湘軍先驅者江忠源的族弟江忠義，在1863年東奔西跑，體嚐了一番族兄生前為清廷當救火隊員的滋味。
陳金剛的起義軍在年初占據廣東的高州，廣東清軍將領卓興率部攻打，久攻不克。代理兩廣總督晏端書於4月下旬命令江忠義率部南下赴援。
江忠義率部出發，前鋒已經抵達桂林，又接到曾國藩的命令，要他率部增援安徽。江忠義立刻北上。
5月下旬，江忠義從衡州出發，前往江西，此後轉戰江西各地。
與此同時，石達開部屬李複猷的部隊在貴州的遵義出發，開始了輾轉走向湖南的行軍。
李複猷部從遵義向桐梓推進，恰遇代理雲貴總督勞崇光在上任途中。雙方在綏陽相遇，勞崇光進入旺草寨召集鄉團迎擊，又派飛馬送信，命令沈宏富和樊希棣等將領率領兩千人渡河攔截。田興恕率領一千人隨後趕到，兩下合擊，重創李複猷的部隊，斬殺和俘虜五千多人。
勞崇光向清廷報捷，在奏疏中說，太平軍現在駐紮在南坪，與正安和務川交界，勢將進入四川。田興恕此前奉旨去四川聽候差遣，現在應該令他到成都聽駱秉章調配。清廷的答複是：由於教案未結，田興恕不能去四川。
清廷知道沈宏富與田興恕關係密切，暗中派人監視他。沈宏富頗有看破紅塵的想法，便以槍傷複發為由請辭，回到鳳凰老家，五年後真的因槍傷複發而去世。
新任湖南巡撫惲世臨命令周洪印和戈鑒領兵增援貴州。惲世臨仍不放過往事，上奏請將陸傳應從貴州調到長沙，核查厘稅收入，要追究到底。
惲世臨的為官之道，世人褒貶不一。他懲處不法官員，固然嚴厲，但他的眼睛隻盯著那些跟他有過節的官員，對他稍有得罪，決不放過，有挾私報複之嫌。例如他給十多名道府官員羅致飲酒賭博的罪名，這些人都曾與他不和。他還往往對涉案人員透露案情，說他已經掌握了對方的罪證，示意犯罪嫌疑人自行引退。
毛鴻賓還記恨文格，便向清廷彈劾，將他罷官。但他仍然要依靠湘軍，帶領湘軍將領張運蘭、楊安臣和劉德謙與他同行。
石讚清擔任湖南的布政使，按照新任巡撫的意思行事，吏治是否清廉，引來許多非議。然而惲世臨為人謹慎，對人的好惡都明說出來，又有些士大夫對他大為稱道。
不過，湖南巡撫仍然倚重郭崑燾，讓他和當年的左宗棠一樣，出謀劃策，調兵遣將。
再說李複猷的部隊，在到達務川之後，果然如勞崇光所料，又返回四川，於8月下旬從四川酉陽和秀山之間的小路進入貴州鬆桃，清廷同知劉侶鶴領兵追蹤到湖南邊界。
李複猷部於9月下旬進入湖南永綏，仍然擁有三四萬兵力，向辰州和沅州運動，湖南調集各路軍馬防備。湖南已經沒有名將，惲世臨不熟悉軍務，隻能處理公文，發布告示。
李複猷進入會同，殺死知縣鄧爾昌，攻占綏寧，分兵奔向道州，遭到湘軍陳士傑部的抵抗。太平軍潰散，奔向江華，進入廣西。
另一支部隊打敗靖州的駐防軍，南下襲擊通道和廣西的龍勝，於10月下旬折向東北方，奔向湖南的城步。
還有一支部隊，從龍勝以西的鬥江進入懷遠，廣西巡撫張凱嵩命令蕭榮芳率部阻擊。
李複猷的部隊攻打富川與賀縣，前鋒進入廣東開建。廣東清軍集結在肇慶和高州兩地，無法迅速趕來阻截，總督毛鴻賓又調湖南的湘軍南下廣東連山，以防起義軍向東進軍。
李複猷另有一支部隊占據廣東懷集的石塋和坑尾，樹立木柵，屯放糧食，做好了打持久戰的準備。該處靠近陽山，毛鴻賓調張運蘭的部隊駐紮連州，以防李複猷部攻擊陽山。
開建的太平軍折入廣西境內，奔向蒼梧，然後又回頭開進廣東，進入懷集。代理懷集知縣況逢春率領兵勇跟蹤追擊。起義軍又奔向連山，襲擊陽山。
況逢春派使者前去勸降，李複猷派弟弟李複忠來到況逢春營中商談條件，仍在猶豫之中，但部屬已解散了很多。
況逢春率部發起猛攻，李複忠率部奔向開泰，繞到貴州黎平以南的永從。
11月下旬，張運蘭率部抵達連州與陽山之間的寨崗和石塋，太平軍知道已無力抵抗，便向湘軍請降。湘軍將向日鼎等三十多名太平軍首領處死，接收三千多名官兵投降，全部遣散。在鐵坑俘虜李複猷，用囚車送到廣州梟首處死。
湖南巡撫上奏報捷，令毛鴻賓大為不滿。惲世臨本來是靠著毛鴻賓升官的，現在為了報功，也顧不得得罪毛鴻賓了。
與此同時，惲世臨派出湘軍增援貴州黎平。
到此為止，石達開部太平軍已完全瓦解。