湘軍解決了金積堡的戰鬥，金順和張曜又率部攻克了王家疃。寧夏府城周邊通貴與同昌的各路回民軍都向黃鼎投降。
崔三和禹得彥等人聽說金積堡已經投降，便從涼州和西寧南返河州。河州回民軍首領馬占鼇等人也約李德昌趕赴河州商議安撫。
左宗棠剛剛把陳林等人的部屬安置在化平川，增設化平通判都司治理。於是平涼以北和寧夏以南，回民軍和綠林軍的餘部都被搜捕幹淨。
河州的回民軍於3月份東進通渭，分兵東擊秦安和清水。張仲春率部在廖家莊攔截，將回民軍擊敗。楊世俊在任當川擊敗回民軍。另一支回民軍南下階州，即今武都，代理知州洪惟善派部隊跟蹤追擊，這支回民軍大半逸散。
左宗棠於4月份命令劉明燈率部進入通渭以西的馬營，向西照顧安定。又令徐文秀率部進駐安定東北麵一百多裏處的會寧，修治蘭州道，以利於轉運物資，並在會寧以東的靜寧儲備軍火，徐圖進取。
鹽茶和固原的山內，仍然藏龍臥虎。左宗棠令魏光燾和周紹濂派兵前往搜捕，斬殺和捕獲不少造反者。
李輝武所部再次在東南部的兩當擊敗回民軍。楊世俊和張仲春所部在兩當以西的禮縣擊敗回民軍。李華所部在通渭和會寧之間擊敗回民軍。回民軍餘部已不成軍。
清廷下旨，催促左宗棠進軍河州。左宗棠認為，洮河如同黃河一般水流湍急，如果從狄道、隴西和安定進兵，都必須造船架橋，很難立即辦到。而且距離莊稼收獲期尚遠，前麵沒有可以供應的糧食，現在進軍，不是穩妥的辦法。
這時金順和張曜所部攻克了納家寨，殲滅了黃河以西的回民軍精銳。投降的回民都被安置在靈州，寧夏已無戰事。
清廷下詔，任命金順為烏裏雅蘇台將軍，命令張曜所部分別扼守平羅以北的磴口，以及寧夏府城以東三十多裏處的橫城，阻擊並攻擊已經進入阿拉善的綠林軍。
洪惟善於5月份在階州打敗了綹軍，周開錫於6月份病逝。左宗棠命令陳湜率部先趕到靜寧督運糧食。這時浮橋渡船已經造成，新糧粗備，左宗棠便命令各部進兵河州。
劉錦棠護衛著叔叔劉鬆山的棺柩南歸，由蕭章開暫時統領他的部隊。