1848年剛剛拉開序幕，就預示著這是非同尋常的一年。1月，國王病重，安徒生接到通知，帶上創作的小說和童話，給國王朗誦。國王似乎很受鼓舞，輕鬆活潑地和安徒生交談，分別時，國王對安徒生說：“我們很快就會見麵的。”然而，這成了他們的永別。國王的病一天比一天惡化，1月20日10點15分，國王去世，全國陷入悲痛之中。繼承人王太子斐德烈七世宣誓，將繼續執行“他親愛的父親”所提出的治國安民的方略，安徒生也被任命為“治安委員會成員之一”。然而，1848年的丹麥在歐洲大革命的風暴影響下，已經不那麽太平了，戰爭陰雲密布。
1月28日，新國王根據自由派的要求公布了新憲法。新憲法首要解決的是丹麥當時混亂不堪的民族問題。按照自由派的主張，霍爾施坦公國可以獲得某些獨立性，而在丹麥和德國居民雜居的什列斯維希地區，必須劃為丹麥的一個省。霍爾施坦公國和什列斯維希公國以埃德爾河為界，長久以來有著緊密聯係。因而，丹麥的自由派喊出了“丹麥以埃德爾河為界”的口號，但遭到兩個公國的一致反對，不僅反對把兩個曆史上有密切聯係的地區分割開來，而且希望能有各自的憲法。兩個公國派出代表，向丹麥上書，發表他們的主張。國王如果答應他們的要求，就意味著丹麥要永久地失去什列斯維希，這是根本行不通的。國王別無選擇，拒絕了兩個公國的要求。兩個公國的王公決定訴諸武力，組織了一支7000人的起義軍，於是戰爭爆發了。因為在丹麥人眼裏，兩個公國的起義無疑是暴亂，不得人心，很快就被“平息”了。然而，對這兩個公國懷有野心的還有普魯士，就在起義軍大敗之時，普魯士國王派出一支救援軍隊，打敗了丹麥軍隊；這時，有歐洲憲兵之稱的沙皇俄國不答應了，尼古拉一世反對普魯士國王支持起義者去反對一個合法的君主，出兵支持丹麥，最終，普魯士和丹麥簽訂了和約。戰爭結束了，但霍爾施坦和什列斯維希地區的民族問題仍然沒有得到解決。
這場戰爭的爆發，把安徒生帶入了非常尷尬的境地。一方麵，作為丹麥人，安徒生有他的愛國心，他當然希望丹麥能勝利；另一方麵，安徒生對德國有著美好的印象，他多次到德國旅行，在他最低沉的時候，是德國給他安慰，他在德國有很多朋友，他不願意因為戰爭而失去朋友。因此，安徒生對丹麥與德國間越來越明顯突出的矛盾，感到非常痛苦。他在給友人的信中寫道：“我感到萬分難過的是，由於彼此隔膜，優秀的人物之間竟然互相仇視。”
有一位叫赫姆尼茨的德國詩人，將自己的一首詩送給安徒生作紀念，但詩人在這首詩中號召霍爾施坦和什列斯維希地區的人們“更加緊密地團結起來”，安徒生接受著這個詩人的禮品，並不認為有什麽不妥，但卻受到很多人的指責，說安徒生不愛國，不關心國家大事。然而，安徒生就是想逃避現實，也不由他的意誌而轉移。一位政府官員找到安徒生，希望他能通過自己在國外的名氣與影響，在國外的報刊發表文章來宣傳丹麥的政策。安徒生也覺得自己有這個責任，於是就給英國《文學雜誌》的主編傑丹先生寫了一封信，如實報道丹麥國內的情況以及自己的主張。《文學雜誌》立即發表了這封信：
親愛的朋友，自從上次給你寫信以來隻過了幾個星期，然而在這段時間裏發生了一係列的事件，好像過了好多年似的。政治從來不是我的事，詩人有另一種使命，可是現在當動亂震撼著各國，從而幾乎不可能麻木不仁地站在地上的時候，我們就必須談論政治了。你知道丹麥的局勢是多麽嚴重，我們麵臨著戰爭啊！不過這是一場要由全體受鼓舞的丹麥人民進行下去的戰爭，在這場戰爭中，被正義的事業喚起的出身高貴的人和農民都誌願加入戰鬥隊伍；整個丹麥民族熱情洋溢，被愛國主義所激發。霍爾施坦—什列斯維希地區的地方領導者，多年來通過德國報紙把我們介紹給誠實的德國人民的那種虛偽觀點；諾埃爾親王所持的那種態度，說什麽丹麥國王不自由，他為王室利益而行事，因而占領了倫茨堡——這一切都刺激了丹麥人，人民已團結得像一個人一樣奮起了，一切日常生活小事都讓位於偉大、高尚的事業。一切都在動，但秩序井然。各個階層的捐款不拘形式的源源而來，連窮工匠和女仆都捐上他們的一份……
在表達自己不得不卷入政治的同時，安徒生又生動描寫了丹麥人民為戰爭付出財物，甚至自己的生命，但這並不表明安徒生主張用戰爭來解決問題。他在給柯林的信中寫道：“我多麽希望戰爭盡快地結束，多麽想看到人們可以自由的生活，致力於統一、友誼啊！諺語說：‘戰爭開出的花朵是美麗的，但結出的果實卻是苦的。’而我卻認為，戰爭根本不會開出什麽花朵來。”在給H.C.奧爾斯特茲的信中，安徒生在讚揚士兵們勇敢殺敵的犧牲精神後，憂鬱地寫道：“但願這是最後一次交戰，可是我們不知道今後究竟怎樣，還有多少寶貴的生命可能犧牲。上帝啊！願真理還成為真理吧！願和平的光輝再次照耀我們的國土吧！”在給《北方電訊報》的《1848年瑞典人在菲英島》一文中，安徒生對瑞典軍隊與菲英島居民關係中出現的新景象歡欣鼓舞，興奮地寫道：
近來，特別是在大學城的年輕人中間建立起來的相互尊重、友誼和融洽的氣氛，如今由於瑞典人在菲英島的停留，把這氣氛帶給了幾千名他們自己的人。菲英島或瑞典的農民怎麽知道他們相互維持的這種近親關係呢？盡管敵對時代的記憶猶在，可現在那友好的諒解建立起來，這種諒解是和平的藥草，也是惟一帶來幸福的東西……願北方各民族相互理解、尊重和愛護，願這種團結、愛護的精神永遠翱翔在各國的上空吧！
為著回應對“安徒生不是一個真正的丹麥愛國詩人”的指責，安徒生寫了一首題為《丹麥，我的祖國！》的愛國詩，經作曲家席爾貝克為之譜曲，家喻戶曉，被譽為丹麥的第二國歌。
丹麥，我的祖國！
丹麥，我出生的地方，那裏是我的故鄉，
我在那兒生根，開始人生的旅程。
丹麥語啊！你是我母親的語言啊，
既溫柔又清麗，撫慰我的心胸。
潔淨的丹麥海岸邊，
古代貴族的墳墓，
長臥於蘋果園和啤酒花田之間。
我愛丹麥，你是我的祖國！
你是我出生的國家，我的故鄉。
我在這裏生根，開始我的人生。
丹麥的語言是母親的溫柔呼喚，
就像是甜美的音符溢滿我的胸懷。
潔淨的丹麥海岸邊，
野生的天鵠來此築巢，
心靈的故鄉安息著，
那綠色島嶼組成的國家。
我所愛的——丹麥，我的祖國。
安徒生的愛國心不僅通過他的**文字表達出來，還體現在他的日常行動中。丹麥一直流傳著這樣一則“愛國謝友”的故事——安徒生和德國的奧古斯登堡是最要好的老朋友。1848年普魯士發動侵入丹麥的戰爭時，奧古斯登堡加入其中，這引起了安徒生的極大憤怒。四年後的1852年，安徒生再次到德國去旅行。許多德國朋友都湧到車站去迎接他。一位朋友對安徒生說：
“奧古斯登堡公爵夫婦在家裏等您，希望您去和他們會見。”
“我不願去見他們，奧古斯登堡參加了四年前普魯士侵略丹麥的戰爭，我怎麽能去看這樣的人呢？”安徒生憤怒地說著。
從此，兩位老朋友斷交了。