當時臣具有《中興政自可為，人心不容壞盡》一疏，醜詆已甚，而若輩掩耳盜鈴，不恤也。已事無及，可為哽噎。若是者，非欲陛下誅既往，但欲懼將來耳。不然，是乾坤之兩番改易倒置，而隻為群奸諸不逞者燃灰起用之地，無怪乎有識痛恨者謂南北兩陷，皆諸奸黨怨望失職，利其深入，以為自己出頭伸眉之日，非過論也。臣之欲效忠者，七也。自五月逆寇渡江以來，雖所在**，而浙直江右等處士紳百姓亦皆各有義聲，發憤破產，募兵舉動，差足振醒群情，倡激忠義。而閩以乘輿所在，自二勳二伯閣部先聲之外，別無一旅足以佐發中軍。一錙一顆皆仰給朝廷，簡發而櫛，數米而炊，竊竊然幾成市道。夫江右之與兩越，譬之人身，則亦今日行在京師之兩臂也。一臂痿痹，則置之而若罔聞。一臂靈活，則用之而惟恐不敝。萬一右臂不仁，左臂其能起乎？臣竊以今日團練鄉兵一著，在在郡縣所宜專責一人，著實舉行。而上遊與近京城鄉，尤宜全力飭治，以緯官兵所不及。凡所在街巷村落，貴令公舉一頭目人，自連結布置，如捍怨敵。庶幾先聲可奪奸魄。不然，貪目前官爵近便之可樂，鄉居室家三窟之可戀，而先後糜爛，究竟同觀，**掠焚屠，遐邇不免。此在眉睫，顧諸臣不察耳。先臣董應舉有雲：‘殺運將至，人心先愚，惟大聖人起而救之。’臣之欲效忠者，八也。桐江一絲，係漢九鼎。計其時高風未播，亦不過富春一釣徒耳，試之以事，安知不與樊英、殷浩同譏？惟爾時漢祖容之，列諸外臣，使之高睨千仞，以陰助王化。夫以帝王之勢，屈官一故人，何啻雀之適羿？
而孰知東漢之所得者，為已多乎？方今廢籍白丁，所在成市，乞埔登壟，投拜門牆，苟負人形，粗識句讀，或能雇倩代筆上疏者，鹹思攛掇做官。一隅幾何，堪此橫溢？即如中書舍人，唐製以為宰相宣麻先兆，何等貴重！而今販夫傭隸皆得隨意濫叨。諸如此類，不可枚舉。爾時南京有‘都督量成鬥，職方滿街走’之謠，可為痛戒。士人惟負此一具骨氣頂天立地，若其平居不能自勝於利祿富貴，又何怪其一遇寇賊靡然屈膝？目今開國之初，承兩朝末流廉恥頹喪之後，似宜首以濯磨士大夫氣骨為複仇先務。不然，未有不能有恥而能不辱者。臣之欲效忠者，九也。我朝尊禮孔、孟，使人緣帖括之陋，以親見聖賢，階製科之榮，以擔荷學脈。所以列聖朝真儒輩出，如河東、崇仁、餘幹、新會、姚江、泰州、盱江、吉水諸賢鼓吹休明，揚挖聖化。其服官居鄉，一切不苟，而超然自能勝於塵垢之外，出處窮達，各成本領。神宗中葉已後，學脈寢微，然猶若曉焰辰星，耿然未散。自魏忠賢焚棄書院之後，士大夫相戒不談，而斷然以濡首利欲為安心立命之奧，其高者乃以氣魄聞見空慧雜毒當之。然施之世道人心，遠不相中。臣竊觀陛下洞達昭融，淡泊確苦，安如窮士，誠有得於光明緝熙之學。此時人間機械沉溺蔽錮已深，一旦驟與之證顏、思之傳，格格難入。第於孟子浩然、曾氏反身處，指其入路，揭之以一誠，庶有救正。昔劉安世學於司馬張九成，致於孝宗，惟此一字。朱熹亦雲：吾平生所學，惟正心誠意四字，豈隱默不以告君？後世迂之。然當時張德遠輩實用此四字不著。嗟呼！今日君臣上下皆能克己去私，實實體此四字，而有不能滅賊者，臣不信也。臣之欲效忠者，十也。凡此十事，臣懷之兩月來，積誠欲獻。徒以日不暇給，憤鬱至今。茲因陛下旌直之舉，內愧不安，集而上之。伏惟陛下赦臣字數逾格冗長之罪。”禦批答之曰：“所奏十事，國勢人心，無不洞悉，直中興第一名疏也。朕錄一通，置之座右，朝夕省覽。著加升一級，以勸直言。”
十二月初二日，帝親征，以唐、鄧二王監國。鄭芝龍留守，料理兵餉。王戎服登舟，百官鱗集，號令嚴明。泊芋江之渚。五日，乃發。
南平縣民張安禮、林中柱、張孝直數百裏躬進米豆酒漿，遠迎王師。帝嘉納之，命禦營兵部分賜諸將，且給與序班冠帶，賜號忠良處士，各賜銀牌一麵，以旌義舉。古田縣一都水口驛民有輸助者，亦以銀牌賞之。
河南兵備副使邵起遣官入賀。敕命起為總理豫、楚、直、陝、晉、齊六省提督軍務，兼理糧餉，討逆安順，便宜行事。
十五日，命周鼎新齎親征詔四通，往溫、台、寧、贛四處開讀。並順齎手敕與輔臣黃鳴俊曰：“自卿辭朝，朕切盼出關之信，乃聞今日尚滯福寧，殊可異也。況卿不由衢而從溫，廷議不然。倚卿甚重，何逗留如此？朕今親征行矣，朕若至建寧，卿必至衢州，朕若出關，卿必至江上。不然，公議無私，甚可畏也。親征詔及諭魯王書並示於卿，其善宣朕意焉。餘與周鼎新議之。特諭。”
先是七月，徽州起義師，右僉都禦史金聲於績溪山中立十有三寨，各以副將主之。績溪四圍皆山，如壁立，止前一路可通。聲等以大木為前營，堅不可拔。會鄉官黃澍時已降清，來說聲以天命，聲艴然叱之。澍陽為婉順而陰間其上下，由是各寨稍稍離心。是月，清師從寧國山中間道襲績溪，執聲至南都，不屈被殺，闔門十餘口皆自縊。徽州遂陷。時洪承疇為南都內院，招撫江南，蒞殺金聲。聲既死，屍猶立不仆。比洪還署，見聲儼然危坐堂上，洪大驚，入內恍惚，不敢出者數日。
初，道周之救徽也，軍無見糧。苦心聯絡，激勸忠勇，給劄為功賞。得之者，榮於誥敕。至有僧軍鋤棘荊以隨其後者，名曰扁擔兵。糾合九千餘人，從廣信抵金衢。安插殘黎，孤城捍衛。前後擒斬以百計，救徽援衙，厥有成績。適衢撫與道周議論不合，忌其屯師境上，遂密疏其短於朝，道周初未之知也。既而請兵不至，請餉不給，始知其由。乃與監紀趙士超議曰：“朝廷遣鄭兵各路，七月於茲矣，未見與敵一矢相加遺。敵勢愈猖，不幾笑朝廷無人耶？我輩為天下倚重，必先聲一舉為諸路倡。”遂決意長驅，將入婺源。婺源令，道周門人也，馳書誘道周，許為內應。道周信之，遂深入穀中，至明堂裏而清師四合。道周親冒矢石，誓不俱生。兵盡矢窮，遂為張天祿所擒。以道周忠烈，不忍加害，曰：“當生致於南京洪內院，得一忠義人，勝於得數十州郡也。”
遂及監紀趙士超、中書毛玄水、蔡時培、賴叔儒四人，並械送金陵。道周作詩四章，大罵不屈，絕粒積十有四日，不死。
洪承疇，故道周同鄉也，一見恐為所詬，乃托故不與通，命操江陳姓者說之。道周閉目掩鼻不言。洪乃疏救，言：“道周清節夙學，負有重望。今罪在不赦，而臣察江南人情無不憐憫惜道周者，伏望皇上赦其重罪，待以不死。”清廷不允。尋同土超四人駢斬於市。士超臨刑時，數承疇之罪而罵之，曰：“誤國老賊，夷我宗社，害我赤子，吾恨不生啖其肉。”複囑道周曰：“吾師神魂勿亂，同去孝陵見太祖，當為厲鬼陰殲之。”
二鄭既出關，疏稱候餉，駐師不進。內檄切責如雨，乃逾關行四五百裏而還，仍疏言餉絕，留滯如故。帝乃遣錦衣衛康永寧航海乞師安南。風逆，自崖而返。
是歲，安南入貢。使人衣冠頗類中國，但椎髻跣足。所貢惟金龜、銀鶴、銀爐、香絹，無異物也。
其冬，滇中亦有沙定洲之亂。定洲者，臨安蒙自土司也。父源，崇禎初與阿迷州土人普明聲、吾必奎等奉調江西，破水烏之賊。既而京營禦史傅宗龍受命按黔，知明聲勇黠，特請隨行。滇撫閔洪學入奏，言自明聲東行，滇土司兵益弱。其為時所重如此。
明聲至黔，水西賊隨就撫。明聲回滇，授阿迷土知州，日益驕蹇。崇禎五年，巡按趙洪範至臨安，明聲率兵迓之，戈甲旗幟列數裏。洪範惡之，貽書撫軍王伉，謂其養癰。伉亦習聞明聲不法，遂列奏請調黔蜀兵會討。是年冬，三省漢土兵俱集，以黔鎮商士傑掌兵政。伉自出臨安督糧。布政使周士昌監軍。擊明聲，敗之，進圍阿迷。明聲使其下偽約降，陰使人以重賄誘吾必奎曰：“君不聞兔死狐悲乎？阿迷平，兵行及元謀矣。”既而官軍與賊戰，必奎賣陣先走，官軍大敗。事聞，大司馬熊明遇以起釁為伉罪，遂與洪範俱被逮。士昌陣歿。明聲仍巧詞乞撫。廣西郡守張繼孟奉委撫明聲，思以計殺之。每稱明聲才武，且有功，不宜摧毀，以致變亂，皆有司之過也。明聲聞之，喜。
一日，繼孟將謁兵備道於臨安，先誡其下必取途阿迷，見明聲將至，故熟睡輿中，其下不得請。醒而問所次，已逾其境數裏矣。佯怒，責其從行者，且曰：“我有事，須急至臨郡，往返恐後期，可沿途置騎俟我，我今回見普公。”遂盡屏輿蓋先行，獨與從者馳數騎趨阿迷。明聲先已有人偵繼孟，聞其言，益大喜，出迎謁，語甚歡。方持茶餉客，繼孟戲曰：“常聞南中土司善藥人，我不敢飲。”明聲驚遽，指天誓曰：“方德公，無以報，何有此？公果疑，明聲請先飲。”竟易盞飲之。不知繼孟執茶時，手中預藏毒藥置茶內矣。明聲留治饌，辭以有事謁兵備急，俟回，當痛飲。明聲聞其途中言，信之，因別去。繼孟疾馳易數馬，即夕達臨安。明聲藥發始覺，命其黨率兵追之，不能及。明聲竟死。明聲妻，沙源女也，無子。江右賈人萬姓者，有女，故伎也。明聲嬖之，狡而**。明聲死，萬氏據其眾，選部下壯而美者，更番入侍。
沙源諸子定海、定洲、如琦等，皆與之私。既久，覺無以服人，乃招定海為贅婿。已複嫌其樸陋，而定洲年少白皙，更竊殺定海，而贅定洲。定洲之年，與其子服遠相若也。服遠恥之，與萬分寨而居。後服遠病死，定洲乃兼蒙自阿迷之眾，遂輕黔國公沐天波，以為可取而代也。是年八月，定洲約吾必奎聚眾反，連陷武定、祿豐、楚雄諸郡縣。吾必奎者，其先元謀土知縣，久絕不嗣矣。至必奎，以戰功得官，仍居故地。自阿迷賣陣後，桀驁日甚。至是，沐天波檄官軍及土官祿永命、龍在田等擊敗必奎，擒之。
永命，寧州土知州。在田，石屏州土人。俱以水烏之亂有戰功者也。十一月，定洲兵至，而必奎已伏誅，遂大失望。會奸人饒希之、餘錫朋等逋騙天波金寶無以償，以貿易往來各土司營中，誇天波家饒富。定洲心動，陰結都司阮韻嘉、張國用、袁士弘等為內應，以十二月朔入城辭行。天波以家忌未出見。定洲入門大呼，其下蜂起焚劫。天波由小竇出西城。時祿永命在省，方巷戰拒賊。從官周鼎止天波留討賊，天波疑鼎見誘，殺之。
遂走楚雄。其女陳氏、妻焦氏亦走城北普吉村之金井巷，即夕自焚死。天波弟天澤、天潤皆遇害。定洲因盡得沐氏所有，盤踞省城，劫巡撫吳兆元為題請，言“天波叛，沙定洲起兵定之，應以定洲代天波鎮滇”。兆元不可，拘之別室，奪其印，以偽疏入告福京。定洲遂行府事。又至祿豐，執家居大學士王錫袞置貢院，脅之與兆元傳檄各郡縣。龍在田在安寧，與祿永命等各引所部歸。
萬氏在阿迷，聞變，驚曰：“吾家當為此賊敗矣。”謀至省執定洲以投誠。既至，見定洲氣焰赫然，資用饒給，更喜過望。夫婦坐八人輿，持刺與撫按往來，欣然自得也。沐天波至楚雄，定洲率眾追之。是時，楚雄新為吾必奎所破。金滄道副使楊畏知奉調監軍至楚雄，楚人留之。畏知遂駐楚。聞定洲西出，與天波計守西禦之具，未集，曰：“公在楚，賊以全力聚攻，城必破。公不如西走永昌，使楚得為備。賊即西追，恐楚塞其後，留攻楚，又恐公從西來。首尾牽製，上策也。”天波從之。定洲至楚雄，城閉不得入。為畏知所紿，遂去。遣其黨王朔、李日芳等分攻大理蒙化，陷之，屠殺以萬計。畏知乘間撤城外居民盡入城，清四野，築隍陴，檄調漢土兵。郡縣多遙應之。
隆武二年丙戌春正月己酉朔，帝不受朝賀，以三大罪自責，布衣蔬食。諸臣各戴罪。
敕上遊巡撫吳春枝選募健丁，精勤訓練，曰：“上遊關係，不減關中河內。朕方倚卿以蕭何、寇恂之任，幸自勉施旃，以膺重賞。新募兵糧，準照各營例給。”
平夷侯鄭芝龍僭用“監國留後”四字，詔改正之，曰：“福京任二王為居守。卿以勳輔為留後，原無‘監國’字麵。卿還將題奏文移照敕填注，不可錯誤。”
罰舊糧道夏尚糸萬金，以助兵餉。複命禦史陸清源核其素行，不得一毫含隱，以廣懲貪勸廉之風。尚糸貪聲載道，時吏部主事王兆熊以為言。尚糸有死灰再燃之意，故樂助雲。
左都督楊鼎卿細陳起義情由。詔答之曰：“人君大柄止在知人善任，人臣大義惟是勿欺至公。朕久曆艱難，稍識情偽，朝廷壞於朋黨，祖廟由此兩危。北京之失，東林之罪何辭？南都之陷，魏黨之咎莫謝。其餘門戶聲氣，朕自有萬古鑒衡以禦天下，諸臣萬疏千章，豈能奪朕心公斷？靖夷侯方國安力扼江幹，大功實在宗社。朕今親征在邇，指日相見，未盡之情還俟麵奏。楊鼎卿父子還終始調聯，以待王師之至。”
禦營吏部尚書路振飛進《奮練義勇說》，帝曰：“此真安攘大略，書策留覽，暇當為卿序之。”
時天興府貢生鄭獻可謀立生祠以祝萬壽。詔責之曰：“朕紹大統七月，祖陵不見，疆土不複，臣子因循不能變，百姓湯火不能援。擢朕之發，不足數朕之罪。惟此一念身殉太祖，天地臨之。自登極八閩，上無血性擔當之依，下無愛民如子之臣。出餉之微，累我百姓，朕實痛心，有何功德而作此無妄建祠之事？且即中興一統，亦斷不學喪心文武，剝了民，還受諛獻。生祠之事，鄭獻可速速行止，無重累吾民，增朕之罪過。禦營該部速行文與該撫按傳示。”
是月，沙定州攻楚雄，不能下。一日，楊畏知坐城樓，賊發巨炮擊之。煙焰所指，正罩畏知，賊謂必死。須臾煙散，畏知端坐如故，惟擊去左幘耳。因驚歎以為神。畏知視賊懈，輒出奇兵奮擊，前後所殺甚夥。賊引去，東攻石屏。石屏守亦堅。複攻寧州，破之，永命死。龍在田在石屏，與其黨許名臣竄大理。定洲既定迤東，複西攻楚雄，分兵為七十二營，環城圪濠為久困計。畏知守益堅，終不能入。未幾而四將軍之師自黔入滇，定洲解楚雄之圍，陳兵革泥關以拒。四將軍以兵五萬突之，沙兵大敗。四將軍者，孫可望、李定國、劉文秀、艾能奇是也，皆獻賊義男。獻賊伏誅，去偽號，欲迎黔國以輔王室。會閩中遣太監孫興祖調沙兵入衛，四人謂孫興祖曰：“朝廷遠不知滇事始末，今若征之，是獎亂也。不如討平沙逆，迎還沐爵，使之引兵東向。”興祖然之，傳檄至雲南。定洲殺故大學士王錫袞以宵遁。
鄭芝龍、方國安合疏薦舊輔馬士英。兩人故士英門下也。時國安營錢塘江上，士英在其營。詔即充為辦事官，軍前辦事，許以圖功自贖，俟恢複杭城複官。
敕諭楚督何騰蛟曰：“國運中微，朕勉繼統。雲龍風虎，舍卿其誰？今朕親征，暫駐建水，先遣輔臣蘇觀生瞻奉山陵，宣安兵將，與卿同心，先複江省，繼靖南京。並撫鎮劉廣胤等，複江省者封世伯，複南京者封世公，複北京者封真王，具如明詔。卿其勉之。”又諭雲：“楚、粵、雲、貴，近有異聞。卿可挽天無二日之義，以全朕骨肉之情，尤所殷望。”
提學禦史毛協恭進同鄉各臣書疏。帝讀畢感痛，雲：“江南士紳無不灑涕思明，枕戈待舉。朕必親提黃鉞，張皇六師，以慰臣民之望。大小文武，當時時刻勵爾誌，毋狃偏安。”
諭督剿蜀寇兵部尚書王應熊曰：“輔臣密勿重任，出總軍旅，原非常之艱難，托非常之親信。當使萬裏之外，宛如咫尺綸扉。朕以臣民擁戴，繼統危微，倚卿元老，如身有臂。祖宗疆宇凡有未複，即朕躬之有罪，亦耆輔之深羞。朕或用人行政之不善，卿當有聞即告。況四川為卿之桑梓，朕之版圖。大小文武舉用一以委卿，一切軍民機務即假卿便宜。”
應熊又疏陳西南形勢。複手敕答之曰：“覽卿奏，詳陳興複次第、天下形勢，朕意豁然，深嘉卿碩畫。朕自慚虛薄，何能負荷多難？但稍秉仁孝之性，切勵除雪之誠，一誓清孝陵，二誓葬烈廟，三誓迎聖安。半載恨無寸功，親征暫蹕建水。天以元老留輔朕躬，將以中興全功托卿，豈但西南倚賴？餉濟維艱，朕必從長力行撫措。朝廷時切兵行餉設（之籌，卿亦預申老師匱財之戒。上下交警，不日功成矣。切望切望。”
敕江西輔臣楊廷麟、督臣萬元吉、臣曾之遴、陳泰來速備兵迎駕。
手敕輔臣蘇觀生曰：“朕以卿與楚督定興伯何騰蛟為左右兩臂，卿兩人必無一毫矛盾，百事一德一心，以釋朕慮，以佐中興。兩美必合，預防宵小交構。戒之記之。”。
時王應熊上疏言恢複蜀中諸郡縣。帝答雲：“卿力恢殘敗封疆，屢勝猖狂逆寇，用餉僅十五萬，不取空城偽印為功。信從前覆京弊端，賴我元臣一洗。朕誌削平天下，聞此大慰於心。至獻賊之殘忍，手砍數十萬生靈，朕實不勝痛憤。若不速救斯民，何賴對我太祖？望卿力任平賊，朕必有請立應。至搖黃諸寇，罪原輕於獻賊，卿還善用戎索，俾為我用。若能以搖平獻，釋過賞功，必不失信。卿以不殺止殺，圖機出之仁惻，尤足嘉悅。”
粵督丁魁楚辭封伯爵。不允。諭之曰：“朕當艱危繼統，全賴閩、粵合濟中興。卿有聞檄擁戴之大忠，又有迅平逆寇之巨績。王守仁當全盛之時，無推奉之事。以卿比之，功實為過。世伯之頒，卿當欽受。乃奏引四咎，愈見奇勳。況朕繼統半載，寸功未立，倚卿兩粵，如臂護身。還宜勉奉恩綸，仍舊督理，俟朕得拜孝陵，另敕召卿入覲，誓成中興君臣始終。言出真切，不可再辭，負朕激望至意。”
特禁雲山禪寺僧宗德聚眾建醮、誦諸天菩薩寶號。
大理寺少卿熊化疏請恢複之策，必先首定江西。且曆陳關外隱著。帝答諭曰：“恢複始江西，自是正著。但隨機應變，亦難執定一局。其錫璽書與永寧，授閻羅宋等以官職，俱已行了。至批答谘度二事，關切朕躬，朕深嘉納。條陳泛濫，希冀得官，實效罔聞，徒開幸竇，俱近日弊習，允當一一裁汰。熊化老成沉靜，無黨無偏，朕所孚鑒。”
川陝總督樊一蘅遣官入賀，帝答之曰：“太祖櫛沐之天下，兩都武陵，三誤而有今日。朕勉答群請，繼統艱危。我君臣當盡改覆轍，打起精神，實實愛民，實實治兵。人心天意，興複可必。樊一蘅才名久著，萬裏投誠，亟當勉佐中興，與雲台之列雲耳。”
甌寧縣知縣趙庾陳政事疏。帝嘉之曰：“趙庾此疏，言兵言將，言餉言戰守，包括已盡，即可為今日閩疆禦備之要著。下部看議，著實舉行，毋忽。”
益陽王私授縣官。詔禁之曰：“國家敦厚懿親，自有典製。朕複天性篤愛宗枝。王借受慈禧之命，又借勳鎮方國安之推奉。近日表奏雖來，公然用監國之寶。不知此寶授自何人？勳輔士英、國安疏王本末甚明，朕正不必顯戮。乃到處騷擾，妄行升授。複聞播害龍遊，民苦不堪。又圖遂昌，尤礙法紀。著地方撫按官速速止王回嚴，以明大義。”
敕廣督丁魁楚、按臣王化澄、鎮臣周仕鳳曰：“朕因兵力未厚，致稽出關。卿等仍照前旨，募兵五千，不可為浮議疑阻。再召狼兵七千，俱準支銷正項錢糧。仍命大將周仕鳳督至禦營，隨駕征剿。朕親至虔入楚，以收天下全局。卿其力讚成功焉。”
敕兩廣事例銀五萬兩付何騰蛟，為收拾降兵、取江克京之用。
聯絡恢剿兵部尚書楊廷麟疏留粵餉以備大兵。帝以粵餉為禦營急需，萬不可留。但念卿剿事方殷，量留五萬，湊前五萬，以成剿局。速複江省，以迓乘輿。俟地方恢複，動支正項，並行勸輸的用。
二月，廣督丁魁楚俘逆藩亨嘉及從逆顧奕、楊國威等，遣總兵馬吉翔械至建寧行在。帝命楚、淮諸王會議，免為庶人，於連江安置。敕奉新王嚴加鈐束，不許令見一人，透出一字。若有毫厘疏虞，地方官從重加法，王責亦無所辭。靖庶尋病死。顧奕等棄市。會冊封桂王，並封丁魁楚平粵伯，予世襲及鐵券。陳邦傳富川伯。晉瞿式耜司馬兼副都。式耜辭曰：“國家禍變，構難同室，詎臣子稱功地？西臣辦西，奚以功為？”不聽。乃複授兵部右侍郎。
是時浙東亦奉魯藩監國紹興。
輔臣曾櫻薦晏日曙巡撫廣西。式耜得代，遂放舟東下，山水詩文自娛。
升馬吉翔都督同知管錦衣衛事，尋領敕招撫流賊李錦。錦即自成嗣侄也，號一隻虎。
初，自成陷京師，沿邊鎮將望風披靡，獨關寧吳三桂乞師往征之。三桂美豐姿，善騎射。軀幹中人耳，而勇力絕人，沈鷙善謀。弱冠，中翹關高選，裘馬清狂，風流自豪。嚐嬖一玉峰妓曰陳沅者，即俗所傳陳圓圓也。年十八，籍梨園，每一登場，花明雪豔，冠絕當時。三桂欲娶之而未果。崇禎末，田妃擅寵，兩宮不協。而流氛日熾，羽書倉皇，宸居不怡。戚畹嘉定伯以營葬歸蘇，將求色藝兼絕者，由母後進之，以分西宮之寵。因出重貲購圓圓，載之以北，納於椒庭。一日侍後側，上見之，問所從來。後對“左右供禦，鮮同裏順意者。茲女吳人，且嫻昆伎，令侍櫛盥耳”。上製於田妃，複憂國事，不甚顧，遂命遣還。故圓圓仍入周邸。
時三桂已累遷節鎮，方奉詔出駐山海。嘉定伯餞之甲第，出女樂侑觴。圓圓適在列，輕鬟纖履，綽約淩雲，每至遲聲，則歌珠累累。三桂黯然魂消，停卮不語。詰朝，使人道意，有紫雲見惠之請。嘉定欲拒之。或說之曰：“方今四方多事，寄命幹城，嚴關鎖鑰，尤稱重任。天子尚隆推轂之儀，將軍獨專受之柄？他日成功奏凱，則二八之賜，降自上方，猶非所吝。君侯以田竇之戚，坐膺紱冕。燕、趙芳脂，吳、越媚黛皆得致之下陳，何惜一女子以結其歡耶？”嘉定許諾。三桂陛辭，上賜金三千。三桂分千金為聘，師行期迫，未及娶也。嘉定具奩飾媵，送其父家。十七年二月，賊勢孔亟。給事吳麟征請棄山海關外，召三入桂人衛。三月，始棄寧遠。詔封三桂平西伯，率兵入衛。以道梗不得達。十九日，賊陷京師，執三桂父，勒令作書招之。隨遣使賞銀十萬，犒三桂軍。賊素畏三桂故也。三桂得書，欣然從賊矣。既而詢使以陳姬安在，使以籍入告。乃按劍而起曰：“大丈夫不能保其室，何用生為？”作書以絕其父曰：“李賊猖獗，我國無人，遂致京城失守，聖主晏駕。意父奮椎一擊，誓不俱生，否則刎頸以殉國難，亦分也。何乃隱忍偷生而又訓以非義？父既不能為忠臣，兒亦安能為孝子？請從此訣。”勒軍入關，縞素發喪。
賊得書，怒戮其家三十八口，係東行。三桂妻亦遇害。而圓圓翻以籍入無恙。
四月十九日，賊從一片石出口，東突外城，遂薄關門。三桂窘甚，乃乞師於清，隨清軍南下。三桂為前鋒，清九王為殿，英王為左翼，統萬騎從西水關入。豫王亦統萬騎，張右翼，從東水關入。
先是，賊軍師宋矮子諫自成雲：“皇爺去，皇爺不利；三桂來，三桂不利。”自成不聽，出師至山海關，與三桂接戰。三桂兵敗。宋矮子雲：“明日午時，數當大凶，宜收兵回京。”又不聽。是晚宋矮子忽失所在。次日日中，忽見塵沙山起，聲如雷鳴，軍士色戰。自成方錯愕間，而清師突至擊之。自成大敗，盡委輜重婦女而奔。立梟首，懸之於纛。將殺圓圓，圓圓謂闖曰：“妾聞吳將軍已卷甲來歸矣，徒以妾故，又複興師。今殺妾，何足惜？恐妾死而不利於王，奈何？為大王計，宜留妾以係其心，當說彼不追以報大王之恩遇也。”賊亦不能複戰。幸三桂之不即圖己也，乃棄圓圓而去。
三桂方度關，至山西，晝夜不息，尚未知圓圓之存否也。其部將已搜訪得之，飛騎傳送。時三桂駐師絳州，將欲渡河。聞之，大喜。遂結彩樓，備翟佛，列旌旗簫鼓亙三十裏，乘香輿以親迎焉。既成婚，三桂遂置討賊事於不問。辛未進士吳偉業乃作《圓圓曲》以譏之，有“慟哭六軍皆縞素，衝冠一怒為紅顏”之句。
自成奔至紫荊關，遣降賊將唐通守之。通複降於清師。自成複至陝西，部署殘兵，尚餘五十萬。而清師三千卒至。自成曰：“來何神也。”遂發兵圍之。三日夜人馬寂然。自成不敢擊，欲伺其動靜，方剿滅之。而清兵複至，三千騎從中奮起，金鼓齊鳴，左右衝突，內外夾攻。自成複大奔。追至黃州，自成單騎先奔，及通城九宮山，鄉寨王氏兄弟擊殺之。時自成餘眾尚三十萬，錦代領之，與自成妻高氏、氏弟一功並左營郝永忠等渡洞庭，竄踞山寨。吉翔招之，不從。而督師何騰蛟與堵胤錫往撫，乃受封號。封錦為左軍侯，掛龍虎將軍印，賜名赤心；高一功右軍侯，賜名必正。其他部將皆通侯，號忠貞營。並封高氏貞淑夫人。頒敕諭雲：“朕念赤心昔日托身非所，乃今翻然悔悟，竭奉中興。雖名臣必待真主，亦賴其有賢母而端慈訓也。據督撫連章報其至誠歸戴，已掛印封侯。俟朕駐蹕武昌，然後麵錫鐵券，再允督撫之奏，欽旌母德之貞。爾以善教為慈，赤心以遵母為孝，慈孝既萃於爾門，忠義必恒於功業。特賜爾封，給與恩詔。仍著有司豎坊，敕文用淑讚中興，朝廷風標萬方，爾門芳留百世。皇後聞之，再三嘉歎，麵請加恩。賜爾珠冠一頂，表裏四疋。令聞遠被，以顯恩綸。爾高氏當時以大義訓赤心，俾其一德明良於終始。全恢江省，立複金陵，一統功成，爾子拜爵於奉天殿，爾身奉恩於坤寧宮。史冊昭然，豈不偉歟！爾母子其欽承朕命。”時楚督何騰蛟疏：“聞闖賊既滅，其黨郝搖旗有指示之功。”故特賜郝名曰永忠。
時嚴州告急，三衢震驚，督輔黃鳴俊具疏入告。特敕行在兵部連發兵三千，應援衢州。
敕處州道臣董振秀以麗水、青田、縉雲、宣平、景寧五縣餉銀給勳臣劉孔昭，以龍泉、遂昌、鬆陽、慶元、雲和五縣餉銀給楊文驄。時二臣互有爭執。複手諭之曰：“師飽在餉，師克在和。與其同餉而涉於爭，不如分餉而歸於和。今複兩臣同心協複，勿再爭競。近聞年荒餉急，民困難支，仍將民糧分限催征，以息民力。兩臣亦不許差人至縣，辱官虐民。違者該管官具疏參奏。”
金衢道臣疏陳衢州士民驚竄，庫藏空虛，藩宗烏合之兵盤踞於內，淳遂鴟張之寇**於外。如此艱危，速宜救援。乃敕都督同知施福提兵出關，以壯聲勢。
歸化縣複征十七年已免之糧，以備王師。詔禁止之。
諭兵部尚書郭必昌曰：“朕自登極以來，諸臣未有催發事件者，今始於卿見之。具見慎重關切，朕心嘉悅。每日文書甚多，俱經朕之手眼方行。此後卿部凡有要緊本章，即於封上搭一紅簽，上書六字曰‘要本乞速批行’，庶即先批發。以後卿切記著。”
兵部尚書朱大典擁重兵於金華，與方國安勢不相下。帝敕其協心和氣，共濟時艱。至是齎和本至，乃加閣銜。大典疏辭，帝諭之曰：“卿忠勤幹濟，勞苦功高。朕衷實切眷倚，宜祗承明命，以慰朕遠懷。”大典因疏薦使臣兵科給事劉中藻思苦慮深，學純力定。帝召對，稱旨。
鬆江捷書至。賜督臣荊本徹、鎮臣黃斌卿、張名振各銀二十四兩、表裏四端，以示激勸。餘將帥各升級有差。
命戶科給事李日煒督催汀、邵、惠、潮四府糧餉。其借助過者，準作三年預征。
帝欲不次用人。鎮江諸生錢邦芑者，芝龍門下也，召對中旨，擢為監察禦史。熊開元執不可。不聽。已而邦芑論開元。開元辭去。
中旨以王期為總督，彭遇覬為僉都禦史。路振飛、曾櫻封還內降。帝曰：“方今多事，用人必欲循調，非休休之度。”振飛言：“遇凱新進士，降賊西南。乞憐馬士英，巡撫浙江，搜括民財，至於激變。期升在太湖，奉劍州知州朱盛征，始稱通城王，繼稱皇帝。賣官奪女，兩山百姓不容。故爾逃來，非臣等之私隙也。”帝乃罷二人。
先是，建寧行在即巡方署，閣臣蔣所營也。以湫隘喧嘩，屢形責讓，乃於三月初一日移駐城外伽藍。初六日，登舟。十一日，抵延平，以府署為行宮。
兵侍東閣陳洪謐在籍。遣內官鄧金趣之，不至。
馬金嶺兵變。命路振飛至浦城告撫。
廣東布政使湯來賀運粵餉十萬，由海道至，擢兵部右侍郎，督師江右。禦史艾南英言：“來賀奸忄僉小人。周鍾自北逃回，來賀匿之揚署。其解餉之任，指揮僚佐所優為，豈曰能賢？遽膺顯擢，何以示後？”不聽。
敕黃斌卿曰：“卿孤軍久處舟山，援餉不繼，朕每以為念。今得張名振資助萬金，克複蘇、鬆可望。其大鳥鏡、硝磺、槍刀、鉛彈等項，一並給發。”
鄭芝龍進浙江水陸圖。帝曰：“觀斯圖，備悉奇正之著。五路並出，與合太湖義兵為策應，使西興將士為我出力，俱是全著急務。卿其速規進取，毋但僅托條陳。”
總兵胡來貢縱兵抄糧焚劫，特詔禁之。
敕朱成功招置鄭彩逃兵，毋得令其驚擾地方百姓。
下遊巡撫吳之屏疏陳時事孔亟，內防宜周。帝曰：“泉州新舊兵額一千一百餘名，歲需餉銀七千餘兩。除紳衿每田一頃助銀一錢及典鋪、車鋪、灣船、海船資助外，可足歲支之額。足見爾用心料理。務使兵民相安為要。”
諭唐、鄧二王曰：“京中民情安堵，市肆不遷，朕心慰悅，親征原以安民。閩都根本重地，王等還多方曉榆，禁戢逃兵。朕若早覲孝陵，自有蠲免恩詔。”
帝將取道於汀。餉部侍郎李長倩以汀屬空虛，請留餉三萬，以訓練土著而備緩急。帝可其議。楚兵複霄粵餉，以前十萬兩不足用。李長倩以為言。帝雲：“留餉已有前旨。該鎮共事一方，著與通融接濟。俟朕至軍前，再行酌處，毋得紛爭。”
諭大學士熊開元曰：“卿以聰敏執持，受知簡用。朕昔不以人言而用，今豈以人言而舍？著調理安痊日，即來行在辦事。馬借人乘，尚為厚誼。豈君臣之際任重綸扉，何必繳進？著留為病愈入朝之用。”
敕浙東巡按禦史郭貞一賑恤驛遞曰：“祖製，地方設立驛遞，原為上下通達道路，流貫血脈，事關非細。近日文武諸臣忠上之心既微，恤民之念更短，累我百姓，苦竄驛官。先帝屢下明禁，諸臣欺蔽相仍。今日殘疆，驛騷尤甚，朕所痛恨。溫、處、衢之免應副，已奉明旨。其金、嚴、紹、寧、台五府，所當一體恩恤。非是緊急軍機，一切不許應副。如有抗旨害民，三尺俱在。該撫恪體，以蘇吾民。”
馬士英叩關來朝。先是，曹學以罪輔不可入關揭士英，故帝數其罪，不許，諭守關官兵毋納士英。士英前後七疏，列件自理。帝命付史館存案，以俟公論。
監國魯王遣柯夏卿、曹惟才來聘。帝加夏卿兵部尚書，惟才光祿寺少卿。手敕諭監國曰：“朕無子。王為皇太侄。同心戮力，共拜孝陵。朕有天下，終致於王。取浙東所用職官，同列朝籍，不分彼此。”尋遣僉都禦史陸清源解餉十萬給東浙。清源散餉不平，兵嘩而遁。或曰士英唆方國安斬之。
左都督楊鼎卿固卻魯藩令印，王手敕嘉之曰：“若鼎卿者，可謂忠藎能明大義矣。朕與魯王，原無嫌疑，前付柯、曹二使臣啟答王書，或未之見乎？”
諭左都禦史熊開元曰：“宣德達情，全藉巡方禦史。近來積弊因仍，貪者工攫取，傲者喜逢迎，以致民窮無告，盜賊繁興。殊可痛恨。卿還嚴訪詳諭，務令激揚得法，吏畏民懷。有不稱職的，即參來重處。”特設建言簿以壯敢言者之氣。從開元請也。
廣西撫按報一僧自稱弘光，謂黃得功營所獲者，非真也。帝召九卿科道議迎請。群臣曰：“即真弘光，甫經失國，有遵奉而無迎請。”撫按續報，有侍弘光者驗之，果偽。下獄究之，妄人假托以惑眾耳。即時處決。
十四日，清師下吉安，又下撫州。初，汀、韶間有大帽山，洞蠻強甚，屢征不伏。永寧王誘之出降，遂與清師屢戰屢捷，因複撫州。清師圍撫，鄭彩屯廣信，永寧請救。其監軍給事中張家玉以三營往，撫圍暫解。已而複合。彩遂棄廣信入關。撫州複陷，永寧王死之。洞蠻亦散。帝削彩爵，戴罪立功。
楚督何騰蛟遣長沙知府周二南誘降李賊餘眾四十八部。二南中流矢死。賊帥欲得騰蛟親至乃降，騰蛟即往，賊帥皆驚喜下拜，至軍前聽用。一時驟增兵馬數萬。帝喜，告太廟。封騰蛟為定興侯兼東閣大學士，降帥皆授總兵。而長沙餉缺，降者稍稍解體，賊帥袁宗第及田、高諸部掠舟而去，獨郝永忠、王進才留麾下。
有泉人蔡鼎者，多言，李密疏薦為前知。召至，以方外服見，封國師。然所言庸鄙，試以占策，亦無驗。彩既敗回，鼎請自試。一戰而蹶，逃回。帝謂國家元氣之削，由於靖難。命禮臣追複建文帝年號，忠臣方孝孺祠設姚廣孝像，跪於階下。
自吉安失守，督師萬元吉、都憲陳賡、兵曹王其宦議列柵守張家渡。而潰兵勢不可止。陳賡收散亡入贛，萬元吉退守皂口，惟安遠江起龍兵三百人。時蘇觀生以閣部督師於贛，同鄉李陳玉、楊仁願、丘塤、楊文薦、範六吉、周待詔、劉李礦皆請發師援皂口，觀生發新威營二百人。元吉以監紀程亮督之，下守端津灘。楚帥曹誌建以二千人至，一夕即噪而去。
四月初一日，關警頻傳，人心惑亂。敕唐、鄧二王力行保甲法，以固根本地方。
太仆寺少卿淩超疏陳“急做實做，不出‘君謀臣斷’四字”。帝稱其要言不煩，下部議之。
兵部主事張儼上《定廟算而後動疏》，帝覽之，歎曰：“此疏洞晰軍國事機，朕三複之，不忍釋手。行在該部，其力行之。”
滇撫吳兆元疏辭敕書印劍。帝諭其加意料理，曰：“卿久撫滇疆，弘宣猷績。正資善後，毋貽朕南顧憂。掃除沐天波，業有成命。不準辭。務令南人不反，以成一統豐功。朕複另有酬敘。”
諭德興王由枵曰：“江民苦兵，甘為夷用，情罪可原。赦過之條，已括於‘有發為義民、無發為難民’十字中。”
敕諭閣部諸臣曰：“國家雖當搶攘，乃文事武備，兩難偏廢。近據兩廣、雲、貴俱已開科，豈福京八府勸進全節、守關措餉之人不在大比之例？江浙紳衿向風，尤不可不俯答其望，行在禮科確議奏行。”
先是，靖庶頒偽詔至貴州，巡撫範礦固卻之，且厲兵固圉。至是，礦進拱戴疏。帝以其忠義，加右都督。
黃斌卿久托舟山，未有寸功，虛糜廩餉，乃削伯爵。
魯監國以公爵封芝龍兄弟，遣左軍都督裘兆錦、行人林必達奉命而來。帝以其惑眾欺侮，兼以芝龍兄弟愧憤不出，諭令囚之，以候常朝日麵質。後兆錦以金贖刑，必達亦複原官。
諭輔臣黃景昉曰：“福京訛傳驚避，潰兵竄逸，山寇乘機抄掠。兵單餉絀。根本之地，動搖如此，深為可憂。所議歸並事權，以憲臣兼製二撫及兵道移駐福清等事，卿其確議力行之。”
答諭吏部主事鄭賡唐曰：“朕獨居不禦酒肉，力行已久，豈為難事？若王言屢易，時勢使然，朕豈得已哉？至求治過速，止為心切覲陵。爾言言藥石，遠識深心，朕心嘉悅。”
謂侍臣曰：“近日兩京覆後，武臣冒濫驕貪已極。怯禦夷而勇殺民，巧淩躥而無法紀。何能破其積習？”
初五日，帝誕辰，諸臣先一日請賀。帝不受，曰：“朕奉大統，已近十月。孝陵不見，百姓不安。文因循於內，武擾害於外。中興事業，茫無端緒。蔬菜自勉，豈可晏然自居以聽群工慶祝耶？惟於行在所總用太牢一分，遙祭二祖列宗，唐國祖宗另設於旁。”
清師逼崇安。帝敕施福速統兵出關驅剿，命輔臣蔣德督之。福顧遷延，德複疏趣之。帝歎曰：“如此情景，與鄭彩進關、張家玉守新城何異乎？”
工部尚書鄭為國姓成功請發鳥銃，帝曰：“國姓圖功，雖是急務，禦營兵器關朕躬命身，鳥銃豈可全發？如此等事，該部以司空大臣全無執裁，惟請朕躬為推卸之地，鄭何無骨力至此！姑且不究。”
鄭芝龍疏陳閩省守關兵餉器械衣甲，共用銀一百五十六萬。帝諭之曰：“卿兄弟純忠大節，擁戴朕躬。中興大事，非卿誰托？據奏即竭三省之物力，亦不能不窮於接濟。地方錢糧，隻有此數。若不內外兼顧，剿守並行，大害大禍必然飆至，中興事業必不忍言。從未有藩籬不顧、止靠家門堵賊者。此理至明，不待再計也。前卿兩次議奏用兵四萬，猶恐用餉難繼。今必先議守，後議兵，以三萬守關口，一萬守腹裏。此數之外，再不可增。若持議不決，曠延時日，即朕自誤高皇也。卿當遵依，以全守關之事。若複再有爭執，再有推卸，是彼蒼不欲中興，朕亦隻有避賢路而已。”
是月六日，清師至皂口。新威營先潰，江兵次之。萬元吉亦遂入贛。贛城民倉皇爭竄，元吉欲殺其妾之出署者，人心乃定。十一日，楊文薦自任城守。命中書康範生乞師於南雄。舊贛督李永茂遣副將吳之蕃、遊擊張國祚率兵五千人至。十四日，清師臨贛。蘇觀生率所部退守南康。滇粵諸軍先後至南康者以數萬計，皆惴惴莫敢下。二十九日，閣部楊廷麟自雩都力促新撫閻總及張安各營兵四萬餘至贛。江撫劉廣胤自寧都召募二千人亦至。然皆未敢逆戰。
帝命建祠祀江西死難曾亨應、黃端伯、蕭漢、李大覺，名曰四忠。以曾筠、徐蜚英配享。時有王錫者，亦同死難。並敕禮部予諡以表之。
處州府貢生李瑞庚疏陳恢剿三策、治安五要。帝覽其疏曰：“以搗淮為恢金陵、複江浙之神著，以出兵九江為破南昌、固嶺南之急著，以奇兵襲江口、以偏師複徽為上下應援之緊著，三策俱說得是。治安五要，於養民、任賢、生財節用、獎廉懲貪諸務，深明洞曉，應是通才學古”。
敕諭楊文驄曰：“大明寶祚，啟自太祖，兩遭覆陷。凡為太祖親孫，有能攘臂先立，則太祖神靈有依，大明國祚斯立。朕與魯王，大義正在於先後，名分尤在於叔侄。魯王先立，朕雖叔輩，斷當北麵魯王，以存太祖。若複後立，是名為爭。總一立也，先立以存太祖為孝，後立以壞祖宗為不孝。今朕先監國登極四十日，在萬古自有至公，豈今日一二佞舌可以顛倒？楊文驄受知最早，殺蘇寇以明大義，勸魯藩而篤尊親，本末甚明。人言雖如其麵，朕心自有鑒裁。所進陳函輝啟稿，不堪一笑，鬼蜮滿紙，宜靖夷侯參奏以為食肉寢皮之可恨也。朕愛侄王，萬不得已，業允勳鎮所請，以明太祖大法。該督尚慎終如始，善保地方，善行宣撫。得覲孝陵，朕必不負元功”。
贈鬆江死難原任長樂令夏允彝右春坊右中允，給祭葬，諡文忠。
帝覽戶科給事黃周星疏，曰：“奏內三寒心處，真可寒心。盜賊公行，民生凋敝，兵將退縮，左藏罄懸，罪訾蜩沸，角戶分門，全不以國恤為念者，大小文武諸臣之罪也。政教不行，威令不信，舉措刑罰失中，廷議紛紜狡竊者，是則朕躬之過也。從今君務改弦，臣亦須猛省”。
敕諭禦營內閣傳示臣民曰：“臣民擁立朕躬，朕誌誓救民雪祖。外寇雖狂，尚可暫守而養戰銳。諸臣議論紛紜，殊為道旁築舍。今征士蔡鼎回報關上情形甚確。國姓成功巡關回來，迎駕暫至邵武，相機出關。二十八日之行且止。總之，自古創業中興，誰不危而後濟？朕惟以寧進死不退生六字自誓，並以六字察驗臣工。此後除戰守駐蹕一聽條陳外，若有敢請駕回天興並請退避廣東者，諸臣必從重議罷，餘必立斬以徇。朕心通於上帝，臣民仰體欽承。”
副都禦史荊本徹疏請小踞可資戰勝。帝諭以閩中方用水師，覽此奏誠為要著。下部議之。
閩縣、侯官縣耆老詣延津請駕回福京。帝感歎曰：“即位十有一月，無時不思靖祖救民。飛蹕既久，豈得回鑾？固知入虔嵐險艱辛之狀，但恨在閩不能安閩，閩民不負朕，朕負閩實多矣。”
建寧諸生請駕再臨建水。帝曰：“朕進取之念，甚堅甚切，萬無轉蹕之理。但謂農家力作，征役宜寬，朕亦耿耿於中。”
敕於華玉迎駕兵須嚴加約束，曰：“朕之焦勞日夜，誓救湯火之民。於華玉豪爽忠敏，才敵萬夫，受朕深知重倚。必要嚴約兵將，令民間草木不驚，方為扈駕時雨之師。”
江撫劉廣胤以行宮刻期告竣，疏請駕臨。帝答之曰：“朕蹕位虔南，收複江右，即移師入北，廟謨久定矣。隻以閩省三關嚴商守禦，乃爾耽延時日。太廟奉先，肅修備舉，諸臣分任功次，俟到日議酬。”
禮部右侍郎曹學疏陳駕駐延津，所有關切四事：一浚延河堤防，一汰隨征冗役，一通福京米船，一事例銀兩許以生鐵準債。帝嘉納之。
諭戶部侍郎梁應奇曰：“覽爾所陳祛衙蠹、清隱匿、革火耗、禁牌票、去飛詭、除陪稅六事，皆去其害足以裕國者。著逐款力行，遍為嚴飭。有踵前弊者，監司守令府佐立行糾參，以副委任至意。”
上遊巡撫吳聞禮糾內臣戴照貪婪蔑法。帝命輔臣黃鳴複先行提問後奏。
命兵部多給獎功釋罪榜文，星馳軍前宣布。
敕順德知縣蔡楠曰：“順德係東粵巨邑，地方多故，亟當軫恤民隱，加意撫綏。況履殘酷之後，倍宜施恩者乎？惠良興治，以俟報績。”
禮科給事龔善選進大勢攸歸疏，有曰：“楚留辰州，蜀留遵義，江留贛州、南安，浙留金華、溫州。信天意之有歸，人心之有待者乎？”帝然之。
嘉興起義舊塚臣徐石麟殉難死，其子爾穀疏稱先臣起義獨先，殉難獨苦。帝傷悼之，官爾穀為中書。敕再從厚加恤，與同難侯峒曾一體。
禮部主事吳巒請首克南昌，選鋒銳進，最為上策。倘舍此他圖，關門一有**，全閩震驚矣。往虔非時，且人力舟車俱有未便。帝然之。諭餉部侍郎李長倩曰：“大師飛挽方亟，中興事業尤仗轉輸。該部一力擔承，以副倚畀至意。”
江督萬元吉、禦史黃賡疏請再召滇黔兵馬，以圖恢複。帝曰：“東南隻此幅員，生民隻此膏血。不難於調兵，難於措餉。雖土司官兵忠義勇敢，必先議餉銀出於何處，然後召兵不難也。”
工部左侍郎葛寅亮疏言務去飾治繁文，必收近取實局。帝目為“老成格言，朕當書銘座右”。
敕督輔蘇觀生曰：“自卿行後，朕擬即幸虔州，以慰傒待。奈閩、浙士民戀戀難釋，不得不少為遲留，安此赤子。迎駕各兵，卿暫令其並力齊心，克複湖東。清道之功，與扈蹕等。至措餉艱難，卿所久知。切戒以兵無擾民，勇必堪戰，勿致虛耗糧糗。湖西正在戰守，著於梁應奇餉內發三萬兩接濟。”
鄭芝龍於泉州建寺，名曰報恩。帝賜名敕建報恩禪寺，僧官贍田，俱如議遴選置買，以永梵修。
江南布衣翟翠疏進直言。帝曰：“此疏於古今得失之局，亦有所窺。至規切朕躬處，言言藥石，誠可嘉尚。準隨便候對。”
諭兵部侍郎於華玉曰：“朕痛兩京繼覆，止因兵民扛恨，致危宗社。今日僅有彈丸，資此民生，以期恢複一統。若複傷民，即促國脈。卿宜仰體朕意，實令民安。新兵嘩噪擾民，乃未經節製者，卿當亟振刷陋規，毋徒憂畏讒謗。”
諭戶部曰：“納貢事例，原非得已。大縣量準四名，中縣三名，小縣二名，不得濫收，事平即止。”
時清師逼湖東，亂民逃竄。有致恨於政令不一者。帝敕揭重熙與輔臣傅冠同事，何三省與督臣湯來賀同事，誠恐權任太分，翻多掣肘，號令重出，莫知適從也。
衢、廣警報狎至。禦史鄭耀星疏陳諸臣虛聲多，實際少。帝深以為然，曰：“爾既知之，自當力挽之，毋僅托空談可也。”
諭兵部尚書呂大器曰：“卿所言用人太濫，所用之人又轉相援引，虐民叢盜。望治何由？所見甚是。朕自今當急省改。”
諭輔臣曰：“朕為天下臣民之主，未能拯救蒼生，心實惻然。況可令官兵肆虐，小民受害乎？聞沿途閻兵搶掠終日，所議招撫，是為何用？還著該督撫各官申嚴約束，毋得任其驕縱害民。”
禦史朱盛濃疏請實行訓練兵卒。帝曰：“兵宜練，必練心，練膽，練力，練氣，練忠義，方成勁旅。不可徒放炮呐喊，如兒戲故態。著申飭行。”
太仆寺少卿淩超疏稱急舉、實做、密察三言及謹慎二字，與以浙人辦浙事，用奇用正，時至機動等語。帝曰：“覽爾疏，俱有成算於胸中。吾久不見淩生矣，著即召對。”
山西道禦史林蘭友疏陳仙城釀亂激變、賊黨聚眾焚劫事。帝曰：“仙邑壬午之寇，由邑令殘酷，署官貪黷。豈惟仙邑，古今天下之亂，那一非守令不肖所致？據奏李芳馨之豎旗，群盜之響應，禍始於無良胥役，縣官豈能無罪？除縣官有無贓跡實際別議外，今當先拿猾胥，以服潢池之心；次部署官兵，以為戡剿之用。”
王謂首輔何吾騶曰：“文章之氣，可銷甲兵，多士奮庸，務收俊。朕念福京士子，亟宜賓醮，茲定期六月開科，鎖闈三試。徹棘放榜，不許遊移一日。監臨照兩京舊製，定用禦史兩員，提調則布政司，監試則按察司。一應科場事宜，即於五月杪報竣，不許苟簡滋玩。分考官務用甲科。推知不足，即就甲科中行官禮聘。其江西、浙江、湖廣及各省來試者，跋涉可念，著地方官給與文書路引，以禦盤詰。現在流寓的，就赴福京督學考選。一應赴京恩歲貢，照舊例著禮部考選。”
時三衢告急。兵部司務徐心箴疏陳三可惜四可憂。帝目其切中時弊。
大學士曾櫻薦同鄉劉逵堪為禦史。帝曰：“禦史為朝廷法官，若不清勤激切，何以明目達聰？從來巡方積弊積玩，朕所親見。這所舉用劉逵，堪巡粵左，即著允行。”
五月一日，清師圍廣信。諸軍先後潰散。江撫劉廣胤退避雩都，援兵益不敢前，廣信遂陷。
兵部主事徐州彥疏陳間關入蜀、宣布皇恩、目擊情形等事，臚列督輔撫按在事諸臣王應熊、樊一蘅、李乾德、馬象乾、米壽圖、劉鱗長、王芝瑞、萬年策、鄭逢元、劉泌、範文光、牟道行、田華國、曾英、曹勳、莫宗文、楊展、賈登聯、譚詣等戮力殘疆，奉揚威命。帝曰：“川蜀頻年苦寇，民不聊生。聞諸臣提挈讚襄，朕心甚喜。州彥克盡使職，著即前來複命。”
諭靖夷侯方國安曰：“卿威望績勞為江上諸帥之冠，至矢心奉戴，忠誠無二，朕尤鑒孚。卿無可間之嫌，朕豈聽讒之主？中外大小諸臣須同心一德，乃能辦敵。切勿妄分彼此，使敵人聞之得計。卿其曉示將士，善體朕意。”
方國安奏富、德、源三縣大捷，斬獲甚眾，由鎮臣方元科竭力支撐，傅明德、田勝、塗有聲協助。帝大悅。
初九日，廷試貢生。敕禮部各察正身年貌，嚴核混冒懷挾等弊，以作人文，上隆治典。
廣西桂林等府州進賀監國登極表四十六道。王念其路遠遲延，不罪。
黃斌卿疏陳：“古今多一精忠，中興少一名相”。帝覽奏曰：“輔臣道周精忠大節，就義從容，真足感動天人，爭光日月。朕方恢中興大業，而一代純臣先殉國難。撫念今昔，倍為愴懷。翁龍楠現在何處？著該部再行察訪，務得實信回奏，以憑從優恤錄。其毛玄水四員，並與察恤。”
禁地方官官買。曰：“府州縣之行戶，實地方害民之惡政。官之稍有良心者，尚以官價買之，比市價十去五六；全無良心者，直票取如寄。胥吏緣之，奸孔百出。朕昔潛邸，久知此弊。宜行永革。”
帝謂群臣曰：“輔臣道周，委身殉難，其子子中備述之，鎮臣黃斌卿亦有此奏。讀絕命詩有‘支天千古事、失語一朝人’之句，朕亦不覺泣數行下。恤典著於五日內察例具奏。其子子中年俱幼稚，更可憐憫。準給銀二十兩以助書資。”
賜吏科給事朱作楫旌廉天字銀牌二麵，曰：“作楫以羈旅之臣，直言受知。身處掖垣，能卻暮金，真濁世之靈光也。”
帝曰：“天氣炎蒸，輕犯豈宜淹禁？軍徒以下，準俱保釋，以迓天和。”
福京監察禦史王孫蕃、韓元勳疏陳減篇恤士，推一時之恩。惟是二書三經，不若三書二經為合式。其題目仍照七篇俱出，二場亦然。庶鐫之試錄，傳之天下後世，皆信為不刊之章程，興朝之盛美也。帝準如議行。
監軍兵部主事黃師正進督師史可法遺表。帝曰：“可法名重山河，光爭日月。至今兒童走卒，鹹知其名。方當擊節渡江，速圖恢複，乃為強鎮力阻，奸黨橫行，竟齎誌以歿也。惜哉！讀遺表，令人憤恨。應得贈恤祭葬易名未盡事宜，行在該部即從詳議具奏聞。其母妻猶陷寇穴，一子未知存亡。作何獲尋，黃師正多方圖之。”
時瀘溪危急，揭重熙參督輔傅冠身任督師，日午未起，未嚐至關上一步，人言嘖嘖。帝怒其有負委托，準以原銜歸裏。
帝謂諸輔臣曰：“臨民之官，豈可以銀而得？朕於閩、浙近地，凡有捐餉至二三千而求為知縣者，朕斷不允。蓋為生民計，不可不周。況撫戢凋殘，有所未便耶？”
複諭首輔何吾騶曰：“朕在延多日，漫雲兼顧江、浙，終於江、浙何補？不如實實出關，拿定一件做去，尚為得力。且今地方止有閩、廣、江、楚，四省咽喉，全在一虔，彼所必爭，我所必守。今不自出，負祖負民，朕之存亡，猶其小者。今還要催林谘兵並陳天榜兵到，決意初一日必行。”
贈諸生翟翰林院待詔。，江南人，雅以複仇雪恥自負。聞監國登極，匍匐入閩。建言諫諍，不遺餘力。帝特官之，不受。至是病故。禦史錢邦芑為陳其本末。帝憐其才，贈以是官，並賜銀二十兩為葬資。邦芑為繳還之。帝曰：“朕視忠臣，過於骨肉。一臣之亡，即少一助。翟賜金著與製一碑碣，不必繳進”。仍賜四語，俾勒於石，曰：“生既盡君臣之義，死亦凜夷夏之防，名稱大明正士，實關天地綱常。”錢邦芑等奉行。
禮部繳進貴州試錄二十冊。
初，有曲周縣生員韓雄都者，與帝遇於淮揚，頗有獻納。繼乃與路振飛等起義太湖，同副總兵王羽、參將王奮武、中書路澤溥、澤淳、舉人楊廷樞等同仇敵愾，大挫敵鋒。至是，雄都入閩。帝稱為佳士，超拜兵部職方司主事。
帝聞江督萬元吉死守贛州，特加樞銜；江撫劉廣胤退避雩都，著革職聽勘。
諭吏部驗封司員外曹元芳曰：“東南為朕一人故，三遭寇虐。覽奏如恫在躬。義師所在雲集，乘其怨而激勵之，因其勢而利導之，真恢剿一大機。元芳為國仇家難驚心，慷慨請纓，具見忠孝。但勇往難，往而有濟更難也。”
鄭芝龍疏陳孤臣督輔黃道周矢誌盡忠。帝特贈道周文明伯，諡忠烈，祭葬即照伯爵例行。妻封一品夫人，四子長為錦衣衛，世襲指揮；次為錦衣衛，世襲正千戶；三子著任行在尚寶寺丞；四子任中書舍人。仍敕有司一立廟於本鄉，名曰報忠，一立廟於福京，名曰憫忠，春秋致祭。並與立坊於家，篆額曰中興藎輔。其遺詩即立碑於廟門。
特議加福京鄉試解額三十名，以示龍興首善、廣開薪槱至意。
督輔楊廷麟疏陳虔事危在旦夕，援兵半已潰亡。帝曰：“吉州失守，督臣萬元吉諸兵皆付一擲，撫臣劉廣胤先出雩都，副總陳丹、張琮、李源氵符五月一日失機。成何法紀？此番功罪宜明，卿即詳悉入奏。惟虛惟公，勿僭勿。見在收拾殘敗，亦即中興根本。粵兵狼兵三萬餘人準卿召募，但作何招集，作何約束，必先議定。近日地方苦兵尤甚於賊，經過不慎，號令不嚴，驅虎進狼，綠林四起，豈必寇作戎首哉？包象乾、張家玉兵，卿還嚴諭，不得收聚凶徒，終成潰散。朕十日內一定親蹕汀州，麵議方略。”
諭吏部尚書郭維經曰：“官員賢否，關民生之榮悴，切宗社之安危。若吏部有滿堂清官，天下必少呻吟百姓。朕於此選，至虛至公，力拔其尤而後已焉。”
又謂兵部試司務蔣平階曰：“覽爾奏，多發人所未發。如一官五月而更易數人，一人數日而更三命，百裏而督撫並設，巡方與中使並差，皆害政之大者。至謂疑人複留用，募兵不問餉，有聽言之名而未收其用，去鋪張而存實意，相天下機而務持重，皆切要語。朕所嘉尚焉。”
吏部尚書郭維經疏列三吳起義死難土紳。各贈官有差：葛麟贈兵部郎中，錢振先贈參政，顧贈兵部主事，王日如贈兵部員外，馮翥贈副使，錢圭贈參政，王有容贈僉事，麻三衡贈國子監學正，淩宏煥、張明光、謝球俱贈訓導。
大田縣貢士樂英進《冊府元龜》一部。
琉球世子遣官航海入賀，並貢方物。
鎮臣黃蜚一家殉難。予祭葬，並行原籍建坊旌表。
敕鄭芝龍撥兵遣將守江山，壯衢聲勢，未可卸遠調之擔，自撤藩籬。時海師議久不成。朝廷兵餉尚缺。禮部侍郎曹學謂恢複之策，舟師直搗金陵，或可冀其萬一。故罄竭家貲及鹽本諸項，勉成一萬以濟之。
左都禦史張肯堂疏薦崔芝善於用海，有船五十餘號，有兵二千餘名，乞釋罪圖功，置臣標下。帝曰：“前楊耿糾其募賊入港，因發兵捕剿。卿既信其無他，即準隨卿前進。定限夏至前到，以便卿乘風吉行。崔芝俟再立功，即與掛印”。
翰林院檢討何九雲進家藏書四百八十四種，計三千五百本，令弟九祿齎投。帝曰：“朕性喜圖書，所進者縑緗殊富，著即收進。內有重的，仍發與九祿領回。九祿著任國子監學正，以示酬勞。”
四川參政劉鱗長疏稱恢複重、夔二府三州二十三縣，以川餉贍川兵，不敢虛糜破冒。帝嘉其不避艱危，盡抒方略，忠勞懋著。特升太仆寺少卿，俾其前來陛見供職。
時有訛言駕回天興者，帝聞之怒，曰：“朕以進戰自誓，豈有複回之理？誰為此言以惑亂耳目？即應立刻察明斬首，以警其餘。”
行人司瞿昶疏陳楚、滇、蜀、黔事情。楚在一事權，專任使，預敕重臣以待南昌、荊、襄之複，即遣大將以鎮之。蜀在結將士，收民心，用蜀人辦蜀事。搖黃則剿撫並用，獻賊則殲厥渠魁。滇、黔則在外援鄰邦，內顧門戶。但近日勳臣土司議論未定。其地近蜀之遵永、楚之接界，平溪、銅仁，俱宜防援。種種皆扼要實著。帝嘉納之。
帝謂近臣曰：“信撫五易而得周損，今又說損不可用。才能試而後見。俟到任後不效，另議未晚。信乎！用人之難也。”
禮部擬會試，定用十月，移催各省各府。
有恩貢生陳元綸赴廷試，進所著《豳風保治全書》、《五經涉錄》各一部。敕諭留覽，以啟所學。
六月，以楊鶚總督偏沅。何騰蛟因進敕印一齊交付疏。帝諭之曰：“卿宣勞江漢，功在社稷。複楚恢豫，長驅燕代，業以全擔付卿。楊鶚之推升，因彼時未審輿圖，偶為錯舉。豈有一柄兩操之事？今中樞需人，業召鶚入佐矣。朕與卿分則君臣，誼同父子，何不因疑奏明，遂為是舉？且將在外，君命有所不受。尚惟始終一心，力任危地，以必見孝陵、必葬威宗為任。朕與卿當共勉之。”後有兩奉君命出江，百念回思顧楚之疏，中有“願為愚，不願為智，不敢棄，不忍棄，不能以兩年死掙之城棄之他人之手”雲雲。帝始欣然曰：“閫外之事，悉以賴卿。惟有早開雲台以待。”
帝命翰林院新選萃士萬荊等十二名，隨庶吉士後，入閣拜先師。複敕翰林院官時其教習，毋得作輟。其服色比庶常，而冠袍角帶焉。後兵部主事萬曰吉劾其非製，且有贗鼎見售之疏。帝曰：“拔士於貢中，作養人材，事關特典。名為萃士，原不同於庶吉士，毋得慷慨不平，暗行詆誹。”