特拉斯默默地背負了許多年。前文說過，赫丘利曾站在這位置，替阿特拉斯背負了一陣子，讓阿特拉斯享受了短暫寶貴的自由。
阿特拉斯看見珀耳修斯向他飛來，他的希望複蘇了。因為他記得，命運女神說過，他是殺死蛇發女妖的英雄。他想，如果他能夠瞧一眼墨杜薩的僵硬麵容，他就會永遠沒有勞累和痛苦。當英雄走到可以聽得見別人說話的地方時，阿特拉斯說：“快，珀耳修斯，讓我看一看蛇發女妖的臉，因為勞動的痛苦使我實在不能再承受和再忍耐了。命運女神說過，隻有她能使我解脫。”
珀耳修斯聽從了阿特拉斯的話，當麵揭開蓋著的布罩，讓阿特拉斯看一眼墨杜薩死灰色的臉。阿特拉斯打量這張臉好一會兒，他沒有看出它隱藏著的恐怖，隻看見它美麗的破損，打心裏同情它無助的悲愁。轉眼間，凝視的眼睛僵硬了，冷卻了，珀耳修斯仿佛看到阿特拉斯的軀體向著蒼穹直伸。從他頭上飄下的白發像高山積雪，顫抖的四肢變成了粗糙的懸崖峭壁。看了墨杜薩一眼，阿特拉斯變成了大山，山峰高聳入雲，古人相信，山峰支撐著沉重的天空。
此事之後，珀耳修斯繼續日夜兼程，在海岸邊，一幅奇特的景象等待著他。在岩石重疊的海岸下邊，海浪翻滾著泡沫，拍打著一位美麗少女的身體，她被鏈條鎖在峭壁邊，這位少女就是安得洛墨達公主，她這是在替母親卡西俄珀亞的虛榮贖罪，因為母親自誇比任何一位仙女都更漂亮。這下得罪了天神，他們的懲罰就是把少女暴露在這兒，當作海怪的食物。天神送來海怪，騷擾破壞沿岸人民的平靜生活。
神諭說除非犧牲安得洛墨達，海怪才會離開，才能平息它的怨恨。珀耳修斯看清楚了，這海浪是在陪伴作為犧牲的少女。
這時，他也看見，少女腳下的水，因為怪獸在用尾巴掃動，泡沫翻湧，慢慢地，它那邪惡的軀體露出水麵。非常明顯，少女被這可怕的情景嚇呆了，她死死盯著海怪。她在哭泣，此刻的她沒有注意到她的解放者在迅速靠近。珀耳修斯說：“哭的時間有的是，但是行動的時機錯過了就不會再來。”說罷，便刷的一聲從鞘中拔出劍來，疾速跳下峭壁，向海怪發起猛烈的攻勢。岸上人群看見他在砍殺海怪，頓時歡呼聲四起，山上是快樂的喊叫，岸邊是勝利的呼聲，鮮血染紅了山崖，英雄殺死了海怪，自己卻毫發無傷。
珀耳修斯完成了自己英雄壯舉，殺死海怪，斬斷鐵鏈，解救了少女，讓她回到了欣喜過望的父母的身邊。此時，他們說，英雄的任何要求都可以得到滿足，算是對救他們女兒的感激。當他提出，他要娶他用無私和生命代價換來的少女為妻時，他們非常欣喜地讓他牽住了姑娘的手，盡管在此之前，年輕的公主已經許配給她的叔叔菲紐斯。
婚禮如期舉行，可出人意料的是被解救未婚妻的菲紐斯，此時卻要扮演勇士，要和他的情敵、即將帶走新娘的珀耳修斯決一死戰。未經邀請的他，帶著一隊人馬，來到舉辦婚禮的地方，並且揚言要搶走安得洛墨達。“我是來找掠奪我愛人的家夥報仇的。他的翅膀、他的父親朱庇特的霹靂，統統保不住他的命。”同時，他將長槍對準了珀耳修斯。
此時，國王刻甫斯說話了：“兄弟，你瘋了?你沒必要這麽衝動。不是英雄奪了你的未婚妻，而是你不願意為解救她做出犧牲，現在又怎麽能期望她還愛你呢?作為情人、叔叔，你見死不救，你放棄了她，怎能怪罪別人呢?你怎麽不跳下去殺死海怪?你當時不做好漢，現在來逞英雄，算什麽?你的自私，使你喪失了已有！不要怨天尤人，誰為她犧牲，她就應該嫁給誰。你不要無理取鬧，更不要喪失你的身份。回去吧，讓我可以安享我的晚年。”
菲紐斯躊躇了，好像是在思考並做著選擇。誰知到，他突然不聲不響地一梭鏢朝著珀耳修斯擲去。珀耳修斯機警地往側麵一躍，躲過了這次偷襲。菲紐斯的隨從應聲而上，立即短兵相接，打翻桌椅，傷及客人。他們是有準備的，而且人數眾多，珀耳修斯明白單靠武力並不能取得勝利，需要靠智慧來解決。
他喝道：“菲紐斯，是你逼我這樣做的。”珀耳修斯一聲呐喊，所有他的人都調過頭去，站在他背後。他揭開墨杜薩的頭蓋布，把她蒼白的麵孔對著菲紐斯和他的隨從們。菲紐斯以嘲笑的口吻對珀耳修斯說：“讓你的魔法去嚇唬別人吧!”話音未落，菲紐斯和他的同伴們瞬間都凝固成了石像。婚禮繼續進行了，完畢，珀耳修斯決定把新娘帶回色瑞法斯。回到色瑞法斯，他聽說波呂得克忒斯還在虐待他的母親，原因就是他母親不願做波呂得克忒斯的妻子。珀耳修斯一氣之下，用墨杜薩的頭對著這個歹毒的家夥照射去，國王變成了岩石。他將王國分給國王的兄弟，伴隨著妻子和母親回到老家。他將借來的頭盔、草鞋和帝盾，如數歸還給它們尊敬的主人。至於墨杜薩的頭，他交給了彌涅瓦，作為感謝她幫助的紀念物。這個禮物讓女神無比的高興，她把它放置在帝盾的中央，保持它石化的魔力，後來還多次因此克敵製勝。
回到老家，珀耳修斯發現，阿耳戈斯的篡位者已經竊取了他祖父的王位。於是，這位征服墨杜薩的英雄又和這位篡位者發生了大的搏鬥，最後終於推翻篡位者，並叫他付出了代價。篡位者死了，老國王重返皇座。此時的阿克裏西俄斯已經年老體弱，從囚禁他的監獄中出來時已是精力耗盡。世事難料，竟是當年他害怕的年輕人將他重新扶上王位。
不過，天神的預示是不能改變的。一天，珀耳修斯在玩鐵環時，竟意外地殺死了他的祖父。如果繼續留在阿耳戈斯，那個犯罪事實時時刻刻折磨著他，對珀耳修斯來說，真是太痛苦了。於是，他將自己的王國與米塞那阿的王國交換。長期的卓有成效的統治，給珀耳修斯帶來好名聲。他死後，一直寵愛他的天神，將他置於璀璨天空的群星當中，同置於群星中的還有他的妻子安得洛墨達和嶽母卡西俄珀亞。