自從湘軍橫掃安徽境內長江沿線的各個城市，最終逼近天京以來，太平軍想了種種辦法牽製湘軍的兵力。其中最有效的辦法，莫過於西進安徽，抄到湘軍後方，重演1855年從安徽西進湖北，從東西兩頭擠壓湘軍的戰略。
上年年底，李秀成和李世賢援救天京沒有成效，大批太平軍進入安徽，一部分渡到江北，西攻安徽腹地，另一部分則在安徽東南部攻城略地。
但是，太平軍在攻擊安徽的同時，還必須照顧蘇常、鬆滬和浙江。天京的太平軍，已經被湘軍截斷了長江上的通道，也就斷絕了從西邊獲得補給的可能。李秀成經營蘇常和鬆滬，李世賢經營浙江，都是為了從天京以南獲得補給。這兩個地方如此重要，太平軍不得不以重兵來與李鴻章和左宗棠的部隊爭奪。因此，他們隻能派遣有限的兵力到安徽作戰。
不過，湘軍在安徽的兵力也不雄厚，既要駐守淮河流域的城市，又要轉戰安徽南部。因此，在1863年，湘軍與太平軍在安徽和江西戰場多處交戰，並在安徽東南部反複絞殺。
1月8日，楊嶽斌的水師在三汊河攻擊太平軍，連戰連捷。
劉連捷率部循江西上，聯合毛有銘的部隊，進駐石澗埠。鮑超也在寧國打敗太平軍，湘軍的聲勢再次振作。
1月16日，楊嶽斌水師聯合羅逢元的部隊，在護駕墩打敗太平軍，燒毀太平軍兩百多隻小艇。鮑超在馬頭鎮楊柳鋪接連打敗太平軍。
1月23日，太平軍攻占青陽。
1月28日，彭玉麟和蕭慶衍攻克運漕鎮。
2月9日，蕭慶衍在銅城閘打敗太平軍。
2月12日，朱品隆攻克太平軍在二十天前占領的青陽。
2月下旬，賴文鴻等太平軍將領率領六七萬人占據大坑黃村，於2月21日包圍涇縣，湘軍守將易開俊和吳廷華登上城牆，指揮部隊擊退太平軍的進攻。
2月22日，鮑超率部從高祖山疾馳九十裏，進入涇縣，於2月23日出城攻擊，大敗太平軍，追逐二十裏。
2月24日，鮑超回師高祖山。太平軍趁虛襲擊鮑超的軍營，一見霆字軍旗，自己人互相嚇唬：“鮑超來啦！”於是一哄而散。
3月19日，王可升率部攻打寧國的太平軍，燒毀小淮窯的壁壘。鮑超和劉鬆山分別攻打梅嶺和廟埠的太平軍營壘，全部攻破。
太平軍從池州出兵攻擊休寧，分兵襲擊江西建德，西攻彭澤和鄱陽，向東繞過池州，包圍青陽。丁義方率湘軍水師前往救援，迫使太平軍撤圍。清廷將丁義方以總兵記名。
江北的太平軍從和州與巢湖攻打石澗駐軍毛有銘和劉連捷的軍營。從3月21日到3月25日，圍攻日益急迫。撚軍在湖北攻擊蘄水。
4月2日，太平軍攻打太平駐軍朱洪章部，朱洪章戰敗。南北岸同時告急，都寫信調鮑超的部隊赴援。鮑超不知應該增援何處，便先向石澗推進。還沒到達，太平軍已經撤圍而去，襲擊無為、舒城、桐城、廬江和六安，然後返回。
4月12日，從浙江增援安徽的劉典所部，聯合徽防將領唐義訓，在徽州城東抵抗黃文金的部隊。劉典派黃少春率部奪取岩寺太平軍軍營，追趕太平軍，在潛口獲勝，進駐漁亭。於是黃文金率部西進江西，王德榜回師浮梁。
黃文金分兵襲擊鄱陽、浮梁和都昌，都被左宗棠的部隊和江西駐防軍擊退。黃文金率部西進湖口，占據鄱陽湖東岸的文橋、梧桐嶺和太平關。太平軍駐紮在建德和鄱陽之間，向東可以攻擊景德鎮，向西北可以到達湖口和東流。席寶田和邊曉棠率領精毅營推進到撫州，又向饒州推進。劉典率部從徽州趕來，總領各路軍馬。段起、王德榜、王沐、韓進春和席寶田等將領率部攻打陶渡的太平軍軍營，大獲全勝。
4月下旬，曾國荃派彭毓橘所部增援石澗，彭玉麟率領水師跟進，太平軍失敗逃遁。
5月6日，太平軍攻擊廬江，被吳長慶的部隊擊退。5月8日，太平軍攻擊舒城，被蔣凝學的部隊擊退。5月10日，太平軍包圍六安，曾國藩命令鮑超從廬江增援，劉連捷、彭毓橘和毛有銘從無為增援。鮑超的部隊快要趕到舒城時，太平軍又撤圍而去。
5月24日，劉連捷會同水師曾泗美的部隊攻克東關。5月27日，蕭慶衍和彭玉麟的部隊攻克銅城閘。
6月4日，易開俊的部隊在涇縣的章家渡打敗太平軍，朱品隆在青陽打敗太平軍。6月8日，劉連捷和蕭慶衍的部隊，聯合鮑超所部，攻克巢縣，又於6月10日攻克含山，於6月11日攻克和州。
到此為止，安徽北部的太平軍全部撤走，安徽南部的太平軍也進入衰落期。
6月下旬，李榕奉曾國藩之命，率部從彭澤西移，到湖口的三裏街紮營。江忠義率部從九江東渡鄱陽湖，駐紮堅山，逼近黃文金的部隊。
李榕的新軍抵抗太平軍不利，太平軍攻打堅山，江忠義出兵攻擊，擊傷黃文金。
7月16日，韓進春輕率出兵，遭遇太平軍埋伏，戰敗撤退。太平軍又開始活動，奔赴湖口發起攻擊。
8月1日，浙江清軍王文瑞部攻克黟縣。8月9日，曾國藩把寧國駐防軍何紹采部和水師炮船調去增援臨淮，派蔣凝學等將領率部防守潁州和霍邱。
8月上旬，在江西北部，黃文金的部隊從文橋出兵，攻擊江忠義在堅山的軍營，被江忠義的部隊擊退。黃文金身中槍傷，閉壘不出。
8月13日，江忠義會同浙江援軍劉典、席寶田、顧雲采和屈蟠所部，在青山擊敗太平軍，斬殺兩千人。屈蟠的部隊又在段家洲出擊獲勝。
8月16日夜間，江忠義從堅山俯瞰文橋的七座太平軍壁壘，發現火光熒熒，綿延不斷，知道太平軍將要撤走，便約李榕在黎明時合力攻擊。太平軍沒想到湘軍會殺來，全部潰散。湘軍隻來得及毀掉三座壁壘，便趁勢追趕。追到建德時，太平軍有大部隊前來增援，鏖戰一陣，湘軍又將援軍擊退。